LCOV - code coverage report
Current view: top level - synthesis/MeasurementEquations - IncCEMemModel.cc (source / functions) Hit Total Coverage
Test: ctest_coverage.info Lines: 0 337 0.0 %
Date: 2023-11-06 10:06:49 Functions: 0 24 0.0 %

          Line data    Source code
       1             : //# IncCEMemModel.cc:  this implements IncCEMemModel
       2             : //# Copyright (C) 1996,1997,1998,1999,2000,2001,2003
       3             : //# Associated Universities, Inc. Washington DC, USA.
       4             : //#
       5             : //# This library is free software; you can redistribute it and/or modify it
       6             : //# under the terms of the GNU Library General Public License as published by
       7             : //# the Free Software Foundation; either version 2 of the License, or (at your
       8             : //# option) any later version.
       9             : //#
      10             : //# This library is distributed in the hope that it will be useful, but WITHOUT
      11             : //# ANY WARRANTY; without even the implied warranty of MERCHANTABILITY or
      12             : //# FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU Library General Public
      13             : //# License for more details.
      14             : //#
      15             : //# You should have received a copy of the GNU Library General Public License
      16             : //# along with this library; if not, write to the Free Software Foundation,
      17             : //# Inc., 675 Massachusetts Ave, Cambridge, MA 02139, USA.
      18             : //#
      19             : //# Correspondence concerning AIPS++ should be addressed as follows:
      20             : //#        Internet email: aips2-request@nrao.edu.
      21             : //#        Postal address: AIPS++ Project Office
      22             : //#                        National Radio Astronomy Observatory
      23             : //#                        520 Edgemont Road
      24             : //#                        Charlottesville, VA 22903-2475 USA
      25             : //#
      26             : //# $Id$
      27             : 
      28             : #include <synthesis/MeasurementEquations/IncCEMemModel.h>
      29             : #include <synthesis/MeasurementEquations/CEMemProgress.h>
      30             : #include <synthesis/MeasurementEquations/LatConvEquation.h>
      31             : #include <casacore/casa/Arrays/IPosition.h>
      32             : #include <casacore/lattices/LEL/LatticeExpr.h>
      33             : #include <casacore/lattices/LEL/LatticeExprNode.h>
      34             : #include <casacore/lattices/Lattices/TiledLineStepper.h>
      35             : #include <casacore/lattices/Lattices/TempLattice.h>
      36             : #include <casacore/lattices/Lattices/LatticeIterator.h>
      37             : #include <casacore/casa/Arrays/Slice.h>
      38             : #include <casacore/casa/Arrays/Matrix.h>
      39             : #include <casacore/casa/Arrays/Vector.h>
      40             : #include <casacore/casa/Arrays/Array.h>
      41             : #include <casacore/casa/Arrays/ArrayError.h>
      42             : #include <casacore/casa/Arrays/ArrayMath.h>
      43             : #include <casacore/casa/Arrays/VectorIter.h>
      44             : #include <casacore/casa/Logging/LogOrigin.h>
      45             : #include <casacore/casa/BasicMath/Math.h>
      46             : #include <casacore/casa/Exceptions/Error.h>
      47             : #include <casacore/casa/Utilities/Assert.h>
      48             : #include <casacore/casa/System/PGPlotter.h>
      49             : #include <casacore/coordinates/Coordinates.h>
      50             : #include <iostream> 
      51             : #include <sstream>
      52             : 
      53             : 
      54             : using namespace casacore;
      55             : namespace casa { //# NAMESPACE CASA - BEGIN
      56             : 
      57             : //----------------------------------------------------------------------
      58           0 : IncCEMemModel::IncCEMemModel(IncEntropy &ent, 
      59             :                              Lattice<Float> & model,
      60             :                              Lattice<Float> & deltaModel,
      61             :                              uInt nIntegrations,
      62             :                              Float sigma,
      63             :                              Float targetFlux,
      64             :                              Bool useFluxConstraint,
      65             :                              Bool initializeModel,
      66           0 :                              Bool doImageplane) :
      67             :   itsEntropy_ptr(&ent),
      68             :   itsResidualEquation_ptr(0),
      69             :   itsModel_ptr(&model),
      70             :   itsDeltaModel_ptr(&deltaModel),
      71             :   itsPrior_ptr(0),
      72             :   itsMask_ptr(0),
      73             :   itsStep_ptr(0),
      74             :   itsResidual_ptr(0),
      75             :   itsInitializeModel(initializeModel),
