LCOV - code coverage report
Current view: top level - imageanalysis/ImageAnalysis - ImageMetaDataBase.tcc (source / functions) Hit Total Coverage
Test: casa_coverage.info Lines: 0 337 0.0 %
Date: 2023-10-25 08:47:59 Functions: 0 14 0.0 %

          Line data    Source code
       1             : //# Copyright (C) 2009
       2             : //# Associated Universities, Inc. Washington DC, USA.
       3             : //#
       4             : //# This library is free software; you can redistribute it and/or modify it
       5             : //# under the terms of the GNU Library General Public License as published by
       6             : //# the Free Software Foundation; either version 2 of the License, or (at your
       7             : //# option) any later version.
       8             : //#
       9             : //# This library is distributed in the hope that it will be useful, but WITHOUT
      10             : //# ANY WARRANTY; without even the implied warranty of MERCHANTABILITY or
      11             : //# FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU Library General Public
      12             : //# License for more details.
      13             : //#
      14             : //# You should have received a copy of the GNU Library General Public License
      15             : //# along with this library; if not, write to the Free Software Foundation,
      16             : //# Inc., 675 Massachusetts Ave, Cambridge, MA 02139, USA.
      17             : //#
      18             : //# Correspondence concerning AIPS++ should be addressed as follows:
      19             : //#        Internet email: aips2-request@nrao.edu.
      20             : //#        Postal address: AIPS++ Project Office
      21             : //#                        National Radio Astronomy Observatory
      22             : //#                        520 Edgemont Road
      23             : //#                        Charlottesville, VA 22903-2475 USA
      24             : //#
      25             : 
      26             : #ifndef IMAGEANALYSIS_IMAGEMETADATABASE_TCC
      27             : #define IMAGEANALYSIS_IMAGEMETADATABASE_TCC
      28             : 
      29             : #include <imageanalysis/ImageAnalysis/ImageMetaDataBase.h>
      30             : 
      31             : #include <casacore/casa/aips.h>
      32             : 
      33             : #include <casacore/casa/Arrays/ArrayLogical.h>
      34             : #include <casacore/casa/Containers/ValueHolder.h>
      35             : #include <casacore/casa/Quanta/QuantumHolder.h>
      36             : #include <casacore/casa/Utilities/DataType.h>
      37             : #include <casacore/images/Images/ImageSummary.h>
      38             : #include <casacore/images/Images/ImageStatistics.h>
      39             : #include <casacore/measures/Measures/MeasureHolder.h>
      40             : #include <casacore/casa/Utilities/Regex.h>
      41             : 
      42             : #include <iostream>
      43             : #include <iomanip>
      44             : 
      45             : #define _ORIGINB LogOrigin("ImageMetaDataBase", __func__, WHERE)
      46             : 
      47             : using namespace std;
      48             : 
      49             : using namespace casacore;
      50             : 
      51             : namespace casa {
      52             : 
      53           0 : template <class T> ImageMetaDataBase<T>::ImageMetaDataBase(SPCIIT image)
      54           0 :     : _image(image), _log(), _shape() {
      55           0 :     ThrowIf(! _image, "image cannot be NULL");
      56           0 :     _shape = _image->shape();
      57           0 : }
      58             : 
      59           0 : template <class T> Record ImageMetaDataBase<T>::_makeHeader() const {
      60           0 :     Record header;
      61           0 :     header.define(ImageMetaDataConstants::_IMTYPE, _getImType());
      62           0 :     header.define(ImageMetaDataConstants::_OBJECT, _getObject());
      63           0 :     const auto& csys = _getCoords();
      64             : 
      65           0 :     if (csys.hasDirectionCoordinate()) {
      66           0 :         const DirectionCoordinate& dc = csys.directionCoordinate();
      67           0 :         String equinox = MDirection::showType(
      68             :                 dc.directionType()
      69             :         );
      70           0 :         header.define(ImageMetaDataConstants::_EQUINOX, _getEquinox());
      71           0 :         header.define(ImageMetaDataConstants::_PROJECTION, _getProjection());
      72             :     }
      73           0 :     header.define(ImageMetaDataConstants::_OBSDATE, _getEpochString());
      74           0 :     header.define(ImageMetaDataConstants::MASKS, _getMasks());
      75           0 :     header.define(ImageMetaDataConstants::_OBSERVER, _getObserver());
      76           0 :     header.define(ImageMetaDataConstants::_SHAPE, _getShape().asVector());
      77           0 :     header.define(ImageMetaDataConstants::_TELESCOPE, _getTelescope());
      78           0 :     header.define(ImageMetaDataConstants::_BUNIT, _getBrightnessUnit());
      79           0 :     if (csys.hasSpectralAxis()) {
      80           0 :         const SpectralCoordinate& sc = csys.spectralCoordinate();
      81           0 :         header.define(ImageMetaDataConstants::_RESTFREQ, sc.restFrequencies());
      82           0 :         header.define(
      83             :             ImageMetaDataConstants::_REFFREQTYPE , _getRefFreqType()
      84             :         );
      85             :     }
      86           0 :     const auto& info = _getInfo();
      87           0 :     if (info.hasSingleBeam()) {
      88           0 :         GaussianBeam beam = _getBeam();
      89           0 :         header.defineRecord(
      90             :             ImageMetaDataConstants::_BEAMMAJOR,
      91           0 :             QuantumHolder(beam.getMajor()).toRecord()
      92             :         );
      93           0 :         header.defineRecord(
      94             :             ImageMetaDataConstants::_BEAMMINOR,
      95           0 :             QuantumHolder(beam.getMinor()).toRecord()
      96             :         );
      97           0 :         header.defineRecord(
      98             :             ImageMetaDataConstants::_BEAMPA,
      99             :             QuantumHolder(beam.getPA(true)).toRecord()
     100             :         );
     101             :     }
     102           0 :     else if (info.hasMultipleBeams()) {
     103           0 :         String error;
     104           0 :         Record rec;
     105           0 :         info.toRecord(error, rec);
     106           0 :         static const String recName = "perplanebeams";
     107           0 :         Record beamRec = rec.asRecord(recName);
     108           0 :         beamRec.defineRecord(
     109           0 :             "median area beam", info.getBeamSet().getMedianAreaBeam().toRecord()
     110             :         );
     111           0 :         header.defineRecord(recName, beamRec);
     112             :     }
     113           0 :     auto cdelt = _getIncrements();
     114           0 :     auto units = _getAxisUnits();
     115           0 :     auto crpix = _getRefPixel();
     116           0 :     auto crval = _getRefValue();
     117           0 :     auto types = _getAxisNames();
     118           0 :     header.merge(_getStatistics());
     119           0 :     for (uInt i=0; i<cdelt.size(); ++i) {
     120           0 :         auto iString = String::toString(i + 1);
     121           0 :         auto delt = ImageMetaDataConstants::_CDELT + iString;
     122           0 :         header.define(delt, cdelt[i].getValue());
     123           0 :         auto unit = ImageMetaDataConstants::_CUNIT + iString;
     124           0 :         header.define(unit, units[i]);
     125           0 :         auto pix = ImageMetaDataConstants::_CRPIX + iString;
     126           0 :         header.define(pix, crpix[i]);
     127           0 :         auto val = ImageMetaDataConstants::_CRVAL + iString;
     128           0 :         header.define(val, crval[i].getValue());
     129           0 :         auto type = ImageMetaDataConstants::_CTYPE + iString;
     130           0 :         header.define(type, types[i]);
     131             :     }
     132           0 :     return header;
     133             : }
     134             : 
     135             : template <class T> const TableRecord ImageMetaDataBase<T>::_miscInfo() const {
     136             :     return _image->miscInfo();
