LCOV - code coverage report
Current view: top level - mstransform/TVI - PolAverageTVI.h (source / functions) Hit Total Coverage
Test: ctest_coverage.info Lines: 18 29 62.1 %
Date: 2023-11-06 10:06:49 Functions: 5 9 55.6 %

          Line data    Source code
       1             : //# PolAverageTVI.h: Transforming VI for polarization averaging
       2             : //# Copyright (C) 1996,1997,1998,1999,2000,2001,2002,2003
       3             : //# Associated Universities, Inc. Washington DC, USA.
       4             : //#
       5             : //# This library is free software; you can redistribute it and/or modify it
       6             : //# under the terms of the GNU Library General Public License as published by
       7             : //# the Free Software Foundation; either version 2 of the License, or (at your
       8             : //# option) any later version.
       9             : //#
      10             : //# This library is distributed in the hope that it will be useful, but WITHOUT
      11             : //# ANY WARRANTY; without even the Implied warranty of MERCHANTABILITY or
      12             : //# FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU Library General Public
      13             : //# License for more details.
      14             : //#
      15             : //# You should have received a copy of the GNU Library General Public License
      16             : //# along with this library; if not, write to the Free Software Foundation,
      17             : //# Inc., 675 Massachusetts Ave, Cambridge, MA 02139, USA.
      18             : //#
      19             : //# Correspondence concerning AIPS++ should be addressed as follows:
      20             : //#        Internet email: aips2-request@nrao.edu.
      21             : //#        Postal address: AIPS++ Project Office
      22             : //#                        National Radio Astronomy Observatory
      23             : //#                        520 Edgemont Road
      24             : //#                        Charlottesville, VA 22903-2475 USA
      25             : //#
      26             : //# $Id: $
      27             : 
      28             : #ifndef _MSVIS_POLAVERAGINGTVI_H_
      29             : #define _MSVIS_POLAVERAGINGTVI_H_
      30             : 
      31             : #include <casacore/casa/aips.h>
      32             : #include <msvis/MSVis/ViImplementation2.h>
      33             : #include <msvis/MSVis/TransformingVi2.h>
      34             : #include <msvis/MSVis/VisibilityIterator2.h>
      35             : 
      36             : #include <map>
      37             : #include <vector>
      38             : 
      39             : #include <casacore/measures/Measures/Stokes.h>
      40             : #include <casacore/casa/Containers/Record.h>
      41             : 
      42             : namespace casa { //# NAMESPACE CASA - BEGIN
      43             : 
      44             : namespace vi { // # NAMESPACE VI - BEGIN
      45             : 
      46             : //# forward decl
      47             : 
      48             : class VisBuffer2;
      49             : 
      50             : class ChannelSelector;
      51             : class ChannelSelectorCache;
      52             : typedef casacore::Vector<casacore::Vector<casacore::Slice> > ChannelSlicer;
      53             : class SpectralWindowChannelsCache;
      54             : class SpectralWindowChannels;
      55             : class SubtableColumns;
      56             : 
      57             : class PolAverageVi2Factory;
      58             : 
      59             : // <summary>
      60             : // PolAverageTVI
      61             : // </summary>
      62             : 
      63             : // <use visibility=export>
      64             : 
      65             : // <reviewed reviewer="" date="yyyy/mm/dd" tests="" demos="">
      66             : // </reviewed>
      67             : 
      68             : // <prerequisite>
      69             : //   <li> <linkto class="MSIter">MSIter</linkto>
      70             : //   <li> <linkto class="casacore::MeasurementSet">casacore::MeasurementSet</linkto>
      71             : //   <li> <linkto class="VisSet">VisSet</linkto>
      72             : // </prerequisite>
      73             : //
      74             : // <etymology>
      75             : // PolAverageTVI
      76             : // </etymology>
      77             : //
      78             : // <synopsis>
      79             : //
      80             : // </synopsis>
      81             : //
      82             : // <example>
      83             : // <code>
      84             : // //
      85             : // </code>
      86             : // </example>
      87             : //
      88             : // <motivation>
      89             : //
      90             : // </motivation>
      91             : //
      92             : // <thrown>
      93             : //    <li>
      94             : //    <li>
      95             : // </thrown>
      96             : //
      97             : // <todo asof="1997/05/30">
      98             : //   <li> cleanup the currently dual interface for visibilities and flags
      99             : //   <li> sort out what to do with weights when interpolating
     100             : // </todo>
     101             : 
     102             : class PolAverageTVI: public TransformingVi2 {
     103             : 
     104             : public:
     105             : 