      76             :   itsNumberIterations(nIntegrations),
      77             :   itsSigma(sigma),
      78             :   itsTargetFlux(targetFlux),
      79             :   itsQ(10.0),
      80             :   itsUseFluxConstraint(useFluxConstraint),
      81             :   itsDoImagePlane(doImageplane),
      82             :   itsThreshold0(0.0),
      83             :   itsThresholdSpeedup(0.0),
      84             :   itsAlpha(0.0),
      85             :   itsBeta(0.0),
      86             :   itsFlux(0.0),
      87             :   itsModelFlux(0.0),
      88             :   itsDeltaFlux(0.0),
      89             :   itsFirstIteration(0),
      90             :   itsChoose(false),
      91           0 :   itsLog(LogOrigin("IncCEMemModel", 
      92             :                    "IncCEMemModel(const Lattice<Float> & model)")),
      93           0 :   itsProgressPtr(0)
      94             : {
      95           0 :   initStuff();
      96           0 : };
      97             : 
      98             : //----------------------------------------------------------------------
      99           0 : IncCEMemModel::IncCEMemModel(IncEntropy &ent, 
     100             :                              Lattice<Float> & model,
     101             :                              Lattice<Float> & deltaModel,
     102             :                              Lattice<Float> & prior,
     103             :                              uInt nIntegrations,
     104             :                              Float sigma,
     105             :                              Float targetFlux,
     106             :                              Bool useFluxConstraint,
     107             :                              Bool initializeModel,
     108           0 :                              Bool doImageplane) :
     109             :   itsEntropy_ptr(&ent),
     110             :   itsResidualEquation_ptr(0),
     111             :   itsModel_ptr(&model),
     112             :   itsDeltaModel_ptr(&deltaModel),
     113             :   itsPrior_ptr(&prior),
     114             :   itsMask_ptr(0),
     115             :   itsStep_ptr(0),
     116             :   itsResidual_ptr(0),
     117             :   itsInitializeModel(initializeModel),
     118             :   itsNumberIterations(nIntegrations),
     119             :   itsSigma(sigma),
     120             :   itsTargetFlux(targetFlux),
     121             :   itsQ(10.0),
     122             :   itsUseFluxConstraint(useFluxConstraint),
     123             :   itsDoImagePlane(doImageplane),
     124             :   itsThreshold0(0.0),
     125             :   itsThresholdSpeedup(0.0),
     126             :   itsAlpha(0.0),
     127             :   itsBeta(0.0),
     128             :   itsFlux(0.0),
     129             :   itsModelFlux(0.0),
     130             :   itsDeltaFlux(0.0),
     131             :   itsFirstIteration(0),
     132             :   itsChoose(false),
     133           0 :   itsLog(LogOrigin("IncCEMemModel", 
     134             :                    "IncCEMemModel(const Lattice<Float> & model)")),
     135           0 :    itsProgressPtr(0)
     136             : {
     137           0 :   initStuff();
     138           0 : };
     139             : 
     140             : //----------------------------------------------------------------------
     141           0 : IncCEMemModel::IncCEMemModel(IncEntropy &ent, 
     142             :                        Lattice<Float> & model,
     143             :                        Lattice<Float> & deltaModel,
     144             :                        Lattice<Float> & prior,
     145             :                        Lattice<Float> & mask,
     146             :                        uInt nIntegrations,
     147             :                        Float sigma,
     148             :                        Float targetFlux,
     149             :                        Bool useFluxConstraint,
     150             :                        Bool initializeModel,
     151           0 :                        Bool doImageplane)
     152             :   :
     153             :   itsEntropy_ptr(&ent),
     154             :   itsResidualEquation_ptr(0),
     155             :   itsModel_ptr(&model),
     156             :   itsDeltaModel_ptr(&deltaModel),
     157             :   itsPrior_ptr(&prior),
     158             :   itsMask_ptr(&mask),
     159             :   itsStep_ptr(0),
     160             :   itsResidual_ptr(0),
     161             :   itsInitializeModel(initializeModel),
     162             :   itsNumberIterations(nIntegrations),
     163             :   itsSigma(sigma),
     164             :   itsTargetFlux(targetFlux),
     165             :   itsQ(10.0),
     166             :   itsUseFluxConstraint(useFluxConstraint),
     167             :   itsDoImagePlane(doImageplane),
     168             :   itsThreshold0(0.0),
     169             :   itsThresholdSpeedup(0.0),
     170             :   itsAlpha(0.0),
     171             :   itsBeta(0.0),
     172             :   itsFlux(0.0),
