LCOV - code coverage report
Current view: top level - synthesis/MeasurementComponents - VisCalSolver.cc (source / functions) Hit Total Coverage
Test: ctest_coverage.info Lines: 7 573 1.2 %
Date: 2023-11-06 10:06:49 Functions: 2 20 10.0 %

          Line data    Source code
       1             : //# VisCalSolver.cc: Implementation of generic visibility solving
       2             : //# Copyright (C) 1996,1997,1998,1999,2000,2001,2002,2003
       3             : //# Associated Universities, Inc. Washington DC, USA.
       4             : //#
       5             : //# This library is free software; you can redistribute it and/or modify it
       6             : //# under the terms of the GNU Library General Public License as published by
       7             : //# the Free Software Foundation; either version 2 of the License, or (at your
       8             : //# option) any later version.
       9             : //#
      10             : //# This library is distributed in the hope that it will be useful, but WITHOUT
      11             : //# ANY WARRANTY; without even the implied warranty of MERCHANTABILITY or
      12             : //# FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU Library General Public
      13             : //# License for more details.
      14             : //#
      15             : //# You should have received a copy of the GNU Library General Public License
      16             : //# along with this library; if not, write to the Free Software Foundation,
      17             : //# Inc., 675 Massachusetts Ave, Cambridge, MA 02139, USA.
      18             : //#
      19             : //# Correspondence concerning AIPS++ should be addressed as follows:
      20             : //#        Internet email: aips2-request@nrao.edu.
      21             : //#        Postal address: AIPS++ Project Office
      22             : //#                        National Radio Astronomy Observatory
      23             : //#                        520 Edgemont Road
      24             : //#                        Charlottesville, VA 22903-2475 USA
      25             : //#
      26             : 
      27             : #include <synthesis/MeasurementComponents/VisCalSolver.h>
      28             : 
      29             : #include <msvis/MSVis/VisBuffer.h>
      30             : 
      31             : #include <casacore/casa/Arrays/ArrayMath.h>
      32             : #include <casacore/casa/Arrays/MaskArrMath.h>
      33             : #include <casacore/casa/Arrays/ArrayLogical.h>
      34             : #include <casacore/casa/Arrays/ArrayIter.h>
      35             : //#include <scimath/Mathematics/MatrixMathLA.h>
      36             : #include <casacore/casa/BasicSL/String.h>
      37             : #include <casacore/casa/BasicMath/Math.h>
      38             : #include <casacore/casa/Utilities/Assert.h>
      39             : #include <casacore/casa/Exceptions/Error.h>
      40             : #include <casacore/casa/OS/Memory.h>
      41             : #include <casacore/casa/OS/Path.h>
      42             : 
      43             : #include <sstream>
      44             : 
      45             : #include <casacore/casa/Logging/LogMessage.h>
      46             : #include <casacore/casa/Logging/LogSink.h>
      47             : 
      48             : #define VCS_PRTLEV 0
      49             : 
      50             : using namespace casacore;
      51             : namespace casa { //# NAMESPACE CASA - BEGIN
      52             : 
      53             : 
      54             : // **********************************************************
      55             : //  UVMod Implementations
      56             : //
      57             : 
      58           2 : VisCalSolver::VisCalSolver() :
      59             :   svb_(NULL),
      60             :   vbga_(NULL),
      61             :   ve_(NULL),
      62             :   svc_(NULL),
      63             :   nTotalPar_(0),
      64             :   R_(),dR_(),Rflg_(),
      65             :   maxIter_(50),
      66             :   chiSq_(0.0),
      67             :   chiSqV_(4,0.0),
      68             :   lastChiSq_(0.0),dChiSq_(0.0),
      69             :   sumWt_(0.0),nWt_(0),
      70             :   cvrgcount_(0),
      71             :   par_(), parOK_(), parErr_(), srcPar_(), lastCalPar_(), lastSrcPar_(),
      72             :   dpar_(), dcalpar_(), dsrcpar_(),
      73             :   grad_(),hess_(),
      74             :   lambda_(2.0),
      75             :   optstep_(true),
      76           2 :   prtlev_(VCS_PRTLEV)
      77             : {
      78           2 :   if (prtlev()>0) cout << "VCS::VCS()" << endl;
      79           2 : }
      80             : 
      81           2 : VisCalSolver::~VisCalSolver() 
      82             : {  
      83           2 :   if (prtlev()>0) cout << "VCS::~VCS()" << endl;
      84           2 : }
      85             : 
      86           0 : Bool VisCalSolver::solve(VisEquation& ve, SolvableVisCal& svc, VisBuffer& svb) {
      87             : 
      88           0 :   if (prtlev()>1) cout << "VCS::solve(,,)" << endl;
      89             : 
      90             :   /*
      91             :   LogSink logsink;
      92             :   {
      93             :     LogMessage message(LogOrigin("VisCalSolver", "solve"));
      94             :     ostringstream o; o<<"Beginning solve...";
      95             :     message.message(o);
      96             :     logsink.post(message);
      97             :   }
      98             :   */
      99             :   // Pointers to local ve,svc,svb
     100           0 :   ve_=&ve;
     101           0 :   svc_=&svc;
     102           0 :   svb_=&svb;
     103           0 :   vbga_=NULL;
     104             : 
     105             :   // Verify that VisEq has the correct svc:
     106             :   // TBD?
     107             : 
     108             :   // Initialize everything 
     109           0 :   initSolve();
     110             : 
     111           0 :   Vector<Float> steplist(maxIter_+2,0.0);
     112           0 :   Vector<Float> rsteplist(maxIter_+2,0.0);
     113             : 
     114             :   //  cout << "svb.modelVisCube() = " << phase(svb.modelVisCube())*180.0/C::pi << endl;
     115             :   //  cout << "svb.modelVisCube() = " << amplitude(svb.modelVisCube()) << endl;
     116             : 
     117             :   // Verify VisBuffer validity for solving
     118             :   //   (this sets parOK() on per-antenna basis (for focusChan)
     119             :   //    based on data weights and baseline participation)
     120           0 :   Bool oktosolve = svc_->verifyForSolve(*svb_);
     121             : 
     122           0 :   if (oktosolve) {
     123             :     
     124           0 :     if (prtlev()>1) cout << "First guess:" << endl
     125           0 :                          << "amp = " << amplitude(par()) << endl
     126           0 :                          << "pha = " << phase(par()) 
     127           0 :                          << endl;
     128             : 
     129             :     // Iterate solution
     130           0 :     Int iter(0);
     131           0 :     Bool done(false);
     132           0 :     while (!done) {
     133             :       
     134           0 :       if (prtlev()>2) cout << " Beginning iteration " << iter 
     135           0 :                            << "---------------------------------" << endl;
     136             :       
     137             :       // Differentiate the VB and get current Chi2
     138           0 :       differentiate();
     139           0 :       chiSquare();
     140           0 :       if (chiSq()==0.0) {
     141             :         //      cout << "CHI2 IS SPURIOUSLY ZERO!*************************************" << endl;
     142             :         //      cout << "R() = " << R() << endl;
     143             :         //      cout << "wtmat = " << svb.weightMat() << endl;
     144             :         //      cout << "flag = " << svb.flag() << endl;
     145             :         //      cout << "sum(wtmat) = " << sum(wtmat) << endl;
     146           0 :         return false;
     147             :       }
     148             : 
     149           0 :       dChiSq() = chiSq()-lastChiSq();
     150             : 
     151             :       //      cout << "chi2 = " << chiSq() << " " << dChiSq() << " " << dChiSq()/chiSq() << endl;
     152             :       
     153             :       // Continuue if we haven't converged
     154           0 :       if (!converged()) {
     155             :         
     156           0 :         if (dChiSq()<=0.0) {
     157             :           // last step was good...
     158           0 :           lastChiSq()=chiSq();
     159             :           
     160             :           // so accumulate new grad/hess...