     137             : }
     138             : 
     139           0 : template <class T> CoordinateSystem ImageMetaDataBase<T>::coordsys(
     140             :     const std::vector<Int>& pixelAxes
     141             : ) const {
     142             :     // Recover CoordinateSytem into a Record
     143           0 :     auto cSys = _getCoords();
     144           0 :     if (pixelAxes.empty()) {
     145           0 :         return cSys;
     146             :     }
     147           0 :     Record rec;
     148           0 :     CoordinateSystem cSys2;
     149             :     // Fish out the coordinate of the desired axes
     150           0 :     uInt j = 0;
     151           0 :     const Int nPixelAxes = cSys.nPixelAxes();
     152           0 :     Vector<uInt> coordinates(cSys.nCoordinates(), uInt(0));
     153             :     Int coord, axisInCoord;
     154           0 :     for (const auto& axis: pixelAxes) {
     155           0 :         ThrowIf (
     156             :             axis < 0 || axis >= nPixelAxes,
     157             :             "Specified zero-based pixel axis " + String::toString(axis)
     158             :             + " is not a valid pixel axis"
     159             :         );
     160           0 :         cSys.findPixelAxis(coord, axisInCoord, uInt(axis));
     161           0 :         ThrowIf(
     162             :             coord < 0,
     163             :             "Zero-based pixel axis " + String::toString(axis)
     164             :             + " has been removed"
     165             :         );
     166           0 :         coordinates(coord)++;
     167             :         // Copy desired coordinate (once)
     168           0 :         if (coordinates(coord) == 1) {
     169           0 :             cSys2.addCoordinate(cSys.coordinate(coord));
     170             :         }
     171             :     }
     172             :     // Find mapping.  Says where world axis i in cSys is in cSys2
     173           0 :     Vector<Int> worldAxisMap, worldAxisTranspose;
     174           0 :     Vector<Bool> refChange;
     175           0 :     ThrowIf(
     176             :         ! cSys2.worldMap(worldAxisMap, worldAxisTranspose, refChange, cSys),
     177             :         "Error finding world map because " + cSys2.errorMessage()
     178             :     );
     179             :     // Generate list of world axes to keep
     180           0 :     Vector<Int> keepList(cSys.nWorldAxes());
     181           0 :     Vector<Double> worldReplace;
     182           0 :     j = 0;
     183           0 :     for (const auto& axis: pixelAxes) {
     184           0 :         if (axis >= 0 && axis < nPixelAxes) {
     185           0 :             Int worldAxis = cSys.pixelAxisToWorldAxis(uInt(axis));
     186           0 :             ThrowIf(
     187             :                 worldAxis < 0,
     188             :                 "World axis corresponding to zero-based pixel axis "
     189             :                 + String::toString(axis) + " has been removed"
     190             :             );
     191           0 :             keepList(j++) = worldAxisMap(worldAxis);
     192             :         }
     193             :     }
     194             :     // Remove unwanted world (and pixel) axes.  Better would be to just
     195             :     // remove the pixel axes and leave the world axes there...
     196           0 :     if (j > 0) {
     197           0 :         keepList.resize(j, true);
     198           0 :         CoordinateUtil::removeAxes(cSys2, worldReplace, keepList, false);
     199             :     }
     200             :     // Copy the ObsInfo
     201           0 :     cSys2.setObsInfo(cSys.obsInfo());
     202           0 :     return cSys2;
     203             : }
     204             : 
     205             : template <class T> DataType ImageMetaDataBase<T>::dataType() const {
     206             :     return _image->dataType();
     207             : }
     208             : 
     209             : template <class T> Record* ImageMetaDataBase<T>::getBoundingBox(
     210             :     const Record& region
     211             : ) const {
     212             :     const auto& csys = _getCoords();
     213             :     const auto shape = _getShape();
     214             :     const unique_ptr<ImageRegion> pRegion(
     215             :         ImageRegion::fromRecord(
     216             :             nullptr, csys, shape, region
     217             :         )
     218             :     );
     219             :     LatticeRegion latRegion = pRegion->toLatticeRegion(
     220             :         csys, shape
     221             :     );
     222             :     Slicer sl = latRegion.slicer();
     223             :     IPosition blc(sl.start());
     224             :     IPosition trc(sl.end());
     225             :     IPosition inc(sl.stride());
     226             :     IPosition length(sl.length());
     227             :     std::unique_ptr<Record> outRec(new Record());
     228             :     outRec->define("blc", blc.asVector());
     229             :     outRec->define("trc", trc.asVector());
     230             :     outRec->define("inc", inc.asVector());
     231             :     outRec->define("bbShape", (trc - blc + 1).asVector());
     232             :     outRec->define("regionShape", length.asVector());
     233             :     outRec->define("imageShape", shape.asVector());
     234             :     outRec->define("blcf", CoordinateUtil::formatCoordinate(blc, csys)); // 0-rel for use in C++
     235             :     outRec->define("trcf", CoordinateUtil::formatCoordinate(trc, csys));
     236             :     return outRec.release();
     237             : }
     238             : 
     239             : template <class T> ValueHolder ImageMetaDataBase<T>::getFITSValue(const String& key) const {
     240             :     String c = key;
     241             :     c.downcase();
     242             :     const TableRecord info = _miscInfo();
     243             :     if (c == ImageMetaDataConstants::_BUNIT) {
     244             :         return ValueHolder(_getBrightnessUnit());
     245             :     }
     246             :     else if (
     247             :         c.startsWith(ImageMetaDataConstants::_CDELT) || c.startsWith(ImageMetaDataConstants::_CRPIX)
     248             :         || c.startsWith(ImageMetaDataConstants::_CRVAL) || c.startsWith(ImageMetaDataConstants::_CTYPE)
     249             :         || c.startsWith(ImageMetaDataConstants::_CUNIT)
     250             :     ) {
     251             :         String prefix = c.substr(0, 5);
     252             :         uInt n = _getAxisNumber(c);
     253             :         if (prefix == ImageMetaDataConstants::_CDELT) {
     254             :             return ValueHolder(
     255             :                 QuantumHolder(
     256             :                     _getIncrements()[n-1]
     257             :                 ).toRecord()
     258             :             );
     259             :         }
     260             :         else if (prefix == ImageMetaDataConstants::_CRPIX) {
     261             :             return ValueHolder(_getRefPixel()[n-1]);
     262             :         }
     263             :         else if (prefix == ImageMetaDataConstants::_CRVAL) {
     264             :             if (_getCoords().polarizationAxisNumber(false) == (Int)(n-1)) {
     265             :                 return ValueHolder(
     266             :                     _getStokes()
     267             :                 );
     268             :             }
     269             :             else {
     270             :                 return ValueHolder(
     271             :                     QuantumHolder(_getRefValue()[n-1]).toRecord()
     272             :                 );
     273             :             }
     274             :         }
     275             :         else if (prefix == ImageMetaDataConstants::_CTYPE) {
     276             :             return ValueHolder(_getAxisNames()[n-1]);
     277             :         }
     278             :         else if (prefix == ImageMetaDataConstants::_CUNIT) {
     279             :             return ValueHolder(_getAxisUnits()[n-1]);
     280             :         }
     281             :     }
     282             :     else if (c == ImageMetaDataConstants::_EQUINOX) {
     283             :         return ValueHolder(_getEquinox());
     284             :     }