     173             :   itsModelFlux(0.0),
     174             :   itsDeltaFlux(0.0),
     175             :   itsFirstIteration(0),
     176             :   itsChoose(false), 
     177           0 :   itsLog(LogOrigin("IncCEMemModel", 
     178             :                    "IncCEMemModel(const Lattice<Float> & model)")),
     179           0 :   itsProgressPtr(0)
     180             : 
     181             : {
     182           0 :   initStuff();
     183           0 : };
     184             : 
     185             : //----------------------------------------------------------------------
     186           0 : IncCEMemModel::IncCEMemModel(IncEntropy &ent, 
     187             :                        Lattice<Float> & model,
     188             :                        Lattice<Float> & deltaModel,
     189             :                        uInt nIntegrations,
     190             :                        Lattice<Float> & mask,
     191             :                        Float sigma,
     192             :                        Float targetFlux,
     193             :                        Bool useFluxConstraint,
     194             :                        Bool initializeModel,
     195           0 :                        Bool doImageplane)
     196             :   :
     197             :   itsEntropy_ptr(&ent),
     198             :   itsResidualEquation_ptr(0),
     199             :   itsModel_ptr(&model),
     200             :   itsDeltaModel_ptr(&deltaModel),
     201             :   itsPrior_ptr(0),
     202             :   itsMask_ptr(&mask),
     203             :   itsStep_ptr(0),
     204             :   itsResidual_ptr(0),
     205             :   itsInitializeModel(initializeModel),
     206             :   itsNumberIterations(nIntegrations),
     207             :   itsSigma(sigma),
     208             :   itsTargetFlux(targetFlux),
     209             :   itsQ(10.0),
     210             :   itsUseFluxConstraint(useFluxConstraint),
     211             :   itsDoImagePlane(doImageplane),
     212             :   itsThreshold0(0.0),
     213             :   itsThresholdSpeedup(0.0),
     214             :   itsAlpha(0.0),
     215             :   itsBeta(0.0),
     216             :   itsFlux(0.0),
     217             :   itsModelFlux(0.0),
     218             :   itsDeltaFlux(0.0),
     219             :   itsFirstIteration(0),
     220             :   itsChoose(false), 
     221           0 :   itsLog(LogOrigin("IncCEMemModel", 
     222             :                    "IncCEMemModel(const Lattice<Float> & model)")),
     223           0 :   itsProgressPtr(0)
     224             : 
     225             : {
     226           0 :   initStuff();
     227           0 : };
     228             : 
     229             : 
     230             : //----------------------------------------------------------------------
     231           0 : IncCEMemModel::~IncCEMemModel()
     232             : {
     233           0 :   delete itsStep_ptr; itsStep_ptr=0;
     234           0 :   delete itsResidual_ptr; itsResidual_ptr=0;
     235           0 : };
     236             : 
     237             : 
     238             : 
     239             : //----------------------------------------------------------------------
     240           0 : void IncCEMemModel::setPrior(Lattice<Float> & prior)
     241             : {
     242           0 :   checkImages(itsModel_ptr, &prior); 
     243           0 :   itsPrior_ptr = &prior; 
     244           0 :   initStuff();
     245           0 : }
     246             : 
     247             : //----------------------------------------------------------------------
     248           0 : Float IncCEMemModel::getThreshold()
     249             : {
     250           0 :   if (itsThresholdSpeedup<= 0.0) {
     251           0 :     return itsThreshold0;
     252             :   } else {
     253           0 :     Float factor = pow(2.0, (Float)(itsIteration - itsFirstIteration)
     254           0 :                        / ((Float)(itsThresholdSpeedup)) );
     255           0 :     return (itsThreshold0 * factor);
     256             :   }
     257             : };
     258             : 
     259             : 
     260             : //----------------------------------------------------------------------
     261           0 : Bool IncCEMemModel::initStuff()
     262             : {
     263           0 :   checkImage(itsModel_ptr);
     264           0 :   checkImage(itsDeltaModel_ptr);
     265           0 :   checkImages(itsModel_ptr, itsDeltaModel_ptr);
     266             : 
     267             :   // initialize various parameters
     268             : 
     269           0 :   if (itsMask_ptr) {
     270           0 :     LatticeExprNode LEN = sum(*itsMask_ptr);
     271           0 :     itsNumberPixels = LEN.getFloat();
     272             :   } else {
     273           0 :     itsNumberPixels = itsModel_ptr->nelements();
     274             :   }
     275             : 
     276           0 :   formFlux();
     277             : 
     278           0 :   String entType;