     161           0 :           accGradHess();
     162             :           
     163             :           //...and adjust lambda downward
     164             :           //    lambda()/=2.0;
     165             :           //    lambda()=0.8;
     166           0 :           lambda()=1.0;
     167             :         }
     168             :         else {
     169             :           //      cout << "reverting..." << chiSq() << " " << dChiSq() << " (" << iter << ")" << endl;
     170             :           // last step was bad, revert to previous 
     171           0 :           revert();
     172             :           //...with a larger lambda
     173             :           //    lambda()*=4.0;
     174           0 :           lambda()=1.0;
     175             :         }
     176             :         
     177             :         // Solve for the parameter step
     178           0 :         solveGradHess();
     179             :         
     180             :         // Remember curr pars
     181           0 :         lastCalPar()=par();
     182           0 :         if (svc_->solvePol())
     183           0 :           lastSrcPar()=srcPar();
     184             :         
     185             :         // Refine the step size by exploring chi2 in the
     186             :         //  gradient direction
     187           0 :         if (optstep_) //  && cvrgcount_>=3)
     188           0 :           optStepSize();
     189             :         
     190             :         // Update current parameters (saves a copy of them)
     191           0 :         updatePar();
     192             : 
     193             :         //      cout << "srcPar() = " << srcPar() << endl;
     194             : 
     195           0 :         steplist(iter)=max(amplitude(dCalPar()));
     196           0 :         rsteplist(iter)=max(amplitude(dCalPar())/amplitude(par()));
     197             : 
     198             :       }
     199             :       else {
     200             :         // Convergence means we're done!
     201           0 :         done=true;
     202             : 
     203           0 :         if (prtlev()>0) {
     204           0 :           cout << "Iterations =" << iter << endl;
     205           0 :           cout << "par()=" << par() << endl;
     206           0 :           cout << "srcPar()=" << srcPar() << endl;
     207             :         }
     208             : 
     209             : 
     210             :         /*
     211             :         cout << " good pars=" << ntrue(parOK())
     212             :              << " iterations=" << iter << endl
     213             :              << " steps=" << steplist(IPosition(1,0),IPosition(1,iter)) 
     214             :              << endl
     215             :              << " rsteps=" << rsteplist(IPosition(1,0),IPosition(1,iter)) 
     216             :              << endl;
     217             :         */   
     218             : 
     219             :         // Get parameter errors:
     220           0 :         accGradHess();
     221           0 :         getErrors();
     222             : 
     223             :         // Return, signaling success if at least 1 good solution
     224           0 :         return (ntrue(parOK())>0);
     225             :         
     226             :       }
     227             :       
     228             :       // Escape iteration loop via iteration limit
     229           0 :       if (iter==maxIter()) {
     230           0 :         cout << "Reached iteration limit: " << iter << " iterations.  " << endl;
     231             :         //      cout << " good pars = " << ntrue(parOK())
     232             :         //           << "  steps = " << steplist
     233             :         //           << endl;
     234           0 :         done=true;
     235             :       }
     236             :       
     237             :       // Advance iteration counter
     238           0 :       iter++;
     239             :     }
     240             :     
     241             :   }
     242             :   else {
     243           0 :     cout << " Insufficient unflagged antennas to proceed with this solve." << endl;
     244             :   }
     245             : 
     246           0 :   return false;
     247             :     
     248             : }
     249             : 
     250             : // New VisBuffGroupAcc version
     251           0 : Bool VisCalSolver::solve(VisEquation& ve, SolvableVisCal& svc, VisBuffGroupAcc& vbga) {
     252             : 
     253           0 :   if (prtlev()>1) cout << "VCS::solve(,,VBGA)" << endl;
     254             : 
     255             :   /*
     256             :   LogSink logsink;
     257             :   {
     258             :     LogMessage message(LogOrigin("VisCalSolver", "solve"));
     259             :     ostringstream o; o<<"Beginning solve...";
     260             :     message.message(o);
     261             :     logsink.post(message);
     262             :   }
     263             :   */
     264             :   // Pointers to local ve,svc,svb
     265           0 :   ve_=&ve;
     266           0 :   svc_=&svc;
     267           0 :   svb_=NULL;
     268           0 :   vbga_=&vbga;
     269             : 
     270             :   // Verify that VisEq has the correct svc:
     271             :   // TBD?
     272             : 
     273             :   // Initialize everything 
     274           0 :   initSolve();
     275             : 
     276           0 :   Vector<Float> steplist(maxIter_+2,0.0);
     277           0 :   Vector<Float> rsteplist(maxIter_+2,0.0);
     278             : 
     279             :   // Verify Data's validity for solve w.r.t. baselines available
     280             :   //   (this sets parOK() on per-antenna basis (for focusChan)
     281             :   //    based on data weights and baseline participation)
     282           0 :   Bool oktosolve = svc_->verifyConstraints(*vbga_);
     283             : 
     284           0 :   if (oktosolve) {
     285             :     
     286           0 :     if (prtlev()>1) cout << "First guess:" << endl
     287           0 :                          << "amp = " << amplitude(par()) << endl
     288           0 :                          << "pha = " << phase(par()) 
     289           0 :                          << endl;
     290             : 
     291             :     // Iterate solution
     292           0 :     Int iter(0);
     293           0 :     Bool done(false);
     294           0 :     while (!done) {
     295             :       
     296           0 :       if (prtlev()>2) cout << " Beginning iteration " << iter 
     297           0 :                            << "---------------------------------" << endl;
     298             :       
     299             :       // Differentiate the VB and get current Chi2
     300           0 :       differentiate2();
     301           0 :       chiSquare2();
     302           0 :       if (chiSq()==0.0) {
     303             :         //      cout << "CHI2 IS SPURIOUSLY ZERO!*************************************" << endl;
     304             :         //      cout << "R() = " << R() << endl;
     305             :         //      cout << "wtmat = " << svb.weightMat() << endl;
     306             :         //      cout << "flag = " << svb.flag() << endl;
     307             :         //      cout << "sum(wtmat) = " << sum(wtmat) << endl;
     308           0 :         return false;
     309             :       }
     310             : 
     311           0 :       dChiSq() = chiSq()-lastChiSq();
     312             : 
     313             :       //      cout << "chi2 = " << chiSq() << " " << dChiSq() << " " << dChiSq()/chiSq() << endl;
     314             :       
     315             :       // Continuue if we haven't converged
     316           0 :       if (!converged()) {
     317             :         
     318           0 :         if (dChiSq()<=0.0) {
     319             :           // last step was good...
     320           0 :           lastChiSq()=chiSq();
     321             :           
     322             :           // so accumulate new grad/hess...
     323           0 :           accGradHess2();
     324             :           
     325             :           //...and adjust lambda downward
     326             :           //    lambda()/=2.0;
     327             :           //    lambda()=0.8;
     328           0 :           lambda()=1.0;
     329             :         }
     330             :         else {
     331             :           //      cout << "reverting..." << chiSq() << " " << dChiSq() << " (" << iter << ")" << endl;
     332             :           // last step was bad, revert to previous 
     333           0 :           revert();
     334             :           //...with a larger lambda
     335             :           //    lambda()*=4.0;
     336           0 :           lambda()=1.0;
     337             :         }
     338             :         
     339             :         // Solve for the parameter step
     340           0 :         solveGradHess();
     341             :         
     342             :         // Remember curr pars
     343           0 :         lastCalPar()=par();
     344           0 :         if (svc_->solvePol())
     345           0 :           lastSrcPar()=srcPar();
     346             :         
     347             :         // Refine the step size by exploring chi2 in the
     348             :         //  gradient direction
     349           0 :         if (optstep_) //  && cvrgcount_>=3)
     350           0 :           optStepSize2();
     351             :         
     352             :         // Update current parameters (saves a copy of them)
     353           0 :         updatePar();
     354             : 
     355             :         //      cout << "srcPar() = " << srcPar() << endl;
     356             : 
     357           0 :         steplist(iter)=max(amplitude(dCalPar()));
     358           0 :         rsteplist(iter)=max(amplitude(dCalPar())/amplitude(par()));
     359             : 
     360             :       }
     361             :       else {
     362             :         // Convergence means we're done!
