LCOV - code coverage report
Current view: top level - stdcasa - UtilJ.h (source / functions) Hit Total Coverage
Test: ctest_coverage.info Lines: 2 68 2.9 %
Date: 2023-11-06 10:06:49 Functions: 1 32 3.1 %

          Line data    Source code
       1             : /*
       2             :  * UtilJ.h
       3             :  *
       4             :  *  Created on: Nov 4, 2010
       5             :  *      Author: jjacobs
       6             :  */
       7             : 
       8             : #ifndef UTILJ_H_
       9             : #define UTILJ_H_
      10             : 
      11             : // Casa Includes
      12             : 
      13             : #include <casacore/casa/aips.h>
      14             : #include <casacore/casa/BasicSL/String.h>
      15             : #include <casacore/casa/Exceptions/Error.h>
      16             : 
      17             : // C++ and System Includes
      18             : 
      19             : #include <cassert>
      20             : #include <cstdarg>
      21             : #include <cstdlib>
      22             : #include <sys/time.h>
      23             : #include <sys/resource.h>
      24             : // STL Includes
      25             : #include <algorithm>
      26             : #include <functional>
      27             : #include <iterator>
      28             : #include <map>
      29             : #include <set>
      30             : #include <vector>
      31             : 
      32             : #ifdef __GNUC__
      33             : #define DEPRECATED(func) func __attribute__ ((deprecated))
      34             : #elif defined(_MSC_VER)
      35             : #define DEPRECATED(func) __declspec(deprecated) func
      36             : #else
      37             : ///#pragma message("WARNING: You need to implement DEPRECATED for this compiler")
      38             : #define DEPRECATED(func) func
      39             : #endif
      40             : 
      41             : #ifdef __GNUC__
      42             : #define DEPRECATED_METHOD(comment) __attribute__ ((deprecated))
      43             : #else
      44             : ///#pragma message("WARNING: You need to implement DEPRECATED for this compiler")
      45             : #define DEPRECATED_METHOD(comment)
      46             : #endif
      47             : 
      48             : #define Assert AssertCc
      49             : #define Throw ThrowCc
      50             : 
      51             : #define UnusedVariable(x) ((void) x);
      52             : 
      53             : namespace casacore{
      54             : 
      55             : class String;
      56             : }
      57             : 
      58             : namespace casa {
      59             : 
      60             : namespace utilj {
      61             : 
      62             : class AipsErrorTrace : public casacore::AipsError {
      63             : 
      64             : public:
      65             : 
      66             :     AipsErrorTrace ( const casacore::String &msg, const casacore::String &filename, casacore::uInt lineNumber,
      67             :                      Category c = GENERAL);
      68             : 
      69             : };
      70             : 
      71             : class Strings : public std::vector<casacore::String> {};
      72             : 
      73             : //template <typename Element, typename Container>
      74             : //bool
      75             : //contains (const Element & e, const Container & c)
      76             : //{
      77             : //      return c.find(e) != c.end();
      78             : //}
      79             : 
      80             : 
      81             : template <typename Container>
      82             : bool
      83     6397818 : containsKey (const typename Container::key_type & key,
      84             :              const Container & container)
      85             : {
      86     6397818 :     return container.find(key) != container.end();
      87             : }
      88             : 
      89             : template <typename Container>
      90             : bool
      91           0 : contains (const typename Container::value_type & e,
      92             :           const Container & c)
      93             : {
      94             :     // For set and map use containsKey; will work for set but
      95             :     // use with map requires specifying a pair as the first argument
      96             : 
      97           0 :     return std::find(c.begin(), c.end(), e) != c.end();
      98             : }
      99             : 
     100             : template <typename F, typename S>
     101             : F & first (std::pair<F,S> & pair) { return pair.first;}
     102             : 
     103             : template <typename F, typename S>
     104             : const F & first (const std::pair<F,S> & pair) { return pair.first;}
     105             : 
     106             : template <typename F, typename S>
     107             : class FirstFunctor : public std::unary_function<std::pair<F,S>, F>{
     108             : public:
     109           0 :     F & operator() (std::pair<F,S> & p) { return p.first; }
     110           0 :     const F & operator() (const std::pair<F,S> & p) { return p.first; }
     111             : };
     112             : 
     113             : template <typename Container, typename Element>
     114             : Container
     115             : fillContainer (Element sentinel, ...)