     279           0 :   itsEntropy_ptr->entropyName(entType);
     280             : 
     281           0 :   Float clipVal = 1.0e-7;
     282           0 :   if (itsPrior_ptr != 0) {
     283           0 :     itsDefaultLevel = 0.0;
     284           0 :     if (entType == "ENTROPY") {
     285           0 :       Lattice<Float> &prior = *itsPrior_ptr;
     286           0 :       prior.copyData(  (LatticeExpr<Float>) (iif(prior < clipVal, clipVal, prior)) );     
     287             :     }
     288             :   } else {
     289           0 :     itsDefaultLevel = abs(itsTargetFlux) / itsNumberPixels;
     290             :   }
     291             : 
     292           0 :   Lattice<Float> &model = *itsModel_ptr;
     293           0 :   Lattice<Float> &delta = *itsDeltaModel_ptr;
     294           0 :   if (itsInitializeModel) {    
     295           0 :     if (itsFirstIteration == 0) {
     296           0 :       delta.set(itsDefaultLevel);
     297           0 :       if (entType == "ENTROPY") {
     298           0 :         delta.copyData( (LatticeExpr<Float>) (iif( (model+delta)<clipVal, (clipVal-model), delta)) );
     299             :       }
     300             :     } else {
     301           0 :       delta.set(0.0);
     302             :     }
     303             :   } else {
     304           0 :      if (entType == "ENTROPY") {
     305             :        // use the model passed in, but clip it to avoid negativity
     306           0 :        delta.copyData( (LatticeExpr<Float>) (iif((model+delta)<clipVal, (clipVal-model), delta)) );     
     307             :      }
     308             :   }
     309             : 
     310           0 :   applyMask( model );  // zero out masked pixels in model
     311             :    
     312           0 :   itsTolerance = 0.05;
     313           0 :   itsGain = 0.3;
     314           0 :   itsMaxNormGrad = 100.0;
     315             : 
     316           0 :   itsDoInit = true;
     317           0 :   Bool isOK = true;
     318             : 
     319             :   //Create temporary images
     320             : 
     321           0 :   if(itsStep_ptr) delete itsStep_ptr; itsStep_ptr=0;
     322           0 :   itsStep_ptr = new TempLattice<Float> (itsModel_ptr->shape(), 2);
     323           0 :   if(itsResidual_ptr) delete itsResidual_ptr; itsResidual_ptr=0;
     324           0 :   itsResidual_ptr = new TempLattice<Float> (itsModel_ptr->shape(), 2);
     325             : 
     326           0 :   if (itsStep_ptr &&  itsResidual_ptr) {
     327           0 :     itsStep_ptr->set(0.0);
     328           0 :     itsResidual_ptr->set(0.0);
     329             :   } else {
     330           0 :     isOK = false;
     331             :   }
     332             : 
     333             :   // We have been given an Entropy object, now we have to
     334             :   // tell it about US
     335           0 :   itsEntropy_ptr->setMemModel( *this );
     336             : 
     337           0 :   return isOK;
     338             : };
     339             : 
     340             : //----------------------------------------------------------------------
     341           0 : void IncCEMemModel::initializeAlphaBeta()
     342             : {
     343             :   // Note: in practice, this routine seems to never get called;
     344             :   // included for consistency with SDE MEM routine
     345           0 :   if (! itsUseFluxConstraint) {
     346           0 :     itsAlpha = max(0.0,  itsGDG(H,C)/ itsGDG(C,C) );
     347           0 :     itsBeta = 0.0;
     348             :   } else {
     349           0 :     Double det = itsGDG(C,C)*itsGDG(F,F) - itsGDG(C,F)*itsGDG(C,F);
     350           0 :     itsAlpha = (itsGDG(F,F)*itsGDG(H,C) - itsGDG(C,F)*itsGDG(H,F) )/det;
     351           0 :     itsBeta =  (itsGDG(C,C)*itsGDG(H,F) - itsGDG(C,F)*itsGDG(H,C) )/det;
     352             :   }
     353           0 : };
     354             : 
     355             : //----------------------------------------------------------------------
     356           0 : void IncCEMemModel::updateAlphaBeta()
     357             : {
     358             : 
     359             :   // code stolen from SDE's mem.f
     360           0 :   Double a = itsGDG(C,J)/itsGDG(C,C);
     361           0 :   Double b = square(a) - (itsGDG(J, J) - itsGain*itsLength)/ itsGDG(C, C);
     362             : 
     363             :   Double dAMax;
     364             :   Double dAMin;
     365             :   Double dBMax;
     366             :   Double dBMin;
     367             : 
     368           0 :   if (b > 0.0) {
     369           0 :     b = sqrt(b);
     370           0 :     dAMax = a + b;
     371           0 :     dAMin = a - b;
     372             :   } else {
     373           0 :     dAMax = 0.0;
     374           0 :     dAMin = 0.0;
     375             :   }
     376             : 
     377             :   Double dChisq;
     378             :   Double dAlpha;
     379             :   Double dBeta;
     380             :   Double dFlux;