     363           0 :         done=true;
     364             : 
     365           0 :         if (prtlev()>0) {
     366           0 :           cout << "Iterations =" << iter << endl;
     367           0 :           cout << "par()=" << par() << endl;
     368           0 :           cout << "srcPar()=" << srcPar() << endl;
     369             :         }
     370             : 
     371             : 
     372             :         /*
     373             :         cout << " good pars=" << ntrue(parOK())
     374             :              << " iterations=" << iter << endl
     375             :              << " steps=" << steplist(IPosition(1,0),IPosition(1,iter)) 
     376             :              << endl
     377             :              << " rsteps=" << rsteplist(IPosition(1,0),IPosition(1,iter)) 
     378             :              << endl;
     379             :         */   
     380             : 
     381             :         // Get parameter errors:
     382           0 :         accGradHess2();
     383           0 :         getErrors();
     384             : 
     385             :         // Return, signaling success if at least 1 good solution
     386           0 :         return (ntrue(parOK())>0);
     387             :         
     388             :       }
     389             :       
     390             :       // Escape iteration loop via iteration limit
     391           0 :       if (iter==maxIter()) {
     392           0 :         cout << "Reached iteration limit: " << iter << " iterations.  " << endl;
     393             :         //      cout << " good pars = " << ntrue(parOK())
     394             :         //           << "  steps = " << steplist
     395             :         //           << endl;
     396           0 :         done=true;
     397             :       }
     398             :       
     399             :       // Advance iteration counter
     400           0 :       iter++;
     401             :     }
     402             :     
     403             :   }
     404             :   else {
     405           0 :     cout << " Insufficient unflagged antennas to proceed with this solve." << endl;
     406             :   }
     407             : 
     408           0 :   return false;
     409             :     
     410             : }
     411             :   
     412           0 : void VisCalSolver::initSolve() {
     413             :     
     414           0 :   if (prtlev()>2) cout << " VCS::initSolve()" << endl;
     415             : 
     416             :   // Get total number of cal parameters from svc info
     417           0 :   nCalPar()=svc().nTotalPar();
     418             : 
     419             :   // solvePol() tells us how many source pol params we are solving for
     420           0 :   nSrcPar()=svc().solvePol();
     421             : 
     422             :   // the total number of parameters
     423           0 :   nTotalPar()=nCalPar()+nSrcPar();
     424             : 
     425           0 :   if (prtlev()>2)
     426           0 :     cout << "  Total parameters in solve: " << nTotalPar() << endl;
     427             : 
     428             :   // Chi2 and weights
     429           0 :   chiSq()=0.0;
     430           0 :   lastChiSq()=DBL_MAX;
     431           0 :   dChiSq()=0.0;
     432             :     
     433           0 :   sumWt()=0.0;
     434           0 :   nWt()=0;
     435             : 
     436             :   // Link up svc's internal pars with local reference
     437             :   //   (only if shape is correct)
     438             : 
     439           0 :   if (svc().solveCPar().nelements()==uInt(nCalPar())) {
     440           0 :     par().reference(svc().solveCPar().reform(IPosition(1,nCalPar())));
     441           0 :     parOK().reference(svc().solveParOK().reform(IPosition(1,nCalPar())));
     442           0 :     parErr().reference(svc().solveParErr().reform(IPosition(1,nCalPar())));
     443           0 :     if (svc().solvePol()) 
     444           0 :       srcPar().reference(svc().srcPolPar());
     445             :   }
     446             :   else
     447           0 :     throw(AipsError("Solver and SVC cannot synchronize parameters."));
     448             : 
     449             :   // Pars
     450             : 
     451           0 :   dpar().resize(nTotalPar());
     452           0 :   dpar()=0.0;
     453             : 
     454           0 :   lastCalPar().resize(nCalPar());
     455           0 :   dCalPar().reference(dpar()(IPosition(1,0),IPosition(1,nCalPar()-1)));
     456             : 
     457           0 :   if (svc().solvePol()) {
     458           0 :     lastSrcPar().resize(nSrcPar());
     459           0 :     dSrcPar().reference(dpar()(IPosition(1,nCalPar()),IPosition(1,nTotalPar()-1)));
     460             :   }
     461             :   else {
     462           0 :     lastSrcPar().resize();
     463           0 :     dSrcPar().resize();
     464             :   }
     465             : 
     466             :   // Gradient and Hessian
     467           0 :   grad().resize(nTotalPar());
     468           0 :   grad()=0.0;
     469             : 
     470           0 :   hess().resize(nTotalPar());
     471           0 :   hess()=0.0;
     472             : 
     473             :   // Levenberg-Marquardt factor
     474           0 :   lambda()=2.0;
     475             : 
     476             :   // Convergence anticipation
     477           0 :   cvrgcount_=0;
     478             : 
     479           0 : }
     480             : 
     481           0 : void VisCalSolver::residualate() {
     482             : 
     483           0 :   if (prtlev()>2) cout << "  VCS::residualate()" << endl;
     484             : 
     485             :   // Delegate to VisEquation
     486             :   //  ve().residuals(svb(),R(),Rflag());
     487             : 
     488             :   // For now, just use ve.diffResid, until we have
     489             :   //  implemented focuschan-aware trial corrupt in SVC
     490             :   //  (this will hurt performance a bit)
     491           0 :   ve().diffResiduals(svb(),R(),dR(),Rflg());
     492             : 
     493           0 : }
     494             : 
     495           0 : void VisCalSolver::residualate2() {
     496             : 
     497           0 :   if (prtlev()>2) cout << "  VCS::residualate()" << endl;
     498             : 
     499             :   // Delegate to VisEquation
     500             :   //  ve().residuals(svb(),R(),Rflag());
     501             : 
     502             :   // For now, just use ve.diffResid, until we have
     503             :   //  implemented focuschan-aware trial corrupt in SVC
     504             :   //  (this will hurt performance a bit)
     505             :   
     506           0 :   for (Int ibuf=0;ibuf<vbga().nBuf();++ibuf) 
     507           0 :     ve().diffResiduals(vbga()(ibuf));
     508           0 : }
     509             : 
     510           0 : void VisCalSolver::differentiate() {
     511             : 
     512           0 :   if (prtlev()>2) cout << "  VCS::differentiate()" << endl;
     513             : 
     514             :   // Delegate to VisEquation
     515           0 :   ve().diffResiduals(svb(),R(),dR(),Rflg());
     516             : 
     517             : 
     518           0 :   if (svc().solvePol()) {
     519             : 
     520             :     // Differentiate w.r.t source
     521           0 :     svc().diffSrc(svb(),dSrc());
     522             :   }
     523             : 
     524           0 :   if (prtlev()>6) {  // R, dR
     525           0 :     cout << "   R= " << R() << endl;
     526           0 :     cout << "   dR=" << dR() << endl;
     527             :   }
     528             : 
     529           0 : }
     530             : 
     531           0 : void VisCalSolver::differentiate2() {
     532             : 
     533           0 :   if (prtlev()>2) cout << "  VCS::differentiate(VBGA version)" << endl;
     534             : 
     535             :   // Delegate to VisEquation
     536           0 :   for (Int ibuf=0;ibuf<vbga().nBuf();++ibuf)
     537           0 :     ve().diffResiduals(vbga()(ibuf));
     538             : 
     539           0 :   if (svc().solvePol()) {
     540             :     //    throw(AipsError("solvePol not yet sorted w.r.t. VBGA."));
     541             :     // Differentiate w.r.t source
     542           0 :     svc().diffSrc(vbga()(0),dSrc());
     543             :   }
     544             : 
     545           0 : }
     546             : 
     547           0 : void VisCalSolver::chiSquare() {
     548             : 
     549           0 :   if (prtlev()>2) cout << "   VCS::chiSquare()" << endl;
     550             : 
     551             :   // NB: Assumes R() is up-to-date
     552             : 
     553             :   //  TBD: Review correctness of summing weights 
     554             :   //     inside the channel loop?
     555             : 
     556             :   // TBD: per-ant/bln chiSq?