     116             : {
     117             :     using namespace std;
     118             : 
     119             :     Container container;
     120             : 
     121             :     va_list vaList;
     122             :     va_start (vaList, sentinel);
     123             : 
     124             :     Element e = va_arg (vaList, Element);
     125             : 
     126             :     insert_iterator<Container> i = inserter (container, container.begin());
     127             : 
     128             :     while (e != sentinel){
     129             : 
     130             :         * i ++ = e;
     131             : 
     132             :         e = va_arg (vaList, Element);
     133             :     }
     134             : 
     135             :     va_end (vaList);
     136             : 
     137             :     return container;
     138             : }
     139             : 
     140             : template <typename F, typename S>
     141           0 : FirstFunctor<F,S> firstFunctor () { return FirstFunctor<F,S> ();}
     142             : 
     143             : 
     144             : //DEPRECATED (casacore::String format (const char * formatString, ...) /* "Use casacore::String::format"*/);
     145             : casacore::String formatV (const casacore::String & formatString, va_list vaList);
     146             : 
     147             : template<typename T>
     148             : T
     149             : getEnv (const casacore::String & name, const T & defaultValue)
     150             : {
     151             :         char * value = getenv (name.c_str());
     152             : 
     153             :         if (value == NULL){
     154             :                 return defaultValue;
     155             :         }
     156             :         else{
     157             :                 return T (value);
     158             :         }
     159             : }
     160             : 
     161             : bool
     162             : getEnv (const casacore::String & name, const bool & defaultValue);
     163             : 
     164             : int
     165             : getEnv (const casacore::String & name, const int & defaultValue);
     166             : 
     167             : 
     168             : casacore::String getTimestamp ();
     169             : 
     170             : bool isEnvDefined (const casacore::String & name);
     171             : 
     172             : std::vector<casacore::String> split (const casacore::String & string, const casacore::String & splitter,
     173             :                            bool ignoreConsecutiveSplitters = false);
     174             : 
     175             : template <typename Itr>
     176             : casacore::String
     177           0 : join (Itr begin, Itr end, const casacore::String & delimiter)
     178             : {
     179           0 :     casacore::String result;
     180           0 :     Itr i = begin;
     181             : 
     182           0 :     if (i != end){
     183             : 
     184           0 :         result = * i ++;
     185             : 
     186           0 :         for (; i != end; i++){
     187           0 :             result += delimiter + * i;
     188             :         }
     189             :     }
     190             : 
     191           0 :     return result;
     192             : }
     193             : 
     194             : template <typename T>
     195             : casacore::String
     196           0 : join (const T & strings, const casacore::String & delimiter)
     197             : {
     198           0 :     return join (strings.begin(), strings.end(), delimiter);
     199             : }
     200             : 
     201             : template <typename Itr, typename F>
     202             : casacore::String
     203           0 : join (Itr begin, Itr end, F f, const casacore::String & delimiter)
     204             : {
     205           0 :     casacore::String result;
     206           0 :     Itr i = begin;
     207             : 
     208           0 :     if (i != end){
     209             : 
     210           0 :         result = f(* i);
     211           0 :         ++ i;
     212             : 
     213           0 :         for (; i != end; i++){
     214           0 :             result += delimiter + f (* i);
     215             :         }
     216             :     }
     217             : 
     218           0 :     return result;
     219             : }
     220             : 
     221             : template <typename K, typename V>
     222             : std::vector<K>
     223           0 : mapKeys (const std::map<K,V> & aMap)
     224             : {
     225           0 :     std::vector<K> result;
     226             : 
     227           0 :     std::transform (aMap.begin(), aMap.end(), back_inserter (result), firstFunctor<K,V>());
     228             : 
     229           0 :     return result;
     230             : }
     231             : 
     232             : casacore::AipsError repackageAipsError (casacore::AipsError & error,
     233             :                                         const casacore::String & message,
     234             :                                         const casacore::String & file,
     235             :                                         int line, const casacore::String & func);
     236             : 
     237             : template <typename F, typename S>