     381             : 
     382           0 :   if ( ! itsUseFluxConstraint ) {
     383           0 :     dChisq =  itsChisq -  itsTargetChisq + itsGDG (C, J);
     384           0 :     dAlpha = dChisq/itsGDG(C, C);
     385             : 
     386           0 :     dAlpha = max(dAMin, min(dAMax, dAlpha));
     387           0 :     itsAlpha = max(0.0, itsAlpha + dAlpha);
     388             :   } else {
     389           0 :     a = itsGDG(F,J)/itsGDG(F,F);
     390           0 :     b = square(a) - (itsGDG(J, J) - itsGain*itsLength)/itsGDG(F,F);
     391           0 :     if ( b > 0.0) {
     392           0 :       b = sqrt((double)b);
     393           0 :       dBMax = a + b;
     394           0 :       dBMin = a - b;
     395             :     } else {
     396           0 :       dBMax = 0.0;
     397           0 :       dBMin = 0.0;
     398             :     }
     399             :     
     400           0 :     dChisq = itsChisq - itsTargetChisq + itsGDG(C, J);
     401           0 :     dFlux = itsFlux - itsTargetFlux +  itsGDG(F, J);
     402           0 :     Double det = itsGDG(C, C)*itsGDG(F, F) - square(itsGDG(F, C));
     403           0 :     dAlpha = (itsGDG(F, F)*dChisq - itsGDG(C, F)*dFlux)/det;
     404           0 :     dBeta =  (itsGDG(C, C)*dFlux  - itsGDG(C, F)*dChisq)/det;
     405             :     
     406           0 :     dAlpha = max(dAMin, min(dAMax, dAlpha));
     407           0 :     itsAlpha = max(0.0, itsAlpha + dAlpha);
     408           0 :     dBeta    = max(dBMin, min(dBMax, dBeta));
     409           0 :     itsBeta  = itsBeta + dBeta;
     410             :   }
     411             : 
     412           0 : };
     413             : 
     414             : 
     415             : 
     416             : //----------------------------------------------------------------------
     417           0 : void IncCEMemModel::changeAlphaBeta()
     418             : {
     419           0 :   formGDG();
     420           0 :   itsLength = itsGDG(H,H) + square(itsAlpha) * itsGDG(C,C) 
     421           0 :     + square(itsBeta) * itsGDG(F,F);
     422           0 :   if (itsAlpha == 0.0 && itsBeta == 0.0) {
     423           0 :     itsLength = itsGDG(F,F);
     424             :   }
     425           0 :   itsNormGrad = itsGDG(J,J) / itsLength;
     426           0 :   if (itsAlpha == 0.0) 
     427           0 :     itsNormGrad = 0.0;
     428           0 :   if (itsNormGrad < itsGain) {
     429           0 :     updateAlphaBeta();
     430             :   } else {
     431           0 :     initializeAlphaBeta();
     432             :   }
     433           0 : };
     434             : 
     435             : 
     436             : 
     437             : //----------------------------------------------------------------------
     438           0 : Bool IncCEMemModel::checkImage(const Lattice<Float> * /*im*/)
     439             : {
     440             :   // I guess we don't have anything to do
     441           0 :   return true;
     442             : };
     443             : 
     444             : 
     445             : 
     446             : //----------------------------------------------------------------------
     447           0 : Bool IncCEMemModel::checkImages(const Lattice<Float> *one, const Lattice<Float> *other)
     448             : {
     449           0 :   Bool isOK = true;
     450             : 
     451           0 :   for (uInt i = 0; i < one->ndim(); i++) {
     452           0 :     AlwaysAssert(one->shape()(i) == other->shape()(i), AipsError);
     453             :   }
     454           0 :   return isOK;
     455             : };
     456             : 
     457             : 
     458             : //----------------------------------------------------------------------
     459           0 : Bool IncCEMemModel::ok() 
     460             : {
     461           0 :   Bool isOK = true;
     462           0 :   if (!itsModel_ptr) {
     463           0 :     isOK = false;
     464           0 :   } else if (!itsDeltaModel_ptr) {
     465           0 :     isOK = false;
     466             :   } else {
     467           0 :     isOK = (checkImage(itsModel_ptr) && checkImage(itsDeltaModel_ptr));
     468           0 :     checkImages(itsModel_ptr, itsDeltaModel_ptr);
     469           0 :     if (itsPrior_ptr) {
     470           0 :       checkImages(itsModel_ptr, itsPrior_ptr);
     471             :     }
     472           0 :     if (itsMask_ptr) {
     473           0 :       checkImages(itsModel_ptr, itsMask_ptr);
     474             :     }
     475           0 :     if (itsStep_ptr) {
     476           0 :       checkImages(itsModel_ptr, itsStep_ptr);
     477             :     }
     478           0 :     if (itsResidual_ptr) {
     479           0 :       checkImages(itsModel_ptr, itsResidual_ptr);
     480             :     }
     481           0 :     if (! itsEntropy_ptr) {
     482           0 :       isOK = false;
     483             :     }
     484             : 
     485             :     // Also need to check state variables in the future!