     557             : 
     558             :   //  cout << "VCS::chiSquare: svc().focusChan() = " << svc().focusChan() << endl;
     559             : 
     560           0 :   chiSq()=0.0;
     561           0 :   chiSqV()=0.0;
     562           0 :   sumWt()=0.0;
     563           0 :   nWt()=0;
     564             : 
     565             :   // Shapes for iteration
     566           0 :   IPosition shR(R().shape());
     567           0 :   Int nCorr=shR(0);
     568           0 :   Int nChan=shR(1);
     569           0 :   Int nRow=shR(2);
     570             : 
     571           0 :   ArrayIterator<Bool>  flag(svb().flag(),1);        // fl(chan) by (row)
     572           0 :   ArrayIterator<Float> wtMat(svb().weightMat(),1);  // wt(corr) by (row)
     573           0 :   ArrayIterator<Complex> Rit(R(),1);                // R(corr)  by (chan,row)
     574             : 
     575           0 :   Bool*  flR = svb().flagRow().data();
     576             :   Bool*  fl;
     577             :   Float* wt;
     578             :   Complex *Rp;
     579             : 
     580           0 :   for (Int irow=0;irow<nRow;++irow) { 
     581           0 :     if (!*flR) {
     582             :       // This row's wt(corr), flag(chan)
     583           0 :       wt = wtMat.array().data(); 
     584             :       //      wt[1]=wt[2]=0.0;
     585           0 :       fl = flag.array().data() + svc().focusChan();
     586             :       // Register R for this row, 0th channel
     587           0 :       for (Int ich=0;ich<nChan;++ich) {
     588           0 :         if (!*fl) { 
     589             : 
     590           0 :           Rp = Rit.array().data();
     591           0 :           for (Int icorr=0;icorr<nCorr;++icorr) {
     592             : 
     593             :    /*
     594             :             if (svb().weightMat()(icorr,irow)>0.0) {
     595             :               cout << irow << " " << icorr << " "
     596             :                    << svb().weightMat()(icorr,irow) << " "
     597             :                    << *wt << " "
     598             :                    << R()(icorr,0,irow) << " "
     599             :                    << *Rp << " "
     600             :                    << &R()(icorr,0,irow) << " "
     601             :                    << Rp << " "
     602             :                    << Rp-&R()(icorr,0,irow) << "    "
     603             :                    << &R()(0,0,irow)-&R()(3,0,irow) << " "
     604             :                    << Rit.array().shape()
     605             :                    << endl;
     606             :             }
     607             :    */
     608           0 :             chiSq()+=Double( (*wt)*real((*Rp)*conj(*Rp)) );
     609             :             //      chiSq()+=Double( real((*Rp)*conj(*Rp)) );
     610           0 :             chiSqV()(icorr)+=Double( (*wt)*real((*Rp)*conj(*Rp)) );
     611           0 :             sumWt()+=Double(*wt);   // for each channel?!
     612             : 
     613           0 :             if (*wt>0.0) nWt()++;
     614             :             
     615             :             //Advance to next corr
     616           0 :             ++wt;
     617           0 :             ++Rp;
     618             :           }
     619             :           // Use same wt(corr) vectors for each channel
     620           0 :           wt-=nCorr;
     621             :         }
     622             :         // Advance to next channel
     623           0 :         Rit.next();
     624           0 :         ++fl;
     625             :       }
     626             :     }
     627             :     else 
     628             :       // Advance over flagged row!
     629           0 :       for (Int ich=0;ich<nChan;++ich) Rit.next();
     630             :     
     631             :     // Advance to next row
     632           0 :     ++flR;
     633           0 :     flag.next();
     634           0 :     wtMat.next();
     635             :   }
     636             : 
     637             : 
     638           0 : }
     639             : 
     640           0 : void VisCalSolver::chiSquare2() {
     641             : 
     642           0 :   if (prtlev()>2) cout << "   VCS::chiSquare(CVB version)" << endl;
     643             : 
     644             :   // NB: Assumes R() is up-to-date
     645             : 
     646             :   //  TBD: Review correctness of summing weights 
     647             :   //     inside the channel loop?
     648             : 
     649             :   // TBD: per-ant/bln chiSq?
     650             : 
     651             :   //  cout << "VCS::chiSquare: svc().focusChan() = " << svc().focusChan() << endl;
     652             : 
     653           0 :   chiSq()=0.0;
     654           0 :   chiSqV()=0.0;
     655           0 :   sumWt()=0.0;
     656           0 :   nWt()=0;
     657             : 
     658             :   // Loop over CVBs
     659           0 :   for (Int ibuf=0;ibuf<vbga().nBuf();++ibuf) {
     660             : 
     661             :     // Focus on one CVB at a time
     662           0 :     CalVisBuffer& cvb(vbga()(ibuf));
     663             : 
     664           0 :     R().reference(cvb.residuals());
     665             : 
     666             :     // Shapes for iteration
     667           0 :     IPosition shR(R().shape());
     668           0 :     Int nCorr=shR(0);
     669           0 :     Int nChan=shR(1);
     670           0 :     Int nRow=shR(2);
     671             :     
     672           0 :     ArrayIterator<Bool>  flag(cvb.residFlag(),1);        // fl(chan) by (row)
     673           0 :     ArrayIterator<Float> wtMat(cvb.weightMat(),1);  // wt(corr) by (row)
     674           0 :     ArrayIterator<Complex> Rit(R(),1);                // R(corr)  by (chan,row)
     675             :     
     676           0 :     Bool*  flR = cvb.flagRow().data();
     677             :     Bool*  fl;
     678             :     Float* wt;
     679             :     Complex *Rp;
     680             :     
     681           0 :     for (Int irow=0;irow<nRow;++irow) { 
     682           0 :       if (!*flR) {
     683             :         // This row's wt(corr), flag(chan)
     684           0 :         wt = wtMat.array().data(); 
     685           0 :         fl = flag.array().data();
     686             :         // Register R for this row, 0th channel
     687           0 :         for (Int ich=0;ich<nChan;++ich) {
     688           0 :           if (!*fl) { 
     689             :             
     690           0 :             Rp = Rit.array().data();
     691           0 :             for (Int icorr=0;icorr<nCorr;++icorr) {
     692             :               
     693           0 :               chiSq()+=Double( (*wt)*real((*Rp)*conj(*Rp)) );
     694           0 :               chiSqV()(icorr)+=Double( (*wt)*real((*Rp)*conj(*Rp)) );
     695           0 :               sumWt()+=Double(*wt);   // for each channel?!
     696             :               
     697           0 :               if (*wt>0.0) nWt()++;
     698             :               
     699             :               //Advance to next corr
     700           0 :               ++wt;
     701           0 :               ++Rp;
     702             :             }
     703             :             // Use same wt(corr) vectors for each channel
     704           0 :             wt-=nCorr;
     705             :           }
     706             :           // Advance to next channel
     707           0 :           Rit.next();
     708           0 :           ++fl;
     709             :         }
     710             :       }
     711             :       else 
     712             :         // Advance over flagged row!
     713           0 :         for (Int ich=0;ich<nChan;++ich) Rit.next();
     714             :       
     715             :       // Advance to next row
     716           0 :       ++flR;
     717           0 :       flag.next();
     718           0 :       wtMat.next();
     719             :     }
     720             :   } // ibuf
     721           0 : }
     722             : 
     723             : 
     724           0 : Bool VisCalSolver::converged() {
     725             : 
     726           0 :   if (prtlev()>2) cout << "    VCS::converged()" << endl;
     727             : 
     728             :   // Change in chi2
     729           0 :   dChiSq() = chiSq()-lastChiSq();
     730           0 :   Float fChiSq(dChiSq()/chiSq());
     731             : 
     732             :   //  if (prtlev()>0)
     733             :   //    cout << "chiSq: " << chiSq() << " " << chiSqV() << " " << lambda() << endl;
     734             : 
     735             :   // Consider convergence if chi2 decreases...
     736             :   //  if (dChiSq()<=0.0) {
     737           0 :   if (fChiSq<=0.001) {
     738             : 
     739             :     // ...and the change is small:
     740           0 :     if (abs(dChiSq()) < 0.1*chiSq()) {
     741           0 :       ++cvrgcount_;
     742             : 
     743             :       //      if (cvrgcount_==2) lambda()=2.0;
     744             : 
     745             :       // Four such steps we believe we have converged!