     238             : F & second (std::pair<F,S> & pair) { return pair.second;}
     239             : 
     240             : template <typename F, typename S>
     241             : const F & second (const std::pair<F,S> & pair) { return pair.second;}
     242             : 
     243             : template <typename F, typename S>
     244             : class SecondFunctor : public std::unary_function<std::pair<F,S>, F>{
     245             : public:
     246             :     S & operator() (std::pair<F,S> & p) { return p.second; }
     247             : };
     248             : 
     249             : template <typename F, typename S>
     250             : SecondFunctor<F,S> secondFunctor () { return SecondFunctor<F,S> ();}
     251             : 
     252             : template <typename K, typename V>
     253             : std::vector<V>
     254             : mapValues (const std::map<K,V> & aMap)
     255             : {
     256             :     std::vector<K> result (aMap.size());
     257             : 
     258             :     std::transform (aMap.begin(), aMap.end(), back_inserter (result), second<K,V>);
     259             : 
     260             :     return result;
     261             : }
     262             : 
     263             : void printBacktrace (std::ostream & os, const casacore::String & prefix = "");
     264             : 
     265             : long round (double d);
     266             : 
     267             : void sleepMs (int milliseconds);
     268             : void toStdError (const casacore::String & m, const casacore::String & prefix = "*E* ");
     269             : void throwIf (bool condition, const casacore::String & message, const casacore::String & file,
     270             :               int line, const casacore::String & func = casacore::String());
     271             : void throwIfError (int errorCode, const casacore::String & prefix, const casacore::String & file,
     272             :                    int line, const casacore::String & func = casacore::String());
     273             : 
     274             : template <typename It, typename Obj>
     275             : casacore::String
     276           0 : containerToString (It begin, It end, casacore::String (Obj::* func) () const, const casacore::String & delimiter = ",",
     277             :                    const casacore::String & wrapper = "")
     278             : {
     279           0 :     casacore::String result;
     280           0 :     casacore::String d = "";
     281             : 
     282           0 :     for (It i = begin; i != end; i++){
     283           0 :         result += d + wrapper + ((* i) .* func) () + wrapper;
     284           0 :         d = delimiter;
     285             :     }
     286             : 
     287           0 :     return result;
     288             : }
     289             : 
     290             : class MemoryStatistics {
     291             : 
     292             : public:
     293             : 
     294             :     MemoryStatistics ();
     295             : 
     296             :     void update (); // call to get the latest stats loaded
     297             :     double getRssInMB () const; // get resident set size
     298             :     int64_t getRssInBytes () const;
     299             : 
     300             :     double getVmInMB () const; // get the Virtual memory size
     301             :     int64_t getVmInBytes () const;
     302             : 
     303             : private:
     304             : 
     305             :     double bytesPerMb_p;
     306             :     string filename_p;
     307             :     int pageSize_p;
     308             :     int64_t rssPages_p; // in pages
     309             :     int64_t vmPages_p; // in pages
     310             : };
     311             : 
     312             : class IoStatistics {
     313             : 
     314             : public:
     315             : 
     316             :     IoStatistics ();
     317             : 
     318             :     IoStatistics operator- (const IoStatistics &) const;
     319             :     IoStatistics operator+ (const IoStatistics &) const;
     320             :     IoStatistics operator/ (const IoStatistics &) const;
     321             :     IoStatistics operator* (double factor) const;
     322             : 
     323             :     void capture ();
     324             : 
     325             :     double getBytesRead () const;
     326             :     double getBytesWritten () const;
     327             :     double getNReads () const;
     328             :     double getNWrites () const;
     329             : 
     330             :     casacore::String report (float scale = .001, const casacore::String & scaleTag = casacore::String ("K")) const;
     331             : 
     332             : private:
     333             : 
     334             :     double nBytesRead_p;
     335             :     double nBytesWritten_p;
     336             :     double nReads_p;
     337             :     double nWrites_p;
     338             :     casacore::String statFile_p;
     339             : };
     340             : 
     341             : 
     342             : // These two classes, Times and DeltaTimes should be moved out of this file and
     343             : // into casacore/casa/OS.  In the meantime, an ifdef should keep the apple from
     344             : // barfing.