     285             :     else if (c == ImageMetaDataConstants::_IMTYPE) {
     286             :         return ValueHolder(_getImType());
     287             :     }
     288             :     else if (c == ImageMetaDataConstants::MASKS) {
     289             :         return ValueHolder(_getMasks());
     290             :     }
     291             :     else if (c == ImageMetaDataConstants::_OBJECT) {
     292             :         return ValueHolder(_getObject());
     293             :     }
     294             :     else if (c == ImageMetaDataConstants::_OBSDATE || c == ImageMetaDataConstants::_EPOCH) {
     295             :         return ValueHolder(_getEpochString());
     296             :     }
     297             :     else if (c == ImageMetaDataConstants::_OBSERVER) {
     298             :         return ValueHolder(_getObserver());
     299             :     }
     300             :     else if (c == ImageMetaDataConstants::_PROJECTION) {
     301             :         return ValueHolder(_getProjection());
     302             :     }
     303             :     else if (c == ImageMetaDataConstants::_REFFREQTYPE) {
     304             :         return ValueHolder(_getRefFreqType());
     305             :     }
     306             :     else if (c == ImageMetaDataConstants::_RESTFREQ) {
     307             :         return ValueHolder(
     308             :             QuantumHolder(_getRestFrequency()).toRecord()
     309             :         );
     310             :     }
     311             :     else if (c == ImageMetaDataConstants::_SHAPE) {
     312             :         return ValueHolder(_getShape().asVector());
     313             :     }
     314             :     else if (c == ImageMetaDataConstants::_TELESCOPE) {
     315             :         return ValueHolder(_getTelescope());
     316             :     }
     317             :     else if (
     318             :         c == ImageMetaDataConstants::_BEAMMAJOR || c == ImageMetaDataConstants::_BEAMMINOR || c == ImageMetaDataConstants::_BEAMPA
     319             :         || c == ImageMetaDataConstants::_BMAJ || c == ImageMetaDataConstants::_BMIN || c == ImageMetaDataConstants::_BPA
     320             :     ) {
     321             :         GaussianBeam beam = _getBeam();
     322             :         if (c == ImageMetaDataConstants::_BEAMMAJOR || c == ImageMetaDataConstants::_BMAJ) {
     323             :             return ValueHolder(QuantumHolder(beam.getMajor()).toRecord());
     324             :         }
     325             :         else if (c == ImageMetaDataConstants::_BEAMMINOR || c == ImageMetaDataConstants::_BMIN) {
     326             :             return ValueHolder(QuantumHolder(beam.getMinor()).toRecord());
     327             :         }
     328             :         else {
     329             :             return ValueHolder(QuantumHolder(beam.getPA()).toRecord());
     330             :         }
     331             :     }
     332             :     else if (
     333             :         c == ImageMetaDataConstants::_DATAMIN || c == ImageMetaDataConstants::_DATAMAX || c == ImageMetaDataConstants::_MINPIXPOS
     334             :         || c == ImageMetaDataConstants::_MINPOS || c == ImageMetaDataConstants::_MAXPIXPOS || c == ImageMetaDataConstants::_MAXPOS
     335             :     ) {
     336             :         Record x = _getStatistics();
     337             :         if (c == ImageMetaDataConstants::_DATAMIN || c == ImageMetaDataConstants::_DATAMAX) {
     338             :             auto dt = dataType();
     339             :             if (dt == TpFloat) {
     340             :                 Float val;
     341             :                 x.get(c, val);
     342             :                 return ValueHolder(val);
     343             :             }
     344             :             else if (dt == TpComplex) {
     345             :                 Complex val;
     346             :                 x.get(c, val);
     347             :                 return ValueHolder(val);
     348             :             }
     349             :             else if (dt == TpDouble) {
     350             :                 Double val;
     351             :                 x.get(c, val);
     352             :                 return ValueHolder(val);
     353             :             }
     354             :             else if (dt == TpDComplex) {
     355             :                 DComplex val;
     356             :                 x.get(c, val);
     357             :                 return ValueHolder(val);
     358             :             }
     359             :             else {
     360             :                 ThrowCc("Logic error");
     361             :             }
     362             :         }
     363             :         else if (c == ImageMetaDataConstants::_MINPOS || c == ImageMetaDataConstants::_MAXPOS) {
     364             :             return ValueHolder(x.asString(c));
     365             :         }
     366             :         else if (c == ImageMetaDataConstants::_MINPIXPOS || c == ImageMetaDataConstants::_MAXPIXPOS) {
     367             :             return ValueHolder(x.asArrayInt(c));
     368             :         }
     369             :     }
     370             :     else if (
     371             :         info.isDefined(key)    || info.isDefined(c)
     372             :     ) {
     373             :         String x = info.isDefined(key) ? key : c;
     374             :         switch (info.type(info.fieldNumber(x))) {
     375             :         case TpString:
     376             :             return ValueHolder(info.asString(x));
     377             :             break;
     378             :         case TpInt:
     379             :             return ValueHolder(info.asInt(x));
     380             :             break;
     381             :         case TpDouble:
     382             :             return ValueHolder(info.asDouble(x));
     383             :             break;
     384             :         case TpRecord:
     385             :             // allow fall through
     386             :         case TpQuantity: {
     387             :             return ValueHolder(info.asRecord(x));
     388             :             break;
     389             :         }
     390             :         default:
     391             :             ostringstream os;
     392             :             os << info.type(info.fieldNumber(x));
     393             :             ThrowCc(
     394             :                 "Unhandled data type "
     395             :                 + os.str()
     396             :                 + " for user defined type. Send us a bug report"
     397             :             );
     398             :         }
     399             :     }
     400             :     ThrowCc(
     401             :         "Unknown keyword " + key + ". If you are trying to use a key name from "
     402             :         "the imhead summary dictionary, note that some keys in "
     403             :         "mode='put'/'get' are different from mode='summary'. Please see imhead "
     404             :         "description in the CASA online documentation for complete details."
     405             :     );
     406             :     return ValueHolder();
     407             : }
     408             : 
     409             : template <class T> uInt ImageMetaDataBase<T>::_ndim() const {
     410             :     return _image->ndim();
     411             : }
     412             : 
     413             : template <class T> uInt ImageMetaDataBase<T>::_getAxisNumber(
     414             :     const String& key
     415             : ) const {
     416             :     uInt n = 0;
     417             :     string sre = key.substr(0, 5) + "[0-9]+";
     418             :     Regex myre(Regex::makeCaseInsensitive(sre));
     419             :     if (key.find(myre) != String::npos) {
     420             :         n = String::toInt(key.substr(5));
     421             :         uInt ndim = _ndim();
     422             :         ThrowIf(
     423             :             n == 0,
     424             :             "The FITS convention is that axes "
     425             :             "are 1-based. Therefore, " + key + " is not a valid "
     426             :             "FITS keyword specification"
     427             :         );
     428             :         ThrowIf(
     429             :             n > ndim,
     430             :             "This image only has " + String::toString(ndim)
     431             :             + " axes."