     746             :       //      if (cvrgcount_>3)
     747             :       //if (cvrgcount_>10)
     748           0 :       if (cvrgcount_>5)
     749           0 :         return true;
     750             :     }
     751             : 
     752           0 :     if (prtlev()>0)
     753           0 :       cout << "     Good: chiSq=" << chiSq()
     754           0 :            << " dChiSq=" << dChiSq()
     755           0 :            << " fChiSq=" << dChiSq()/chiSq()
     756           0 :            << " cvrgcnt=" << cvrgcount_
     757           0 :            << " lambda=" << lambda()
     758           0 :            << endl;
     759             :      
     760             :   }
     761             :   else {
     762             :     // (chi2 increased)
     763             : 
     764             :     // If a large increase, don't anticipate yet
     765           0 :     if (abs(dChiSq()) > 0.1*chiSq())
     766           0 :       cvrgcount_=0;
     767             :     else {
     768             :       // anticipate a little less if upward change is small
     769             :       //  TBD:  is this right?
     770           0 :       --cvrgcount_;
     771           0 :       cvrgcount_=max(cvrgcount_,0);  // never less than zero
     772             :     }
     773             : 
     774           0 :     if (prtlev()>0)
     775           0 :       cout << "     Bad:  chiSq=" << chiSq()
     776           0 :            << " dChiSq=" << dChiSq()
     777           0 :            << " fChiSq=" << dChiSq()/chiSq()
     778           0 :            << " cvrgcnt=" << cvrgcount_
     779           0 :            << " lambda=" << lambda()
     780           0 :            << endl;
     781             : 
     782             : 
     783             :   }
     784             : 
     785             :   // Not yet converged
     786           0 :   return false;
     787             : 
     788             : }
     789             : 
     790             : 
     791           0 : void VisCalSolver::accGradHess() {
     792             : 
     793           0 :   if (prtlev()>2) cout << "     VCS::accGradHess()" << endl;
     794             : 
     795           0 :   grad()=0.0;
     796           0 :   hess()=0.0;
     797             : 
     798           0 :   IPosition dRip(dR().shape());
     799             : 
     800           0 :   Int nRow(dRip(3));
     801           0 :   Int nChan(dRip(2));
     802           0 :   Int nPar(dRip(1));   // pars per antenna
     803           0 :   Int nCorr(dRip(0));
     804             : 
     805           0 :   ArrayIterator<Bool>  flag(svb().flag(),1);        // fl(chan) by (row)
     806           0 :   ArrayIterator<Float> wtMat(svb().weightMat(),1);  // wt(corr) by (row)
     807             : 
     808           0 :   ArrayIterator<Complex> Rit(R(),1);       // R(corr)       by (chan,row)
     809             :   
     810           0 :   Array<Complex> dR0, dR1;
     811             :   {
     812           0 :     ArrayIterator<Complex> dRit(dR(),4);  // dR(corr,par,chan,row) by (ant)
     813           0 :     dR0.reference(dRit.array());
     814           0 :     dRit.next();
     815           0 :     dR1.reference(dRit.array());
     816             :   }
     817           0 :   ArrayIterator<Complex> dR0it(dR0,2);   // dR0(corr,par) by (chan,row)
     818           0 :   ArrayIterator<Complex> dR1it(dR1,2);   // dR1(corr,par) by (chan,row)
     819             : 
     820           0 :   Bool*  flR = svb().flagRow().data();
     821             :   Bool*  fl;
     822             :   Float* wt;
     823           0 :   Int*   a1 = svb().antenna1().data();
     824           0 :   Int*   a2 = svb().antenna2().data();
     825             :   Complex *Rp;
     826             :   Complex *dR0p;
     827             :   Complex *dR1p;
     828             :   DComplex *G1;
     829             :   DComplex *G2;
     830             :   Double *H1;
     831             :   Double *H2;
     832             : 
     833             :   //  cout << "flag.array().data() = " << flag.array().data() << endl;
     834             :   //  cout << "VCS::accGradHess:  svc().focusChan()   = " << svc().focusChan() << endl;
     835             : 
     836           0 :   for (Int irow=0;irow<nRow;++irow) { 
     837           0 :     if (!*flR) {
     838             :       // Register grad, hess for ants in this baseline
     839           0 :       Int p1((*a1)*nPar);
     840           0 :       Int p2((*a2)*nPar);
     841           0 :       G1 = grad().data() + p1;
     842           0 :       G2 = grad().data() + p2;
     843           0 :       H1 = hess().data() + p1;
     844           0 :       H2 = hess().data() + p2;
     845             :       // This row's wt(corr), flag(chan)
     846           0 :       wt = wtMat.array().data(); 
     847           0 :       fl = flag.array().data() + svc().focusChan();
     848           0 :       for (Int ich=0;ich<nChan;++ich) {
     849           0 :         if (!*fl) { 
     850             : 
     851             :           // Do source bits, if necessary
     852           0 :           if (svc().solvePol()) {
     853           0 :             for (Int icorr=0;icorr<nCorr;++icorr) {
     854           0 :               Float swt=Vector<Float>(wtMat.array())(icorr);
     855             : 
     856           0 :               for (Int ispar=0;ispar<nSrcPar();++ispar) {
     857           0 :                 grad()(nCalPar()+ispar) += DComplex((swt)*2.0*real(dSrc()(IPosition(4,icorr,ich,irow,ispar))*
     858           0 :                                                                    conj(R()(icorr,ich,irow))));
     859           0 :                 hess()(nCalPar()+ispar) += Double((swt)*2.0*real(dSrc()(IPosition(4,icorr,ich,irow,ispar))*
     860           0 :                                                                  conj(dSrc()(IPosition(4,icorr,ich,irow,ispar)))));
     861             :               }
     862             :             }
     863             :           }
     864             : 
     865             :           // Register R,dR for this channel, row
     866           0 :           Rp = Rit.array().data();
     867           0 :           dR0p = dR0it.array().data();
     868           0 :           dR1p = dR1it.array().data();
     869             : 
     870             :    /*
     871             :           cout << "irow=" << irow << endl;
     872             :           cout << "R=" << Rit.array() << endl;
     873             :           cout << "dR0=" << dR0it.array()
     874             :                << "dR1=" << dR1it.array()
     875             :                << endl;
     876             :    */
     877             : 
     878           0 :           for (int ip=0;ip<nPar;++ip) {
     879             : 
     880           0 :             for (Int icorr=0;icorr<nCorr;++icorr) {
     881             : 
     882           0 :               (*G1) += DComplex( (*wt)*((*Rp)  *conj(*dR0p)) );
     883           0 :               (*G2) += DComplex( (*wt)*((*dR1p)*conj(*Rp)) );
     884           0 :               (*H1) +=   Double( (*wt)*real((*dR0p)*conj(*dR0p)) );
     885           0 :               (*H2) +=   Double( (*wt)*real((*dR1p)*conj(*dR1p)) );
     886             :      /*
     887             :               (*G1) += DComplex( (*Rp)  *conj(*dR0p) );
     888             :               (*G2) += DComplex( (*dR1p)*conj(*Rp) );
     889             :               (*H1) +=   Double( real((*dR0p)*conj(*dR0p)) );
     890             :               (*H2) +=   Double( real((*dR1p)*conj(*dR1p)) );
     891             :      */
     892             :     
     893             : 
     894             :               //Advance to next corr
     895           0 :               ++wt;
     896           0 :               ++Rp;
     897           0 :               ++dR0p;++dR1p;
     898             :             }
     899             :             // Advance to next par
     900           0 :             ++G1; ++G2;
     901           0 :             ++H1; ++H2;
     902             :             // Use same Rp(corr), wt(corr) vectors for each parameter
     903           0 :             Rp-=nCorr;
     904           0 :             wt-=nCorr;
     905             :           }
     906             :           // Accumulate to same grad(par) & hess(par) for each channel
     907           0 :           G1-=nPar; G2-=nPar;
     908           0 :           H1-=nPar; H2-=nPar;
     909             :         }
     910             :         // Advance to next channel
     911           0 :         ++fl;
     912           0 :         Rit.next();
     913           0 :         dR0it.next();
     914           0 :         dR1it.next();
     915             :       }
     916             :     } // !*flgR
     917             :     else {
     918             :       // Advance over flagged row
     919           0 :       for (Int ich=0;ich<nChan;++ich) {
     920           0 :         Rit.next();
     921           0 :         dR0it.next();
     922           0 :         dR1it.next();
     923             :       }
     924             :     }
     925             :     // Advance to next row
     926           0 :     ++flR;
     927           0 :     ++a1;++a2;
     928           0 :     flag.next();
     929           0 :     wtMat.next();
     930             :   }
     931             : 
     932           0 :   if (prtlev()>4) {  // grad, hess
     933           0 :     cout << "      grad= " << grad() << endl;
     934           0 :     cout << "      hess= " << hess() << endl;
     935             :   }
     936             : 
     937             : 
     938             : /*  
     939             :   // This is the slower way with array indexing