     345             : 
     346             : // <summary>
     347             : 
     348             : // </summary>
     349             : 
     350             : // <use visibility=local>   or   <use visibility=export>
     351             : 
     352             : // <reviewed reviewer="" date="yyyy/mm/dd" tests="" demos="">
     353             : // </reviewed>
     354             : 
     355             : // <prerequisite>
     356             : //   <li> SomeClass
     357             : //   <li> SomeOtherClass
     358             : //   <li> some concept
     359             : // </prerequisite>
     360             : //
     361             : // <etymology>
     362             : // </etymology>
     363             : //
     364             : // <synopsis>
     365             : // </synopsis>
     366             : //
     367             : // <example>
     368             : // </example>
     369             : //
     370             : // <motivation>
     371             : // </motivation>
     372             : //
     373             : // <templating arg=T>
     374             : //    <li>
     375             : //    <li>
     376             : // </templating>
     377             : //
     378             : // <thrown>
     379             : //    <li>
     380             : //    <li>
     381             : // </thrown>
     382             : //
     383             : // <todo asof="yyyy/mm/dd">
     384             : //   <li> add this feature
     385             : //   <li> fix this bug
     386             : //   <li> start discussion of this possible extension
     387             : // </todo>
     388             : 
     389             : class DeltaThreadTimes;
     390             : 
     391             : class ThreadTimes {
     392             : 
     393             : public:
     394             : 
     395           0 :     ThreadTimes () { * this = getTime();}
     396             : 
     397           0 :     double cpu () const { return cpu_p;}
     398             :     void clear () { empty_p = true;}
     399             :     bool empty () const { return empty_p;}
     400           0 :     double elapsed () const { return elapsed_p;}
     401             : 
     402             :     static ThreadTimes
     403           0 :     getTime (){
     404             : 
     405             :         struct timeval tVal;
     406           0 :         gettimeofday (& tVal, NULL);
     407             : 
     408           0 :         double elapsed = tVal.tv_sec + tVal.tv_usec * 1e-6;
     409             : 
     410             :         //double cpu = ((double) clock ()) / CLOCKS_PER_SEC; // should be in seconds
     411             : 
     412             : 
     413             : 
     414             : #if     defined (RUSAGE_THREAD)
     415             :         struct rusage usage;
     416             : 
     417           0 :         int failed = getrusage (RUSAGE_THREAD, & usage);
     418           0 :         assert (! failed);
     419             : 
     420           0 :         double cpu = ! failed ? toSeconds (usage.ru_utime) + toSeconds (usage.ru_stime) : 0;
     421             : #else
     422             :         double cpu = 0;
     423             : #endif
     424             : 
     425           0 :         return ThreadTimes (elapsed, cpu);
     426             :     }
     427             : 
     428             :     DeltaThreadTimes operator- (const ThreadTimes & tEarlier) const;
     429             : 
     430             :     static double
     431           0 :     toSeconds (const struct timeval & t)
     432             :     {
     433           0 :         return t.tv_sec + t.tv_usec * 1e-6;
     434             :     }
     435             : 
     436             : protected:
     437             : 
     438             :     bool empty_p;
     439             :     double cpu_p;
     440             :     double elapsed_p;
     441             : 
     442           0 :     ThreadTimes (double elapsed, double cpu) : cpu_p (cpu), elapsed_p (elapsed) {}
     443             : };
     444             : 
     445             : // <summary>
     446             : // </summary>
     447             : 
     448             : // <use visibility=local>   or   <use visibility=export>
     449             : 
     450             : // <reviewed reviewer="" date="yyyy/mm/dd" tests="" demos="">
     451             : // </reviewed>
     452             : 
     453             : // <prerequisite>
     454             : //   <li> SomeClass
     455             : //   <li> SomeOtherClass
     456             : //   <li> some concept
     457             : // </prerequisite>
     458             : //
     459             : // <etymology>
     460             : // </etymology>
     461             : //
     462             : // <synopsis>
     463             : // </synopsis>
     464             : //
     465             : // <example>
     466             : // </example>
     467             : //
     468             : // <motivation>
     469             : // </motivation>
     470             : //
     471             : // <templating arg=T>
     472             : //    <li>
     473             : //    <li>
     474             : // </templating>
     475             : //
     476             : // <thrown>
     477             : //    <li>
     478             : //    <li>
     479             : // </thrown>
     480             : //
     481             : // <todo asof="yyyy/mm/dd">
     482             : //   <li> add this feature
     483             : //   <li> fix this bug
     484             : //   <li> start discussion of this possible extension
     485             : // </todo>
     486             : class DeltaThreadTimes : private ThreadTimes {
     487             : 
     488             :     friend class ThreadTimes;
     489             : 
     490             : public:
     491             : 
     492           0 :     DeltaThreadTimes () : ThreadTimes (0, 0), doStats_p (false), n_p (0) {}
     493           0 :     explicit DeltaThreadTimes (bool doStats) : ThreadTimes (0,0), doStats_p (doStats), n_p (0)
     494             :     {
     495           0 :         cpuSsq_p = 0;