     432             :         );
     433             :     }
     434             :     else {
     435             :         ThrowCc("Unsupported key " + key);
     436             :     }
     437             :     return n;
     438             : }
     439             : 
     440           0 : template <class T> String ImageMetaDataBase<T>::_getEpochString() const {
     441           0 :     return MVTime(_getObsDate().getValue()).string(MVTime::YMD, 12);
     442             : }
     443             : 
     444           0 : template <class T> IPosition ImageMetaDataBase<T>::_getShape() const {
     445           0 :     if (_shape.empty()) {
     446           0 :         _shape = _image->shape();
     447             :     }
     448           0 :     return _shape;
     449             : }
     450             : 
     451           0 : template <class T> void ImageMetaDataBase<T>::_fieldToLog(
     452             :     const Record& header,const String& field, Int precision
     453             : ) const {
     454           0 :     _log << "        -- " << field << ": ";
     455           0 :     if (header.isDefined(field)) {
     456           0 :         DataType type = header.type(header.idToNumber(field));
     457           0 :         if (precision >= 0) {
     458           0 :             _log.output() << setprecision(precision);
     459             :         }
     460           0 :         switch (type) {
     461           0 :             case TpArrayDouble: {
     462           0 :                 _log << header.asArrayDouble(field);
     463           0 :                 break;
     464             :             }
     465           0 :             case TpArrayInt: {
     466           0 :                 _log << header.asArrayInt(field);
     467           0 :                 break;
     468             :             }
     469           0 :             case TpArrayString: {
     470           0 :                 _log << header.asArrayString(field);
     471           0 :                 break;
     472             :             }
     473           0 :             case TpDouble: {
     474           0 :                 _log << header.asDouble(field);
     475           0 :                 break;
     476             :             }
     477           0 :             case TpRecord: {
     478           0 :                 Record r = header.asRecord(field);
     479           0 :                 QuantumHolder qh;
     480           0 :                 String error;
     481           0 :                 if (qh.fromRecord(error, r) && qh.isQuantity()) {
     482           0 :                     Quantity q = qh.asQuantity();
     483           0 :                     _log << q.getValue() << q.getUnit();
     484             :                 }
     485             :                 else {
     486           0 :                     _log << "Logic Error: Don't know how to deal with records of this type "
     487           0 :                         << LogIO::EXCEPTION;
     488             :                 }
     489           0 :                 break;
     490             :             }
     491           0 :             case TpString: {
     492           0 :                 _log << header.asString(field);
     493           0 :                 break;
     494             :             }
     495           0 :             default: {
     496           0 :                 _log << "Logic Error: Unsupported type "
     497           0 :                     << type << LogIO::EXCEPTION;
     498           0 :                 break;
     499             :             }
     500             :         }
     501             :     }
     502             :     else {
     503           0 :         _log << "Not found";
     504             :     }
     505           0 :     _log << LogIO::POST;
     506           0 : }
     507             : 
     508           0 : template <class T> void ImageMetaDataBase<T>::_toLog(const Record& header) const {
     509           0 :     _log << _ORIGINB << "General --" << LogIO::POST;
     510           0 :     _fieldToLog(header, ImageMetaDataConstants::_IMTYPE);
     511           0 :     _fieldToLog(header, ImageMetaDataConstants::_OBJECT);
     512           0 :     _fieldToLog(header, ImageMetaDataConstants::_EQUINOX);
     513           0 :     _fieldToLog(header, ImageMetaDataConstants::_OBSDATE);
     514           0 :     _fieldToLog(header, ImageMetaDataConstants::_OBSERVER);
     515           0 :     _fieldToLog(header, ImageMetaDataConstants::_PROJECTION);
     516           0 :     if (header.isDefined(ImageMetaDataConstants::_RESTFREQ)) {
     517           0 :         _log << "        -- " << ImageMetaDataConstants::_RESTFREQ << ": ";
     518           0 :         _log.output() << std::fixed << std::setprecision(1);
     519           0 :         _log <<  header.asArrayDouble(ImageMetaDataConstants::_RESTFREQ) << LogIO::POST;
     520             :     }
     521           0 :     _fieldToLog(header, ImageMetaDataConstants::_REFFREQTYPE);
     522           0 :     _fieldToLog(header, ImageMetaDataConstants::_TELESCOPE);
     523           0 :     _fieldToLog(header, ImageMetaDataConstants::_BEAMMAJOR, 12);
     524           0 :     _fieldToLog(header, ImageMetaDataConstants::_BEAMMINOR, 12);
     525           0 :     _fieldToLog(header, ImageMetaDataConstants::_BEAMPA, 12);
     526           0 :     _fieldToLog(header, ImageMetaDataConstants::_BUNIT);
     527           0 :     _fieldToLog(header, ImageMetaDataConstants::MASKS);
     528           0 :     _fieldToLog(header, ImageMetaDataConstants::_SHAPE);
     529           0 :     _fieldToLog(header, ImageMetaDataConstants::_DATAMIN);
     530           0 :     _fieldToLog(header, ImageMetaDataConstants::_DATAMAX);
     531           0 :     _fieldToLog(header, ImageMetaDataConstants::_MINPOS);
     532           0 :     _fieldToLog(header, ImageMetaDataConstants::_MINPIXPOS);
     533           0 :     _fieldToLog(header, ImageMetaDataConstants::_MAXPOS);
     534           0 :     _fieldToLog(header, ImageMetaDataConstants::_MAXPIXPOS);
     535             : 
     536           0 :     uInt i = 1;
     537           0 :     _log << LogIO::NORMAL << "axes --" << LogIO::POST;
     538           0 :     while (true) {
     539           0 :         String iString = String::toString(i);
     540           0 :         String key = ImageMetaDataConstants::_CTYPE + iString;
     541           0 :         if (! header.isDefined(key)) {
     542           0 :             break;
     543             :         }
     544           0 :         _log << "        -- " << key << ": "
     545           0 :             << header.asString(key) << LogIO::POST;
     546           0 :         String unit = ImageMetaDataConstants::_CUNIT + iString;
     547           0 :         i++;
     548             :     }
     549           0 :     i = 1;
     550           0 :     _log << LogIO::NORMAL << ImageMetaDataConstants::_CRPIX << " --" << LogIO::POST;
     551           0 :     while (true) {
     552           0 :         String iString = String::toString(i);
     553           0 :         String key = ImageMetaDataConstants::_CRPIX + iString;
     554           0 :         if (! header.isDefined(key)) {
     555           0 :             break;
     556             :         }
     557           0 :         _log.output() << std::fixed << std::setprecision(1);
     558           0 :         _log << "        -- " << key << ": " << header.asDouble(key)
     559           0 :             << LogIO::POST;
     560           0 :         i++;
     561             :     }
     562           0 :     i = 1;
     563           0 :     _log << LogIO::NORMAL << ImageMetaDataConstants::_CRVAL << " --" << LogIO::POST;
     564           0 :     while (true) {
     565           0 :         String iString = String::toString(i);
     566           0 :         String key = ImageMetaDataConstants::_CRVAL + iString;
     567           0 :         if (! header.isDefined(key)) {
     568           0 :             break;
     569             :         }
     570           0 :         _log << "        -- " << key << ": ";
     571           0 :         ostringstream x;
     572           0 :         Double val = header.asDouble(key);
     573           0 :         x << val;
     574           0 :         String unit = ImageMetaDataConstants::_CUNIT + iString;
     575           0 :         if (header.isDefined(unit)) {
     576           0 :             x << header.asString(unit);
     577             :         }
     578           0 :         String valunit = x.str();
     579           0 :         if (header.isDefined(unit)) {
     580           0 :             String myunit = header.asString(unit);
     581           0 :             if (header.asString(unit).empty()) {
     582           0 :                 String ctype = ImageMetaDataConstants::_CTYPE + iString;
     583           0 :                 if (
     584           0 :                     header.isDefined(ctype)
     585           0 :                     && header.asString(ctype) == "Stokes"
     586             :                 ) {
     587           0 :                     valunit = "['" + Stokes::name((Stokes::StokesTypes)((Int)val)) + "']";