     940             :   for (Int irow=0;irow<nRow;++irow,++flR,++a1,++a2) {
     941             :     if (!*flR) {
     942             :       par1=(*a1)*nPar;
     943             :       par2=(*a2)*nPar;
     944             :       for (Int ich=0;ich<nChan;++ich,++fl) {
     945             :         if (!*fl) {
     946             :           for (int ip=0;ip<nPar;++ip) {
     947             :             for (Int icorr=0;icorr<nCorr;++icorr) {
     948             :               grad(par1+ip) += ( Double(wt(icorr,irow))*
     949             :                                  Double( R()(icorr,ich,irow  )*
     950             :                                          conj(dR()(icorr,ip,ich,irow,0)) ) );
     951             :               grad(par2+ip) += ( Double(wt(icorr,irow))*
     952             :                                  Double( dR()(icorr,ip,ich,irow,1)*
     953             :                                          conj(R()(icorr,ich,irow  )) ) );
     954             :               
     955             :               hess(par1+ip) += ( Double(wt(icorr,irow))*
     956             :                                  Double( dR()(icorr,ip,ich,irow,0)*
     957             :                                          conj(dR()(icorr,ip,ich,irow,0)) ) );
     958             :               hess(par2+ip) += ( Double(wt(icorr,irow))*
     959             :                                  Double( dR()(icorr,ip,ich,irow,1)*
     960             :                                          conj(dR()(icorr,ip,ich,irow,1)) ) );
     961             :             }
     962             :           }
     963             :         }
     964             :       }
     965             :     }
     966             :     else {
     967             :       // Advance over flagged row
     968             :       fl+=nChan;
     969             :     }
     970             : 
     971             :   }
     972             : */
     973             : 
     974             : 
     975           0 : }
     976             : 
     977             : 
     978           0 : void VisCalSolver::accGradHess2() {
     979             : 
     980           0 :   if (prtlev()>2) cout << "     VCS::accGradHess(CVB version)" << endl;
     981             : 
     982           0 :   grad()=0.0;
     983           0 :   hess()=0.0;
     984             : 
     985           0 :   for (Int ibuf=0;ibuf<vbga().nBuf();++ibuf) {
     986             : 
     987           0 :     CalVisBuffer& cvb(vbga()(ibuf));
     988             : 
     989           0 :     R().reference(cvb.residuals());
     990           0 :     dR().reference(cvb.diffResiduals());
     991             : 
     992             :     
     993           0 :     IPosition dRip(dR().shape());
     994             :     
     995           0 :     Int nRow(dRip(3));
     996           0 :     Int nChan(dRip(2));
     997           0 :     Int nPar(dRip(1));   // pars per antenna
     998           0 :     Int nCorr(dRip(0));
     999             :     
    1000           0 :     ArrayIterator<Bool>  flag(cvb.residFlag(),1);        // fl(chan) by (row)
    1001           0 :     ArrayIterator<Float> wtMat(cvb.weightMat(),1);  // wt(corr) by (row)
    1002             :     
    1003           0 :     ArrayIterator<Complex> Rit(R(),1);       // R(corr)       by (chan,row)
    1004             :     
    1005           0 :     Array<Complex> dR0, dR1;
    1006             :     {
    1007           0 :       ArrayIterator<Complex> dRit(dR(),4);  // dR(corr,par,chan,row) by (ant)
    1008           0 :       dR0.reference(dRit.array());
    1009           0 :       dRit.next();
    1010           0 :       dR1.reference(dRit.array());
    1011             :     }
    1012           0 :     ArrayIterator<Complex> dR0it(dR0,2);   // dR0(corr,par) by (chan,row)
    1013           0 :     ArrayIterator<Complex> dR1it(dR1,2);   // dR1(corr,par) by (chan,row)
    1014             :     
    1015           0 :     Bool*  flR = cvb.flagRow().data();
    1016             :     Bool*  fl;
    1017             :     Float* wt;
    1018           0 :     Int*   a1 = cvb.antenna1().data();
    1019           0 :     Int*   a2 = cvb.antenna2().data();
    1020             :     Complex *Rp;
    1021             :     Complex *dR0p;
    1022             :     Complex *dR1p;
    1023             :     DComplex *G1;
    1024             :     DComplex *G2;
    1025             :     Double *H1;
    1026             :     Double *H2;
    1027             : 
    1028           0 :     for (Int irow=0;irow<nRow;++irow) { 
    1029           0 :       if (!*flR) {
    1030             :         // Register grad, hess for ants in this baseline
    1031           0 :         Int p1((*a1)*nPar);
    1032           0 :         Int p2((*a2)*nPar);
    1033           0 :         G1 = grad().data() + p1;
    1034           0 :         G2 = grad().data() + p2;
    1035           0 :         H1 = hess().data() + p1;
    1036           0 :         H2 = hess().data() + p2;
    1037             :         // This row's wt(corr), flag(chan)
    1038           0 :         wt = wtMat.array().data(); 
    1039           0 :         fl = flag.array().data();
    1040           0 :         for (Int ich=0;ich<nChan;++ich) {
    1041           0 :           if (!*fl) { 
    1042             :             
    1043             :             // Do source bits, if necessary
    1044           0 :             if (svc().solvePol()) {
    1045           0 :               for (Int icorr=0;icorr<nCorr;++icorr) {
    1046           0 :                 Float swt=Vector<Float>(wtMat.array())(icorr);
    1047             :                 
    1048           0 :                 for (Int ispar=0;ispar<nSrcPar();++ispar) {
    1049           0 :                   grad()(nCalPar()+ispar) += DComplex((swt)*2.0*real(dSrc()(IPosition(4,icorr,ich,irow,ispar))*
    1050           0 :                                                                      conj(R()(icorr,ich,irow))));
    1051           0 :                   hess()(nCalPar()+ispar) += Double((swt)*2.0*real(dSrc()(IPosition(4,icorr,ich,irow,ispar))*
    1052           0 :                                                                    conj(dSrc()(IPosition(4,icorr,ich,irow,ispar)))));
    1053             :                 }
    1054             :               }
    1055             :             }
    1056             :             
    1057             :             // Register R,dR for this channel, row
    1058           0 :             Rp = Rit.array().data();
    1059           0 :             dR0p = dR0it.array().data();
    1060           0 :             dR1p = dR1it.array().data();
    1061             :             
    1062           0 :             for (int ip=0;ip<nPar;++ip) {
    1063             :               
    1064           0 :               for (Int icorr=0;icorr<nCorr;++icorr) {
    1065             :                 
    1066           0 :                 (*G1) += DComplex( (*wt)*((*Rp)  *conj(*dR0p)) );
    1067           0 :                 (*G2) += DComplex( (*wt)*((*dR1p)*conj(*Rp)) );
    1068           0 :                 (*H1) +=   Double( (*wt)*real((*dR0p)*conj(*dR0p)) );
    1069           0 :                 (*H2) +=   Double( (*wt)*real((*dR1p)*conj(*dR1p)) );
    1070             :                 
    1071             :                 //Advance to next corr
    1072           0 :                 ++wt;
    1073           0 :                 ++Rp;
    1074           0 :                 ++dR0p;++dR1p;
    1075             :               }
    1076             :               // Advance to next par
    1077           0 :               ++G1; ++G2;
    1078           0 :               ++H1; ++H2;
    1079             :               // Use same Rp(corr), wt(corr) vectors for each parameter
    1080           0 :               Rp-=nCorr;
    1081           0 :               wt-=nCorr;
    1082             :             }
    1083             :             // Accumulate to same grad(par) & hess(par) for each channel
    1084           0 :             G1-=nPar; G2-=nPar;
    1085           0 :             H1-=nPar; H2-=nPar;
    1086             :           }
    1087             :           // Advance to next channel
    1088           0 :           ++fl;
    1089           0 :           Rit.next();
    1090           0 :           dR0it.next();
    1091           0 :           dR1it.next();
    1092             :         }
    1093             :       } // !*flgR
    1094             :       else {
    1095             :         // Advance over flagged row
    1096           0 :         for (Int ich=0;ich<nChan;++ich) {
    1097           0 :           Rit.next();
    1098           0 :           dR0it.next();
    1099           0 :           dR1it.next();
    1100             :         }
    1101             :       }
    1102             :       // Advance to next row
    1103           0 :       ++flR;
    1104           0 :       ++a1;++a2;
    1105           0 :       flag.next();
    1106           0 :       wtMat.next();
    1107             :     }
    1108             :     
    1109           0 :     if (prtlev()>4) {  // grad, hess
    1110           0 :       cout << "      grad= " << grad() << endl;
    1111           0 :       cout << "      hess= " << hess() << endl;
    1112             :     }    
    1113             : 
    1114             :   } // ibuf
    1115           0 : }
    1116             : 
    1117           0 : void VisCalSolver::revert() {
    1118             : 
    1119           0 :   if (prtlev()>2) cout << "     VCS::revert()" << endl;
    1120             : 
    1121             :   // Recall the last decent parameter set
    1122             :   //  TBD: the OK flag?