     106             :   // Destructor
     107             : 
     108             :   virtual ~PolAverageTVI();
     109             : 
     110             :   // Report the the ViImplementation type
     111             :   //  (should be specialized in child classes)
     112           0 :   virtual casacore::String ViiType() const {
     113           0 :     return casacore::String("PolAverage( ") + getVii()->ViiType() + " )";
     114             :   }
     115             : 
     116             :   // Methods to control and monitor subchunk iteration
     117             : 
     118             :   virtual void origin();
     119             :   virtual void next();
     120             : 
     121             :   // Override the following methods to always return Stokes::I
     122             :   virtual void corrType(casacore::Vector<casacore::Int> & corrTypes) const;
     123             :   virtual casacore::Vector<casacore::Int> getCorrelations() const;
     124             :   virtual casacore::Vector<casacore::Stokes::StokesTypes> getCorrelationTypesDefined() const;
     125             :   virtual casacore::Vector<casacore::Stokes::StokesTypes> getCorrelationTypesSelected() const;
     126             : 
     127             :   // Override the number of correlations per shape. This TVI just generates one output shape
     128             :   const casacore::Vector<casacore::Int>& nCorrelationsPerShape() const;
     129             : 
     130             :   // POLARIZATION table will have additional entry nPolarizationIds() should
     131             :   // return original number plus one
     132             :   // NB: nDataDescriptionIds() will not be affected
     133           1 :   virtual casacore::Int nPolarizationIds() const {
     134           1 :     return TransformingVi2::nPolarizationIds() + 1;
     135             :   }
     136             : 
     137             :   // Polarization Id will point to the new row to be added (to the end)
     138           0 :   virtual casacore::Int polarizationId() const {
     139           0 :     return nPolarizationIds() - 1;
     140             :   }
     141             : 
     142             :   // Return row flag
     143             : 
     144             :   virtual void flagRow (casacore::Vector<casacore::Bool> & rowflags) const;
     145             : 
     146             :   // Return flag for each polarization, channel and row
     147             : 
     148             :   virtual void flag(casacore::Cube<casacore::Bool> & flags) const;
     149             : 
     150             :   // Return flag for each channel & row
     151             : 
     152             :   virtual void flag(casacore::Matrix<casacore::Bool> & flags) const;
     153             : 
     154             :   // Return feed configuration matrix for specified antenna
     155             :   // Must fail
     156             :   virtual void jonesC(
     157             :       casacore::Vector<casacore::SquareMatrix<casacore::Complex, 2> > & cjones) const;
     158             : 
     159             :   // Return sigma
     160             : 
     161             :   virtual void sigma(casacore::Matrix<casacore::Float> & sigmat) const;
     162             : 
     163             :   // Return the visibilities as found in the casacore::MS, casacore::Cube (npol,nchan,nrow).
     164             : 
     165             :   virtual void visibilityCorrected(
     166             :   casacore::Cube<casacore::Complex> & vis) const;
     167             :   virtual void visibilityModel(casacore::Cube<casacore::Complex> & vis) const;
     168             :   virtual void visibilityObserved(
     169             :   casacore::Cube<casacore::Complex> & vis) const;
     170             : 
     171             :   // Return FLOAT_DATA as a casacore::Cube (npol, nchan, nrow) if found in the MS.
     172             : 
     173             :   virtual void floatData(casacore::Cube<casacore::Float> & fcube) const;
     174             : 
     175             :   // Return the shape of the visibility Cube
     176             : 
     177             :   virtual casacore::IPosition visibilityShape() const;
     178             : 
     179             :   // Return weight
     180             :   // TODO
     181             : 
     182             :   virtual void weight(casacore::Matrix<casacore::Float> & wtmat) const;
     183             : 
     184             :   // Return weightspectrum (a weight for each channel)
     185             :   // TODO
     186             : 
     187             :   virtual void weightSpectrum(casacore::Cube<casacore::Float> & wtsp) const;
     188             :   virtual void sigmaSpectrum(casacore::Cube<casacore::Float> & wtsp) const;
     189             : 
     190             :   // Return imaging weight (a weight for each channel)
     191             :   // virtual casacore::Matrix<casacore::Float> & imagingWeight (casacore::Matrix<casacore::Float> & wt) const;
     192             : 
     193             :   virtual const VisImagingWeight & getImagingWeightGenerator() const;
     194             : 
     195             : protected:
     196             : 
     197             :   // Constructor
     198             : 
     199             :   PolAverageTVI(ViImplementation2 * inputVi);
     200             : 
     201             :   // transform data (DATA, CORRECTED_DATA, MODEL_DATA, FLOAT_DATA)
     202             :   virtual void transformComplexData(