     588             :                 }
     589             :             }
     590             :             else {
     591           0 :                 String tmp = _doStandardFormat(val, myunit);
     592           0 :                 if (! tmp.empty()) {
     593           0 :                     valunit = tmp;
     594             :                 }
     595             :             }
     596             :         }
     597           0 :         _log << valunit << LogIO::POST;
     598           0 :         i++;
     599             :     }
     600           0 :     i = 1;
     601           0 :     _log << LogIO::NORMAL << ImageMetaDataConstants::_CDELT << " --" << LogIO::POST;
     602           0 :     while (true) {
     603           0 :         String iString = String::toString(i);
     604           0 :         String key = ImageMetaDataConstants::_CDELT + iString;
     605           0 :         if (! header.isDefined(key)) {
     606           0 :             break;
     607             :         }
     608           0 :         _log << "        -- " << key << ": ";
     609           0 :         Double val = header.asDouble(key);
     610           0 :         String unit = ImageMetaDataConstants::_CUNIT + iString;
     611           0 :         String myunit;
     612           0 :         if (header.isDefined(unit)) {
     613           0 :             myunit = header.asString(unit);
     614             :         }
     615           0 :         ostringstream x;
     616           0 :         x << val << myunit;
     617           0 :         String valunit = x.str();
     618           0 :         if (header.isDefined(unit)) {
     619           0 :             String myunit = header.asString(unit);
     620           0 :             if (! header.asString(unit).empty()) {
     621           0 :                 String tmp = _doStandardFormat(val, myunit);
     622           0 :                 if (! tmp.empty()) {
     623           0 :                     valunit = tmp;
     624             :                 }
     625             :             }
     626             :         }
     627           0 :         _log << valunit << LogIO::POST;
     628           0 :         i++;
     629             :     }
     630           0 :     i = 1;
     631           0 :     _log << LogIO::NORMAL << "units --" << LogIO::POST;
     632           0 :     while (true) {
     633           0 :         String iString = String::toString(i);
     634           0 :         String key = ImageMetaDataConstants::_CUNIT + iString;
     635           0 :         if (! header.isDefined(key)) {
     636           0 :             break;
     637             :         }
     638           0 :         _log << "        -- " << key << ": "
     639           0 :             << header.asString(key) << LogIO::POST;
     640           0 :         String unit = ImageMetaDataConstants::_CUNIT + iString;
     641           0 :         i++;
     642             :     }
     643           0 : }
     644             : 
     645           0 : template <class T> String ImageMetaDataBase<T>::_doStandardFormat(
     646             :     Double value, const String& unit
     647             : ) const {
     648           0 :     String valunit;
     649             :     try {
     650           0 :         Quantity q(1, unit);
     651           0 :         if (q.isConform(Quantity(1, "rad"))) {
     652             :             // to dms
     653           0 :             valunit = MVAngle(Quantity(value, unit)).string(MVAngle::CLEAN, 9) + "deg.min.sec";
     654             :         }
     655           0 :         else if (unit == "Hz") {
     656           0 :             ostringstream x;
     657           0 :             x << std::fixed << std::setprecision(1);
     658           0 :             x << value << "Hz";
     659           0 :             valunit = x.str();
     660             :         }
     661             :     }
     662           0 :     catch (const AipsError& x) {}
     663           0 :     return valunit;
     664             : }
     665             : 
     666           0 : template <class T> uInt ImageMetaDataBase<T>::nChannels() const {
     667           0 :     const CoordinateSystem csys = _getCoords();
     668           0 :     if (! csys.hasSpectralAxis()) {
     669           0 :         return 0;
     670             :     }
     671           0 :     return _getShape()[csys.spectralAxisNumber()];
     672             : }
     673             : 
     674             : template <class T> Bool ImageMetaDataBase<T>::isChannelNumberValid(
     675             :     const uInt chan
     676             : ) const {
     677             :     if (! _getCoords().hasSpectralAxis()) {
     678             :         return false;
     679             :     }
     680             :     return (chan < nChannels());
     681             : }
     682             : 
     683           0 : template <class T> uInt ImageMetaDataBase<T>::nStokes() const {
     684           0 :     const CoordinateSystem& csys = _getCoords();
     685           0 :     if (! csys.hasPolarizationCoordinate()) {
     686           0 :         return 0;
     687             :     }
     688           0 :     return _getShape()[csys.polarizationAxisNumber()];
     689             : }
     690             : 
     691             : template <class T> Int ImageMetaDataBase<T>::stokesPixelNumber(
     692             :     const String& stokesString) const {
     693             :     Int pixNum = _getCoords().stokesPixelNumber(stokesString);
     694             :     if (pixNum >= (Int)nStokes()) {
     695             :         pixNum = -1;
     696             :     }
     697             :     return pixNum;
     698             : }
     699             : 
     700           0 : template <class T> String ImageMetaDataBase<T>::_getProjection() const {
     701           0 :     const CoordinateSystem csys = _getCoords();
     702           0 :     if (! csys.hasDirectionCoordinate()) {
     703           0 :         return "";
     704             :     }
     705           0 :     const DirectionCoordinate dc = csys.directionCoordinate();
     706           0 :     Projection proj = dc.projection();
     707           0 :     if (proj.type() == Projection::SIN) {
     708           0 :         Vector<Double> pars =  proj.parameters();
     709           0 :         if (dc.isNCP()) {
     710           0 :             ostringstream os;
     711           0 :             os << "SIN (" << pars << "): NCP";
     712           0 :             return os.str();
     713             :         }
     714           0 :         else if(pars.size() == 2 && (anyNE(pars, 0.0))) {
     715             :             // modified SIN
     716           0 :             ostringstream os;
     717           0 :             os << "SIN (" << pars << ")";
     718           0 :             return os.str();
     719             :         }
     720             :     }
     721           0 :     return proj.name();
     722             : }
     723             : 
     724             : template <class T> String ImageMetaDataBase<T>::stokesAtPixel(
     725             :     const uInt pixel
     726             : ) const {
     727             :     const CoordinateSystem& csys = _getCoords();
     728             :     if (! csys.hasPolarizationCoordinate() || pixel >= nStokes()) {
     729             :              return "";
     730             :         }
     731             :     return csys.stokesAtPixel(pixel);
     732             : }
     733             : 
     734             : template <class T> Bool ImageMetaDataBase<T>::isStokesValid(
     735             :     const String& stokesString
     736             : ) const {
     737             :     if (! _getCoords().hasPolarizationCoordinate()) {
     738             :         return false;
     739             :     }
     740             :     Int stokesPixNum = stokesPixelNumber(stokesString);
     741             :     return stokesPixNum >= 0 && stokesPixNum < (Int)nStokes();
     742             : }
     743             : 
     744           0 : template <class T> Vector<Int> ImageMetaDataBase<T>::directionShape() const {
     745           0 :     Vector<Int> dirAxesNums = _getCoords().directionAxesNumbers();
     746           0 :     if (dirAxesNums.nelements() == 0) {
     747           0 :         return Vector<Int>();
     748             :     }
     749           0 :     Vector<Int> dirShape(2);
     750           0 :     IPosition shape = _getShape();
     751           0 :     dirShape[0] = shape[dirAxesNums[0]];
     752           0 :     dirShape[1] = shape[dirAxesNums[1]];
     753           0 :     return dirShape;
     754             : }
     755             : 
     756             : template <class T> Bool ImageMetaDataBase<T>::areChannelAndStokesValid(
     757             :     String& message, const uInt chan, const String& stokesString
     758             : ) const {
     759             :     ostringstream os;
     760             :     Bool areValid = true;
     761             :     if (! isChannelNumberValid(chan)) {
     762             :         os << "Zero-based channel number " << chan << " is too large. There are only "