    1123           0 :   par()=lastCalPar();
    1124           0 :   if (svc().solvePol())
    1125           0 :     srcPar()=lastSrcPar();
    1126           0 : }
    1127             : 
    1128           0 : void VisCalSolver::solveGradHess() {
    1129             : 
    1130           0 :   if (prtlev()>2) cout << "      VCS::solveGradHess()" << endl;
    1131             : 
    1132             :   // TBD: explicit option to avoid lmfact?
    1133             :   // TBD: pointer (or MaskedArray?) optimization?
    1134             : 
    1135           0 :   Double lmfact(1.0+lambda());
    1136             : 
    1137           0 :   lmfact=2.0;
    1138             : 
    1139           0 :   dpar()=Complex(0.0);
    1140           0 :   for (Int ipar=0; ipar<nCalPar(); ipar++) {
    1141           0 :     if ( parOK()(ipar) && hess()(ipar)!=0.0) {
    1142             :       // good hess for this par:
    1143           0 :       dpar()(ipar) = grad()(ipar)/hess()(ipar);
    1144           0 :       dpar()(ipar)/=lmfact;
    1145             :     }
    1146             :     else {
    1147           0 :       dpar()(ipar)=0.0; 
    1148           0 :       parOK()(ipar)=false;
    1149             :     }
    1150             :   }
    1151             :   
    1152             :   // Turn off source pol update for the moment
    1153           0 :   if (svc().solvePol() && false) 
    1154           0 :     for (Int ipar=nCalPar(); ipar<nTotalPar(); ipar++) {
    1155           0 :       if ( hess()(ipar)!=0.0) {
    1156             :         // good hess for this par:
    1157           0 :         dpar()(ipar) = grad()(ipar)/hess()(ipar);
    1158           0 :         dpar()(ipar)/=lmfact;
    1159             :       }
    1160             :       else {
    1161           0 :         dpar()(ipar)=0.0; 
    1162             :       }
    1163             :     }
    1164             : 
    1165             :   // Negate (so updatePar() can _add_)
    1166           0 :   dpar()*=Complex(-1.0f);
    1167             : 
    1168           0 : }
    1169             : 
    1170           0 : void VisCalSolver::updatePar() {
    1171             : 
    1172           0 :   if (prtlev()>2) cout << "       VCS::updatePar()" << endl;
    1173             : 
    1174             :   //  if (prtlev()>4) cout << "        old =" << par() << endl;
    1175             : 
    1176             :   //  if (prtlev()>4) cout << "        dpar=" << dpar() << endl;
    1177             : 
    1178             : 
    1179             :   //  cout << "dCalPar() = " << dCalPar() << endl;
    1180             :   //  cout << "dSrcPar() = " << dSrcPar() << endl;
    1181             : 
    1182             :   // Tell svc to update the par 
    1183             :   //   (permits svc() to condition the current solutions)
    1184           0 :   svc().updatePar(dCalPar(),dSrcPar());
    1185             : 
    1186           0 :   if (prtlev()>4) 
    1187           0 :     cout << "        new =" << endl
    1188           0 :          << "amp = " << amplitude(par()) << endl
    1189           0 :          << "pha = " << phase(par()) << endl;
    1190             : 
    1191           0 : }
    1192             : 
    1193             : 
    1194           0 : void VisCalSolver::optStepSize() {
    1195             : 
    1196           0 :   Vector<Double> x2(3,-999.0);
    1197           0 :   Float step(1.0);
    1198             :   
    1199             :   // Starting point is curr chiSq
    1200           0 :   x2(0)=chiSq();
    1201             : 
    1202             :   // take nominal step
    1203           0 :   par()+=dCalPar();  
    1204           0 :   if (svc().solvePol()) srcPar()+=dSrcPar();  
    1205           0 :   residualate();
    1206           0 :   chiSquare();
    1207           0 :   x2(1)=chiSq();
    1208             : 
    1209             :   // If nominal step is an improvement...
    1210           0 :   if (x2(1)<x2(0)) {
    1211             : 
    1212             :     // ...double step size until x2 starts increasing
    1213           0 :     par()=dCalPar(); par()*=Complex(2.0*step); par()+=lastCalPar();
    1214           0 :     if (svc().solvePol()) { srcPar()=dSrcPar(); srcPar()*=Complex(2.0*step); srcPar()+=lastSrcPar(); };
    1215           0 :     residualate();
    1216           0 :     chiSquare();
    1217           0 :     x2(2)=chiSq();
    1218             :     //    cout <<   "  down:    " << step << " " << x2-x2(0) << LogicalArray(x2>=x2(0)) <<endl;
    1219           0 :     while (x2(2)<x2(1)) {    //  && step<4.0) {
    1220           0 :       step*=2.0;
    1221           0 :       par()=dCalPar(); par()*=Complex(2.0*step); par()+=lastCalPar();
    1222           0 :       if (svc().solvePol()) { srcPar()=dSrcPar(); srcPar()*=Complex(2.0*step); srcPar()+=lastSrcPar(); };
    1223           0 :       residualate();
    1224           0 :       chiSquare();
    1225           0 :       x2(1)=x2(2);
    1226           0 :       x2(2)=chiSq();
    1227             :       //      cout << "  stretch: " << step << " " << x2-x2(0) << LogicalArray(x2>=x2(0)) <<endl;
    1228             : 
    1229             :     }
    1230             :   }
    1231             :   // else nominal step too big, so...