     203             :   casacore::Cube<casacore::Complex> const &dataIn,
     204             :   casacore::Cube<casacore::Bool> const &flagIn,
     205             :   casacore::Cube<casacore::Complex> &dataOut) const = 0;
     206             :   virtual void transformFloatData(casacore::Cube<casacore::Float> const &dataIn,
     207             :   casacore::Cube<casacore::Bool> const &flagIn,
     208             :   casacore::Cube<casacore::Float> &dataOut) const = 0;
     209             : 
     210             :   // transform weight (WEIGHT, WEIGHT_SPECTRUM)
     211             :   // TODO
     212             :   virtual void transformWeight(casacore::Array<casacore::Float> const &weightIn,
     213             :   casacore::Array<casacore::Float> &weightOut) const = 0;
     214             : 
     215             :   void configureShapes();
     216             : 
     217             :   // Flags (per ms, per data description) whether transformation must be executed or not
     218             :   // condition:
     219             :   //
     220             :   //   1. if polarization type is neither Linear nor Circular, do not transform
     221             :   //   2. if visibility only contain one polarization component, do not transform
     222             :   //   3. if visibility contains cross-polarization (XY, YX, RL, LR), do not
     223             :   //      take into account it
     224             :   //
     225             : //  casacore::Vector<Vector<Bool> > doTransform_;
     226             :   casacore::Vector<casacore::Bool> doTransform_;
     227             : 
     228             :   // List of polarization ids that points either (XX,YY) or (RR,LL)
     229             : //  Vector<Vector<uInt> > polId0;
     230             : //  Vector<Vector<uInt> > polId1;
     231             :   casacore::Vector<casacore::Int> polId0_;casacore::Vector<casacore::Int> polId1_;
     232             : 
     233             :   casacore::Vector<casacore::Int> nCorrelationsPerShape_;
     234             : 
     235             : private:
     236             : 
     237             :   // Properly fill doTransform_, polId0_, and polId1_ based on current MS
     238             :   void configurePolAverage();
     239             : 
     240             :   // Reconfigure if necessary
     241        3712 :   void reconfigurePolAverageIfNecessary() {
     242        3712 :     if (isNewMs()) {
     243         100 :       configurePolAverage();
     244             :     }
     245        3712 :   }
     246             : 
     247             :   // warn if current dd is inappropriate for polarization averaging
     248             :   void warnIfNoTransform();
     249             : 
     250             :   friend PolAverageVi2Factory;
     251             : };
     252             : 
     253             : class GeometricPolAverageTVI: public PolAverageTVI {
     254             : public:
     255             :   GeometricPolAverageTVI(ViImplementation2 * inputVi);
     256             :   ~GeometricPolAverageTVI();
     257             : 
     258             :   // Report the the ViImplementation type
     259             :   //  (should be specialized in child classes)
     260           0 :   virtual casacore::String ViiType() const {
     261           0 :     return casacore::String("GeometricPolAverage( ") + getVii()->ViiType()
     262           0 :         + " )";
     263             :   }
     264             : 
     265             :   // transform data (DATA, CORRECTED_DATA, MODEL_DATA, FLOAT_DATA)
     266             :   virtual void transformComplexData(
     267             :   casacore::Cube<casacore::Complex> const &dataIn,
     268             :   casacore::Cube<casacore::Bool> const &flagIn,
     269             :   casacore::Cube<casacore::Complex> &dataOut) const;
     270             :   virtual void transformFloatData(casacore::Cube<casacore::Float> const &dataIn,
     271             :   casacore::Cube<casacore::Bool> const &flagIn,
     272             :   casacore::Cube<casacore::Float> &dataOut) const;
     273             : 
     274             :   // transform weight (WEIGHT, WEIGHT_SPECTRUM)
     275             :   // TODO
     276             :   virtual void transformWeight(casacore::Array<casacore::Float> const &weightIn,
     277             :   casacore::Array<casacore::Float> &weightOut) const;
     278             : 
     279             : protected:
     280             : 
     281             :   template<class T>
     282             :   void transformData(casacore::Cube<T> const &dataIn,
     283             :   casacore::Cube<casacore::Bool> const &flagIn,
     284             :   casacore::Int pid0,
     285             :   casacore::Int pid1,
     286             :   casacore::Cube<T> &dataOut) const;
     287             : };
     288             : 
     289             : class StokesPolAverageTVI: public PolAverageTVI {
     290             : public:
     291             :   StokesPolAverageTVI(ViImplementation2 * inputVi);
     292             :   ~StokesPolAverageTVI();
     293             : 
     294             :   // Report the the ViImplementation type
     295             :   //  (should be specialized in child classes)
     296           0 :   virtual casacore::String ViiType() const {
     297           0 :     return casacore::String("StokesPolAverage( ") + getVii()->ViiType() + " )";
     298             :   }
     299             : 