     763             :             << nChannels() << " spectral channels in this image.";
     764             :         areValid = false;
     765             :     }
     766             :     if (! isStokesValid(stokesString)) {
     767             :         if (! areValid) {
     768             :             os << " and ";
     769             :         }
     770             :         os << "Stokes parameter " << stokesString << " is not in image";
     771             :         areValid = false;
     772             :     }
     773             :     if (! areValid) {
     774             :         message = os.str();
     775             :     }
     776             :     return areValid;
     777             : }
     778             : 
     779           0 : template <class T> Record ImageMetaDataBase<T>::_calcStats() const {
     780           0 :     return _calcStatsT(_image);
     781             : }
     782             : 
     783           0 : template <class T> Record ImageMetaDataBase<T>::_calcStatsT(
     784             :         std::shared_ptr<const ImageInterface<T> > image
     785             : ) const {
     786           0 :     Record x;
     787           0 :     if (! isReal(image->dataType())) {
     788             :         // the min and max and associated positions
     789             :         // cannot be calculated for complex images
     790           0 :         return x;
     791             :     }
     792           0 :     ImageStatistics<T> stats(*image);
     793           0 :     Array<typename NumericTraits<T>::PrecisionType> min;
     794           0 :     stats.getStatistic(min, LatticeStatsBase::MIN);
     795           0 :     if (min.size() == 0) {
     796             :         // image is completely masked
     797           0 :         return x;
     798             :     }
     799           0 :     x.define(ImageMetaDataConstants::_DATAMIN, min(IPosition(min.ndim(), 0)));
     800           0 :     Array<typename NumericTraits<T>::PrecisionType> max;
     801           0 :     stats.getStatistic(max, LatticeStatsBase::MAX);
     802           0 :     x.define(ImageMetaDataConstants::_DATAMAX, max(IPosition(max.ndim(), 0)));
     803           0 :     IPosition minPixPos, maxPixPos;
     804           0 :     stats.getMinMaxPos(minPixPos, maxPixPos);
     805           0 :     x.define(ImageMetaDataConstants::_MINPIXPOS, minPixPos.asVector());
     806           0 :     x.define(ImageMetaDataConstants::_MAXPIXPOS, maxPixPos.asVector());
     807           0 :     const auto& csys = _getCoords();
     808           0 :     Vector<Double> minPos = csys.toWorld(minPixPos);
     809           0 :     Vector<Double> maxPos = csys.toWorld(maxPixPos);
     810             : 
     811           0 :     String minFormat, maxFormat;
     812           0 :     uInt ndim = csys.nPixelAxes();
     813           0 :     Int spAxis = csys.spectralAxisNumber();
     814             : 
     815           0 :     for (uInt i=0; i<ndim; i++) {
     816           0 :         Int worldAxis = csys.pixelAxisToWorldAxis(i);
     817           0 :         String foundUnit;
     818           0 :         minFormat += csys.format(
     819             :             foundUnit, Coordinate::DEFAULT,
     820             :             minPos[i], worldAxis
     821             :         );
     822           0 :         maxFormat += csys.format(
     823             :             foundUnit, Coordinate::DEFAULT,
     824             :             maxPos[i], worldAxis
     825             :         );
     826           0 :         if ((Int)i == spAxis) {
     827           0 :             minFormat += foundUnit;
     828           0 :             maxFormat += foundUnit;
     829             :         }
     830           0 :         if (i != ndim-1) {
     831           0 :             minFormat += " ";
     832           0 :             maxFormat += " ";
     833             :         }
     834             :     }
     835           0 :     x.define(ImageMetaDataConstants::_MINPOS, minFormat);
     836           0 :     x.define(ImageMetaDataConstants::_MAXPOS, maxFormat);
     837           0 :     return x;
     838             : }
     839             : 
     840             : template <class T> Record ImageMetaDataBase<T>::toWorld(
     841             :     const Vector<Double>& pixel, const String& format, Bool doVelocity,
     842             :     const String& dirFrame, const String& freqFrame
     843             : ) const {
     844             :     Vector<Double> pixel2 = pixel.copy();
     845             :     auto csys = _getCoords();
     846             :     {
     847             :         Vector<Double> replace = csys.referencePixel();
     848             :         const Int nIn = pixel2.size();
     849             :         const Int nOut = replace.size();
     850             :         Vector<Double> out(nOut);
     851             :         for (Int i = 0; i < nOut; ++i) {
     852             :             if (i > nIn - 1) {
     853             :                 out(i) = replace(i);
     854             :             }
     855             :             else {
     856             :                 out(i) = pixel2(i);
     857             :             }
     858             :         }
     859             :         pixel2.assign(out);
     860             :     }
     861             : 
     862             :     // Convert to world
     863             : 
     864             :     Vector<Double> world;
     865             :     Record rec;
     866             :     String dFrame = dirFrame;
     867             :     dFrame.upcase();
     868             :     String fFrame = freqFrame;
     869             :     fFrame.upcase();
     870             :     MDirection::Types dirType = csys.hasDirectionCoordinate()
     871             :         ? csys.directionCoordinate().directionType(dFrame == "CL")
     872             :         : MDirection::J2000;
     873             :     MFrequency::Types freqType = csys.hasSpectralAxis()
     874             :         ? csys.spectralCoordinate().frequencySystem(fFrame == "CL")
     875             :         : MFrequency::LSRK;
     876             :     if (
     877             :         (! csys.hasDirectionCoordinate() || dFrame == "CL")
     878             :         && (! csys.hasSpectralAxis() || fFrame == "CL")
     879             :     ) {
     880             :         ThrowIf(
     881             :             ! csys.toWorld(world, pixel2, true),
     882             :             "Error converting to world coordinates: " + csys.errorMessage()
     883             :         );
     884             :     }
     885             :     else if (
     886             :         (! csys.hasDirectionCoordinate() || dFrame == "NATIVE")
     887             :         && (! csys.hasSpectralAxis() || fFrame == "NATIVE")
     888             :     ) {
     889             :         ThrowIf(
     890             :             ! csys.toWorld(world, pixel2, false),
     891             :             "Error converting to world coordinates: " + csys.errorMessage()
     892             :         );
     893             :     }
     894             :     else {
     895             :         if (csys.hasDirectionCoordinate() && dFrame != "CL") {
     896             :             if (dFrame == "NATIVE") {
     897             :                 dirType = csys.directionCoordinate().directionType(false);
     898             :             }
     899             :             else {
     900             :                 ThrowIf(
     901             :                     ! MDirection::getType(dirType, dFrame),
     902             :                     "Unknown direction reference frame " + dirFrame
     903             :                 );
     904             :             }
     905             :             auto dirCoord = csys.directionCoordinate();
     906             :             dirCoord.setReferenceConversion(dirType);
     907             :             csys.replaceCoordinate(dirCoord, csys.directionCoordinateNumber());
     908             :         }
     909             :         if (csys.hasSpectralAxis() && fFrame != "CL") {
     910             :             if (fFrame == "NATIVE") {
     911             :                 freqType = csys.spectralCoordinate().frequencySystem(false);
     912             :             }
     913             :             else {
     914             :                 ThrowIf(
     915             :                     ! MFrequency::getType(freqType, fFrame),
     916             :                     "Unknown frequency reference frame " + freqFrame
     917             :                 );
     918             :             }
     919             :             auto specCoord = csys.spectralCoordinate();
     920             :             MFrequency::Types clFrame;
     921             :             MEpoch epoch;
     922             :             MPosition pos;
     923             :             MDirection dir;
     924             :             specCoord.getReferenceConversion(clFrame, epoch, pos, dir);
     925             :             specCoord.setReferenceConversion(freqType, epoch, pos, dir);
     926             :             csys.replaceCoordinate(specCoord, csys.spectralCoordinateNumber());