    1232             :   else {
    1233             : 
    1234             :     // ... contract by halves until we bracket a minimum
    1235           0 :     step*=0.5;
    1236           0 :     par()=dCalPar(); par()*=Complex(step); par()+=lastCalPar();
    1237           0 :     if (svc().solvePol()) {srcPar()=dSrcPar(); srcPar()*=Complex(step); srcPar()+=lastSrcPar();};
    1238           0 :     residualate();
    1239           0 :     chiSquare();
    1240           0 :     x2(2)=x2(1);
    1241           0 :     x2(1)=chiSq();
    1242             :     //    cout <<   "  up:       " << step << " " << x2-x2(0) << LogicalArray(x2>=x2(0)) <<endl;
    1243           0 :     while (x2(1)>x2(0)) { //  && step>0.125) {
    1244           0 :       step*=0.5;
    1245           0 :       par()=dCalPar(); par()*=Complex(step); par()+=lastCalPar();
    1246           0 :       if (svc().solvePol()) {srcPar()=dSrcPar(); srcPar()*=Complex(step); srcPar()+=lastSrcPar();};
    1247           0 :       residualate();
    1248           0 :       chiSquare();
    1249           0 :       x2(2)=x2(1);
    1250           0 :       x2(1)=chiSq();
    1251             :       //      cout << "  contract: " << step << " " << x2-x2(0) << LogicalArray(x2>=x2(0)) <<endl;
    1252             :     }
    1253             : 
    1254             :   }
    1255             : 
    1256             :   // At this point   x2(0) > x2(1) < x2(2), so 
    1257             :   //   calculate (quadratic) step optimization factor
    1258           0 :   Double optfactor(0.0);
    1259           0 :   Double optn(x2(2)-x2(1));
    1260           0 :   Double optd(x2(0)-2*x2(1)+x2(2));
    1261             :               
    1262           0 :   if (abs(optd)>0.0)
    1263           0 :     optfactor=Double(step)*(1.5-optn/optd);
    1264             :   
    1265             :   /*  
    1266             :     cout << "Optimization: " 
    1267             :        << step << " " 
    1268             :        << optfactor << " "
    1269             :        << x2 << " "
    1270             :        << "(" << min(amplitude(lastPar())) << ") "
    1271             :        << max(amplitude(dpar())/amplitude(lastPar()))*180.0/C::pi << " ";
    1272             :   */
    1273             : 
    1274           0 :   par()=lastCalPar();
    1275           0 :   srcPar()=lastSrcPar();
    1276             :   
    1277             :   // Adjust step by the optfactor
    1278           0 :   if (optfactor>0.0)
    1279           0 :     dpar()*=Complex(optfactor);
    1280             : 
    1281             :   /*
    1282             :   cout << max(amplitude(dpar())/amplitude(lastPar()))*180.0/C::pi
    1283             :        << endl;
    1284             :   */
    1285           0 : }
    1286             : 
    1287           0 : void VisCalSolver::optStepSize2() {
    1288             : 
    1289           0 :   Vector<Double> x2(3,-999.0);
    1290           0 :   Float step(1.0);
    1291             :   
    1292             :   // Starting point is curr chiSq
    1293           0 :   x2(0)=chiSq();
    1294             : 
    1295             :   // take nominal step
    1296           0 :   par()+=dCalPar();  
    1297           0 :   if (svc().solvePol()) srcPar()+=dSrcPar();  
    1298           0 :   residualate2();
    1299           0 :   chiSquare2();
    1300           0 :   x2(1)=chiSq();
    1301             : 
    1302             :   // If nominal step is an improvement...
    1303           0 :   if (x2(1)<x2(0)) {
    1304             : 
    1305             :     // ...double step size until x2 starts increasing
    1306           0 :     par()=dCalPar(); par()*=Complex(2.0*step); par()+=lastCalPar();
    1307           0 :     if (svc().solvePol()) { srcPar()=dSrcPar(); srcPar()*=Complex(2.0*step); srcPar()+=lastSrcPar(); };
    1308           0 :     residualate2();
    1309           0 :     chiSquare2();
    1310           0 :     x2(2)=chiSq();
    1311             :     //    cout <<   "  down:    " << step << " " << x2-x2(0) << LogicalArray(x2>=x2(0)) <<endl;
    1312           0 :     while (x2(2)<x2(1)) {    //  && step<4.0) {
    1313           0 :       step*=2.0;
    1314           0 :       par()=dCalPar(); par()*=Complex(2.0*step); par()+=lastCalPar();
    1315           0 :       if (svc().solvePol()) { srcPar()=dSrcPar(); srcPar()*=Complex(2.0*step); srcPar()+=lastSrcPar(); };
    1316           0 :       residualate2();
    1317           0 :       chiSquare2();
    1318           0 :       x2(1)=x2(2);
    1319           0 :       x2(2)=chiSq();
    1320             :       //      cout << "  stretch: " << step << " " << x2-x2(0) << LogicalArray(x2>=x2(0)) <<endl;
    1321             : 
    1322             :     }
    1323             :   }
    1324             :   // else nominal step too big, so...
    1325             :   else {
    1326             : 
    1327             :     // ... contract by halves until we bracket a minimum
    1328           0 :     step*=0.5;
    1329           0 :     par()=dCalPar(); par()*=Complex(step); par()+=lastCalPar();
    1330           0 :     if (svc().solvePol()) {srcPar()=dSrcPar(); srcPar()*=Complex(step); srcPar()+=lastSrcPar();};
    1331           0 :     residualate2();
    1332           0 :     chiSquare2();
    1333           0 :     x2(2)=x2(1);
    1334           0 :     x2(1)=chiSq();
    1335             :     //    cout <<   "  up:       " << step << " " << x2-x2(0) << LogicalArray(x2>=x2(0)) <<endl;
    1336           0 :     while (x2(1)>x2(0)) { //  && step>0.125) {
    1337           0 :       step*=0.5;
    1338           0 :       par()=dCalPar(); par()*=Complex(step); par()+=lastCalPar();
    1339           0 :       if (svc().solvePol()) {srcPar()=dSrcPar(); srcPar()*=Complex(step); srcPar()+=lastSrcPar();};
    1340           0 :       residualate2();
    1341           0 :       chiSquare2();
    1342           0 :       x2(2)=x2(1);
    1343           0 :       x2(1)=chiSq();
    1344             :       //      cout << "  contract: " << step << " " << x2-x2(0) << LogicalArray(x2>=x2(0)) <<endl;
    1345             :     }
    1346             : 
    1347             :   }
    1348             : 
    1349             :   // At this point   x2(0) > x2(1) < x2(2), so 
    1350             :   //   calculate (quadratic) step optimization factor
    1351           0 :   Double optfactor(0.0);
    1352           0 :   Double optn(x2(2)-x2(1));
    1353           0 :   Double optd(x2(0)-2*x2(1)+x2(2));
    1354             :               
    1355           0 :   if (abs(optd)>0.0)
    1356           0 :     optfactor=Double(step)*(1.5-optn/optd);
    1357             :   
    1358             :   /*  
    1359             :     cout << "Optimization: " 
    1360             :        << step << " " 
    1361             :        << optfactor << " "
    1362             :        << x2 << " "
    1363             :        << "(" << min(amplitude(lastPar())) << ") "
    1364             :        << max(amplitude(dpar())/amplitude(lastPar()))*180.0/C::pi << " ";
    1365             :   */
    1366             : 
    1367           0 :   par()=lastCalPar();
    1368           0 :   srcPar()=lastSrcPar();
    1369             :   
    1370             :   // Adjust step by the optfactor
    1371           0 :   if (optfactor>0.0)
    1372           0 :     dpar()*=Complex(optfactor);
    1373             : 
    1374             :   /*
    1375             :   cout << max(amplitude(dpar())/amplitude(lastPar()))*180.0/C::pi
    1376             :        << endl;
    1377             :   */
    1378           0 : }
    1379             : 
    1380           0 : void VisCalSolver::getErrors() {
    1381             : 
    1382             :   // Number of *REAL* dof
    1383             :   //  Int nDOF=2*(nWt()-ntrue(parOK()));  // !!!! this is zero for 3 antennas!
    1384           0 :   Int nDOF=max(2*(nWt()-ntrue(parOK())), 1u);
    1385             : 
    1386           0 :   Double k2=chiSq()/Double(nDOF);
    1387             : 
    1388           0 :   parErr()=0.0;
    1389             :   //  Vector<Double> snr(nTotalPar(),0.0);
    1390           0 :   for (Int i=0;i<nCalPar();++i) 
    1391           0 :     if (hess()(i)>0.0) {
    1392           0 :       parErr()(i)=1.0/sqrt(hess()(i)/k2/2.0);   // 2 is from def of Hess!
    1393             :       //      snr(i)=Double(abs(par()(i)))/errs(i);
    1394             :     }
    1395             : 
    1396             : 
    1397             :   if (false) {
    1398             : 
    1399             :     cout << "ChiSq  = " << chiSq() << endl;
    1400             :     cout << "ChiSqV = " << chiSqV() << endl;
    1401             :     cout << "sumWt  = " << sumWt() << endl;
    1402             :     cout << "nWt    = " << nWt()
    1403             :          << "; nTotalPar() = " << nTotalPar() 
    1404             :          << "; nParOK = " << ntrue(parOK())
    1405             :          << "; nDOF = " << nDOF 
    1406             :          << endl;
    1407             :     
    1408             :     cout << "rChiSq = " << k2 << endl;
    1409             :     cout << "max(dpar) = " << max(amplitude(dpar())) << endl;
    1410             :     cout << "Amplitudes = " << amplitude(par()) << endl;
    1411             :     cout << "Errors = " << mean(parErr()(parOK())) << endl;
    1412             :     
    1413             :   }
    1414           0 : }
    1415             : 
    1416             : 
    1417             : } //# NAMESPACE CASA - END
    1418             : 

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