     300             :   // transform data (DATA, CORRECTED_DATA, MODEL_DATA, FLOAT_DATA)
     301             :   virtual void transformComplexData(
     302             :   casacore::Cube<casacore::Complex> const &dataIn,
     303             :   casacore::Cube<casacore::Bool> const &flagIn,
     304             :   casacore::Cube<casacore::Complex> &dataOut) const;
     305             :   virtual void transformFloatData(casacore::Cube<casacore::Float> const &dataIn,
     306             :   casacore::Cube<casacore::Bool> const &flagIn,
     307             :   casacore::Cube<casacore::Float> &dataOut) const;
     308             : 
     309             :   // transform weight (WEIGHT, WEIGHT_SPECTRUM)
     310             :   // TODO
     311             :   virtual void transformWeight(casacore::Array<casacore::Float> const &weightIn,
     312             :   casacore::Array<casacore::Float> &weightOut) const;
     313             : 
     314             : protected:
     315             : 
     316             :   template<class T>
     317             :   void transformData(casacore::Cube<T> const &dataIn,
     318             :   casacore::Cube<casacore::Bool> const &flagIn,
     319             :   casacore::Int pid0,
     320             :   casacore::Int pid1,
     321             :   casacore::Cube<T> &dataOut) const;
     322             : };
     323             : 
     324             : // <summary>
     325             : // A factory for generating ViImplementation2 for polarization averaging.
     326             : // </summary>
     327             : //
     328             : // <use visibility=export>
     329             : //
     330             : // <prerequisite>
     331             : //   <li> <linkto class="VisibilityIterator2:description">VisibilityIterator2</linkto>
     332             : // </prerequisite>
     333             : //
     334             : // <etymology>
     335             : // Factory for layered ViImplementation2 construction
     336             : // </etymology>
     337             : //
     338             : // <synopsis>
     339             : // PolAverageVi2Factory
     340             : // </synopsis>
     341             : //
     342             : // <motivation>
     343             : //
     344             : // </motivation>
     345             : //
     346             : // <example>
     347             : //
     348             : // </example>
     349             : 
     350             : class PolAverageVi2Factory: public ViFactory {
     351             : 
     352             : public:
     353             :   // Constructor
     354             :   PolAverageVi2Factory(casacore::Record const &configuration,
     355             :       ViImplementation2 *inputVII);
     356             :   PolAverageVi2Factory(casacore::Record const &configuration,
     357             :   casacore::MeasurementSet const *ms, SortColumns const sortColumns,
     358             :   casacore::Double timeInterval, casacore::Bool isWritable);
     359             : 
     360             :   // Destructor
     361             :   ~PolAverageVi2Factory();
     362             : 
     363             :   ViImplementation2 * createVi() const;
     364             : 
     365             : private:
     366             :   enum AveragingMode {
     367             :     GEOMETRIC, STOKES, NUM_MODES, DEFAULT = STOKES
     368             :   };
     369             : 
     370           7 :   static AveragingMode GetAverageModeFromConfig(
     371             :   casacore::Record const &configuration) {
     372           7 :     if (configuration.isDefined("mode")) {
     373          14 :       casacore::String mode = configuration.asString("mode");
     374           7 :       mode.downcase();
     375           7 :       if (mode == "geometric") {
     376           2 :         return AveragingMode::GEOMETRIC;
     377           5 :       } else if (mode == "stokes") {
     378           4 :         return AveragingMode::STOKES;
     379           1 :       } else if (mode == "default") {
     380           1 :         return AveragingMode::DEFAULT;
     381             :       } else {
     382           0 :         return AveragingMode::NUM_MODES;
     383             :       }
     384             :     }
     385           0 :     return AveragingMode::DEFAULT;
     386             :   }
     387             : 
     388             :   ViImplementation2 *inputVII_p;
     389             : 
     390             :   AveragingMode mode_;
     391             : };
     392             : 
     393             : class PolAverageTVILayerFactory: public ViiLayerFactory {
     394             : 
     395             : public:
     396             :   PolAverageTVILayerFactory(casacore::Record const &configuration);
     397           2 :   virtual ~PolAverageTVILayerFactory() {
     398           2 :   }
     399             :   ;
     400             : 
     401             : protected:
     402             : 
     403             :   ViImplementation2 * createInstance(ViImplementation2* vii0) const;
     404             : 
     405             :   casacore::Record configuration_p;
     406             : 
     407             : };
     408             : 
     409             : } //# NAMESPACE VI - END
     410             : 
     411             : } //# NAMESPACE CASA - END
     412             : 
     413             : #endif // _MSVIS_POLAVERAGINGTVI_H_
     414             : 

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