     927             :         }
     928             :         ThrowIf(
     929             :             ! csys.toWorld(world, pixel2, true),
     930             :             "Error converting to world coordinates: " + csys.errorMessage()
     931             :         );
     932             : 
     933             :     }
     934             :     return _worldVectorToRecord(
     935             :         csys, world, -1, format, true, true,
     936             :         doVelocity, dirType, freqType
     937             :     );
     938             : }
     939             : 
     940             : template <class T> Record ImageMetaDataBase<T>::_worldVectorToRecord(
     941             :     const CoordinateSystem& csys, const Vector<Double>& world, Int c,
     942             :     const String& format, Bool isAbsolute, Bool showAsAbsolute, Bool doVelocity,
     943             :     MDirection::Types dirFrame, MFrequency::Types freqFrame
     944             : ) {
     945             :     // World vector must be in the native units of cSys
     946             :     // c = -1 means world must be length cSys.nWorldAxes
     947             :     // c > 0 means world must be length cSys.coordinate(c).nWorldAxes()
     948             :     // format from 'n,q,s,m'
     949             : 
     950             :     auto ct = upcase(format);
     951             :     Vector<String> units;
     952             :     if (c < 0) {
     953             :         units = csys.worldAxisUnits();
     954             :     }
     955             :     else {
     956             :         units = csys.coordinate(c).worldAxisUnits();
     957             :     }
     958             :     AlwaysAssert(world.size() == units.size(),AipsError);
     959             :     Record rec;
     960             :     if (ct.contains("N")) {
     961             :         rec.define("numeric", world);
     962             :     }
     963             :     if (ct.contains("Q")) {
     964             :         String error;
     965             :         Record recQ1, recQ2;
     966             :         for (uInt i = 0; i < world.size(); ++i) {
     967             :             Quantum<Double> worldQ(world(i), Unit(units(i)));
     968             :             QuantumHolder h(worldQ);
     969             :             ThrowIf(! h.toRecord(error, recQ1), error);
     970             :             recQ2.defineRecord(i, recQ1);
     971             :         }
     972             :         rec.defineRecord("quantity", recQ2);
     973             :     }
     974             :     if (ct.contains("S")) {
     975             :         Vector<Int> worldAxes;
     976             :         if (c < 0) {
     977             :             worldAxes.resize(world.size());
     978             :             indgen(worldAxes);
     979             :         }
     980             :         else {
     981             :             worldAxes = csys.worldAxes(c);
     982             :         }
     983             :         Coordinate::formatType fType = Coordinate::SCIENTIFIC;
     984             :         Int prec = 8;
     985             :         String u;
     986             :         Int coord, axisInCoord;
     987             :         Vector<String> fs(world.nelements());
     988             :         for (uInt i = 0; i < world.size(); ++i) {
     989             :             csys.findWorldAxis(coord, axisInCoord, i);
     990             :             if (
     991             :                 csys.type(coord) == Coordinate::DIRECTION
     992             :                 || csys.type(coord) == Coordinate::STOKES
     993             :             ) {
     994             :                 fType = Coordinate::DEFAULT;
     995             :             }
     996             :             else {
     997             :                 fType = Coordinate::SCIENTIFIC;
     998             :             }
     999             :             u = "";
    1000             :             fs(i) = csys.format(
    1001             :                 u, fType, world(i), worldAxes(i),
    1002             :                 isAbsolute, showAsAbsolute, prec
    1003             :             );
    1004             :             if (! u.empty() && (u != " ")) {
    1005             :                 fs(i) += " " + u;
    1006             :             }
    1007             :         }
    1008             :         rec.define("string", fs);
    1009             :     }
    1010             :     if (ct.contains(String("M"))) {
    1011             :         Record recM = _worldVectorToMeasures(
    1012             :             csys, world, c, isAbsolute, doVelocity,
    1013             :             dirFrame, freqFrame
    1014             :         );
    1015             :         rec.defineRecord("measure", recM);
    1016             :     }
    1017             :     return rec;
    1018             : }
    1019             : 
    1020             : template <class T> Record ImageMetaDataBase<T>::_worldVectorToMeasures(
    1021             :     const CoordinateSystem& csys, const Vector<Double>& world,
    1022             :     Int c, Bool abs, Bool doVelocity, MDirection::Types dirFrame,
    1023             :     MFrequency::Types freqFrame
    1024             : ) {
    1025             :     LogIO log;
    1026             :     log << LogOrigin("ImageMetaDataBase", __func__);
    1027             :     uInt directionCount, spectralCount, linearCount, stokesCount, tabularCount;
    1028             :     directionCount = spectralCount = linearCount = stokesCount = tabularCount
    1029             :             = 0;
    1030             :     // Loop over desired Coordinates
    1031             :     Record rec;
    1032             :     String error;
    1033             :     uInt s, e;
    1034             :     if (c < 0) {
    1035             :         AlwaysAssert(world.nelements()==csys.nWorldAxes(), AipsError);
    1036             :         s = 0;
    1037             :         e = csys.nCoordinates();
    1038             :     }
    1039             :     else {
    1040             :         AlwaysAssert(world.nelements()==csys.coordinate(c).nWorldAxes(), AipsError);
    1041             :         s = c;
    1042             :         e = c + 1;
    1043             :     }
    1044             :     for (uInt i = s; i < e; ++i) {
    1045             :         // Find the world axes in the CoordinateSystem that this coordinate belongs to
    1046             : 
    1047             :         const auto& worldAxes = csys.worldAxes(i);
    1048             :         const auto nWorldAxes = worldAxes.size();
    1049             :         Vector<Double> world2(nWorldAxes);
    1050             :         const auto& coord = csys.coordinate(i);
    1051             :         auto units = coord.worldAxisUnits();
    1052             :         Bool none = true;
    1053             : 
    1054             :         // Fill in missing world axes if all coordinates specified
    1055             : 
    1056             :         if (c < 0) {
    1057             :             for (uInt j = 0; j < nWorldAxes; ++j) {
    1058             :                 if (worldAxes(j) < 0) {
    1059             :                     world2[j] = coord.referenceValue()[j];
    1060             :                 }
    1061             :                 else {
    1062             :                     world2(j) = world(worldAxes[j]);
    1063             :                     none = false;
    1064             :                 }
    1065             :             }
    1066             :         }
    1067             :         else {
    1068             :             world2 = world;
    1069             :             none = false;
    1070             :         }
    1071             :         if (
    1072             :             csys.type(i) == Coordinate::LINEAR
    1073             :             || csys.type(i) == Coordinate::TABULAR
    1074             :         ) {
    1075             :             if (!none) {
    1076             :                 Record linRec1, linRec2;
    1077             :                 for (uInt k = 0; k < world2.size(); ++k) {
    1078             :                     Quantum<Double> value(world2(k), units(k));
    1079             :                     QuantumHolder h(value);
    1080             :                     ThrowIf(
    1081             :                         ! h.toRecord(error, linRec1), error
    1082             :                     );
    1083             :                     linRec2.defineRecord(k, linRec1);
    1084             :                 }
    1085             :                 if (csys.type(i) == Coordinate::LINEAR) {
    1086             :                     rec.defineRecord("linear", linRec2);
    1087             :                 }
    1088             :                 else if (csys.type(i) == Coordinate::TABULAR) {
    1089             :                     rec.defineRecord("tabular", linRec2);
    1090             :                 }
    1091             :             }
    1092             :             if (csys.type(i) == Coordinate::LINEAR) {
    1093             :                 ++linearCount;