     496           0 :         cpuMin_p = 1e20;
     497           0 :         cpuMax_p = -1e20;
     498           0 :         elapsedSsq_p = 0;
     499           0 :         elapsedMin_p = 1e20;
     500           0 :         elapsedMax_p = -1e20;
     501           0 :     }
     502             : 
     503             :     DeltaThreadTimes & operator += (const DeltaThreadTimes & other);
     504             : 
     505           0 :     double cpu () const { return ThreadTimes::cpu();}
     506             :     double cpuAvg () const { return n_p == 0 ? 0 : cpu() / n_p;}
     507           0 :     double elapsed () const { return ThreadTimes::elapsed();}
     508           0 :     double elapsedAvg () const { return n_p == 0 ? 0 : elapsed() / n_p;}
     509             :     casacore::String formatAverage (const casacore::String & floatFormat = "%6.1f",
     510             :                           double scale=1000.0,
     511             :                           const casacore::String & units = "ms")  const; // to convert to ms
     512             :     casacore::String formatStats (const casacore::String & floatFormat = "%6.1f",
     513             :                         double scale=1000.0,
     514             :                         const casacore::String & units = "ms")  const; // to convert to ms
     515           0 :     int n() const { return n_p;}
     516             : 
     517             : protected:
     518             : 
     519           0 :     DeltaThreadTimes (double elapsed, double cpu) : ThreadTimes (elapsed, cpu), n_p (0) {}
     520             : 
     521             : private:
     522             : 
     523             :     double cpuMin_p;
     524             :     double cpuMax_p;
     525             :     double cpuSsq_p;
     526             :     bool doStats_p;
     527             :     double elapsedMin_p;
     528             :     double elapsedMax_p;
     529             :     double elapsedSsq_p;
     530             :     int n_p;
     531             : };
     532             : 
     533             : // Global Functions
     534             : 
     535             : // <linkfrom anchor=unique-string-within-this-file classes="class-1,...,class-n">
     536             : //     <here> Global functions </here> for foo and bar.
     537             : // </linkfrom>
     538             : 
     539             : // A free function is provided that is useful for
     540             : // go here...
     541             : 
     542             : // <group name=accumulation>
     543             : 
     544             : 
     545             : // </group>
     546             : 
     547             : /*
     548             : 
     549             : Example of using composer and unary.  The composed functors have to be derived from std::unary_function
     550             : 
     551             :   int f(int x) { return x*x;}
     552             :   int g(int x) { return 2 * x;}
     553             :   int h(int x) { return 100 + x;}
     554             : 
     555             :   vector<int> a;
     556             :   a.push_back(1);
     557             :   a.push_back(2);
     558             :   a.push_back(3);
     559             : 
     560             :   transform (a.begin(), a.end(), std::ostream_iterator<int> (cout, "\n"), compose (unary(f), unary(f)));
     561             : 
     562             :   // prints out
     563             :   // 4
     564             :   // 16
     565             :   // 36
     566             : 
     567             :   transform (a.begin(), a.end(), std::ostream_iterator<int> (cout, "\n"),
     568             :              compose (unary(h), compose (unary(f), unary(f))));
     569             : 
     570             :   // prints out
     571             :   // 104
     572             :   // 116
     573             :   // 136
     574             : 
     575             : */
     576             : 
     577             : template <typename F, typename G>
     578             : class ComposedFunctor : public std::unary_function <typename G::argument_type, typename F::result_type> {
     579             : 
     580             : public:
     581             : 
     582           0 :     ComposedFunctor (F f, G g) : f_p (f), g_p (g) {}
     583             : 
     584           0 :     typename F::result_type operator() (typename G::argument_type x) { return f_p ( g_p (x)); }
     585             : 
     586             : private:
     587             : 
     588             :     F f_p;
     589             :     G g_p;
     590             : };
     591             : 
     592             : template <typename F, typename G>
     593             : ComposedFunctor<F, G>
     594           0 : compose (F f, G g)
     595             : {
     596           0 :     return ComposedFunctor <F, G> (f, g);
     597             : }
     598             : 
     599             : template <typename D, typename R>
     600             : class UnaryFunctor : public std::unary_function<D,R> {
     601             : public:
     602             :     typedef R (* F) (D);
     603             : 
     604             :     UnaryFunctor (F f) : f_p (f) {}
     605             :     R operator() (D x) { return f_p (x); }
     606             : 
     607             : private:
     608             : 
     609             :     F f_p;
     610             : };
     611             : 
     612             : template <typename D, typename R>
     613             : UnaryFunctor <D, R>
     614             : unary (R (*f) (D)) { return UnaryFunctor<D, R> (f);}
     615             : 
     616             : class Z {
     617             : public:
     618             : 
     619             :     string getName () const { return name_p;}
     620             : 
     621             :     string name_p;
     622             : };
     623             : 
     624             : 
     625             : 
     626             : } // end namespace utilj
     627             : 
     628             : } // end namespace casa
     629             : 
     630             : 
     631             : 
     632             : #endif /* UTILJ_H_ */

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