    1094             :             }
    1095             :             if (csys.type(i) == Coordinate::TABULAR) {
    1096             :                 ++tabularCount;
    1097             :             }
    1098             :         }
    1099             :         else if (csys.type(i) == Coordinate::DIRECTION) {
    1100             :             ThrowIf(
    1101             :                 ! abs,
    1102             :                 "It is not possible to have a relative MDirection measure"
    1103             :             );
    1104             :             AlwaysAssert(worldAxes.nelements() == 2,AipsError);
    1105             :             if (!none) {
    1106             :                 // Make an MDirection and stick in record
    1107             : 
    1108             :                 Quantum<Double> t1(world2(0), units(0));
    1109             :                 Quantum<Double> t2(world2(1), units(1));
    1110             :                 MDirection direction(
    1111             :                     t1, t2, dirFrame
    1112             :                 );
    1113             :                 MeasureHolder h(direction);
    1114             :                 Record dirRec;
    1115             :                 ThrowIf(
    1116             :                     ! h.toRecord(error, dirRec), error
    1117             :                 );
    1118             :                 rec.defineRecord("direction", dirRec);
    1119             :             }
    1120             :             directionCount++;
    1121             :         }
    1122             :         else if (csys.type(i) == Coordinate::SPECTRAL) {
    1123             :             ThrowIf(
    1124             :                 ! abs,
    1125             :                 "It is not possible to have a relative MFrequency measure"
    1126             :             );
    1127             :             AlwaysAssert(worldAxes.nelements()==1,AipsError);
    1128             :             if (!none) {
    1129             :                 // Make an MFrequency and stick in record
    1130             : 
    1131             :                 Record specRec, specRec1;
    1132             :                 Quantum<Double> t1(world2(0), units(0));
    1133             :                 const auto& sc0 = csys.spectralCoordinate(i);
    1134             :                 MFrequency frequency(t1, freqFrame);
    1135             :                 MeasureHolder h(frequency);
    1136             :                 ThrowIf(
    1137             :                     ! h.toRecord(error, specRec1), error
    1138             :                 );
    1139             :                 specRec.defineRecord("frequency", specRec1);
    1140             :                 if (doVelocity) {
    1141             :                     SpectralCoordinate sc(sc0);
    1142             : 
    1143             :                     // Do velocity conversions and stick in MDOppler
    1144             :                     // Radio
    1145             : 
    1146             :                     sc.setVelocity(String("km/s"), MDoppler::RADIO);
    1147             :                     Quantum<Double> velocity;
    1148             :                     ThrowIf(
    1149             :                         ! sc.frequencyToVelocity(velocity, frequency),
    1150             :                         sc.errorMessage()
    1151             :                     );
    1152             :                     MDoppler v(velocity, MDoppler::RADIO);
    1153             :                     MeasureHolder h(v);
    1154             :                     ThrowIf(
    1155             :                         ! h.toRecord(error, specRec1), error
    1156             :                     );
    1157             :                     specRec.defineRecord("radiovelocity", specRec1);
    1158             :                     // Optical
    1159             : 
    1160             :                     sc.setVelocity(String("km/s"), MDoppler::OPTICAL);
    1161             :                     ThrowIf(
    1162             :                         ! sc.frequencyToVelocity(velocity, frequency),
    1163             :                         sc.errorMessage()
    1164             :                     );
    1165             :                     v = MDoppler(velocity, MDoppler::OPTICAL);
    1166             :                     h = MeasureHolder(v);
    1167             :                     ThrowIf(
    1168             :                         ! h.toRecord(error, specRec1), error
    1169             :                     );
    1170             :                     specRec.defineRecord("opticalvelocity", specRec1);
    1171             : 
    1172             :                     // beta (relativistic/true)
    1173             : 
    1174             :                     sc.setVelocity(String("km/s"), MDoppler::BETA);
    1175             :                     ThrowIf(
    1176             :                         ! sc.frequencyToVelocity(velocity, frequency),
    1177             :                         sc.errorMessage()
    1178             :                     );
    1179             :                     v = MDoppler(velocity, MDoppler::BETA);
    1180             :                     h = MeasureHolder(v);
    1181             :                     ThrowIf(
    1182             :                         ! h.toRecord(error, specRec1), error
    1183             :                     );
    1184             :                     specRec.defineRecord("betavelocity", specRec1);
    1185             :                 }
    1186             :                 rec.defineRecord("spectral", specRec);
    1187             :             }
    1188             :             ++spectralCount;
    1189             :         }
    1190             :         else if (csys.type(i) == Coordinate::STOKES) {
    1191             :             ThrowIf (
    1192             :                 ! abs,
    1193             :                 "It makes no sense to have a relative Stokes measure"
    1194             :             );
    1195             :             AlwaysAssert(worldAxes.size() == 1, AipsError);
    1196             :             if (!none) {
    1197             :                 const auto& coord0 = csys.stokesCoordinate(i);
    1198             :                 StokesCoordinate coord(coord0); // non-const
    1199             :                 String u;
    1200             :                 auto s = coord.format(
    1201             :                     u, Coordinate::DEFAULT, world2(0),
    1202             :                     0, true, true, -1
    1203             :                 );
    1204             :                 rec.define("stokes", s);
    1205             :             }
    1206             :             ++stokesCount;
    1207             :         }
    1208             :         else {
    1209             :             ThrowCc("Cannot handle Coordinates of type " + csys.showType(i));
    1210             :         }
    1211             :     }
    1212             :     if (directionCount > 1) {
    1213             :         log << LogIO::WARN
    1214             :                 << "There was more than one DirectionCoordinate in the "
    1215             :                 << LogIO::POST;
    1216             :         log << LogIO::WARN << "CoordinateSystem.  Only the last one is returned"
    1217             :                 << LogIO::POST;
    1218             :     }
    1219             :     if (spectralCount > 1) {
    1220             :         log << LogIO::WARN
    1221             :                 << "There was more than one SpectralCoordinate in the "
    1222             :                 << LogIO::POST;
    1223             :         log << LogIO::WARN << "CoordinateSystem.  Only the last one is returned"
    1224             :                 << LogIO::POST;
    1225             :     }
    1226             :     if (stokesCount > 1) {
    1227             :         log << LogIO::WARN << "There was more than one StokesCoordinate in the "
    1228             :                 << LogIO::POST;
    1229             :         log << LogIO::WARN << "CoordinateSystem.  Only the last one is returned"
    1230             :                 << LogIO::POST;
    1231             :     }
    1232             :     if (linearCount > 1) {
    1233             :         log << LogIO::WARN << "There was more than one LinearCoordinate in the "
    1234             :                 << LogIO::POST;
    1235             :         log << LogIO::WARN << "CoordinateSystem.  Only the last one is returned"
    1236             :                 << LogIO::POST;
    1237             :     }
    1238             :     if (tabularCount > 1) {
    1239             :         log << LogIO::WARN
    1240             :                 << "There was more than one TabularCoordinate in the "
    1241             :                 << LogIO::POST;
    1242             :         log << LogIO::WARN << "CoordinateSystem.  Only the last one is returned"
    1243             :                 << LogIO::POST;
    1244             :     }
    1245             :     return rec;
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