     486             :   }
     487           0 :   return isOK;
     488             : };
     489             : 
     490           0 : void IncCEMemModel::setMask(Lattice<Float> & mask)
     491             : { 
     492           0 :   checkImages(itsModel_ptr, &mask); 
     493           0 :   itsMask_ptr = &mask;
     494           0 :   initStuff();
     495           0 : }
     496             : 
     497             : 
     498           0 : void IncCEMemModel::state()
     499             : {
     500           0 :    if (itsPrior_ptr == 0) {
     501           0 :     itsLog << "Using blank prior image" << LogIO::POST;
     502             :   } else {
     503           0 :     itsLog << "Using prior image "  << LogIO::POST;
     504             :   }
     505           0 :   if (itsMask_ptr != 0) {
     506           0 :     itsLog << "Using mask to restrict emission" << LogIO::POST;
     507             :   }
     508           0 : }
     509             : 
     510             : //----------------------------------------------------------------------
     511           0 : Bool IncCEMemModel::solve(ResidualEquation<Lattice<Float> >  & eqn) 
     512             : {
     513             : 
     514           0 :   itsResidualEquation_ptr = &eqn;
     515           0 :   Bool converged = false;
     516           0 :   Bool endNow = false;
     517           0 :   state();
     518             : 
     519           0 :   itsEntropy_ptr->infoBanner();
     520             : 
     521           0 :   for (itsIteration = itsFirstIteration;
     522           0 :        ( (itsIteration < itsNumberIterations) && !endNow);
     523           0 :        itsIteration++) {
     524           0 :     if (itsDoImagePlane) {
     525           0 :       itsTargetChisq = square(itsSigma) * itsNumberPixels;
     526             :     } else {
     527           0 :       itsTargetChisq = square(itsSigma) * itsNumberPixels / itsQ;
     528             :     }
     529             : 
     530           0 :     oneIteration();
     531             : 
     532           0 :     itsFit = sqrt((double)( itsChisq / itsTargetChisq) );
     533           0 :     itsAFit = max(itsFit, 1.0f) * 
     534           0 :       sqrt((double)( itsTargetChisq / itsNumberPixels) );
     535           0 :     itsEntropy_ptr->infoPerIteration(itsIteration);
     536             : 
     537           0 :     converged = itsEntropy_ptr->testConvergence();
     538           0 :     if (! converged && getThreshold() > 0.0) {
     539           0 :       converged = testConvergenceThreshold();
     540             :     }
     541             : 
     542           0 :     if (itsNormGrad > itsMaxNormGrad) {
     543           0 :       endNow = true;
     544           0 :       itsLog << " Excessive gradient: stopping now" << LogIO::EXCEPTION;
     545             :     }
     546             : 
     547           0 :     if (converged) {
     548           0 :       endNow = true;;
     549           0 :       itsLog << "Converged at iteration " << itsIteration+1 << LogIO::POST;
     550             :     }
     551             :   }
     552           0 :   if (!converged) {
     553           0 :     itsLog << "MEM failed to converge after " <<  itsNumberIterations+1 
     554           0 :            << " iterations" << LogIO::POST;
     555             :   }    
     556             : 
     557           0 :   formFlux();
     558           0 :   return converged;
     559             : };
     560             : 
     561           0 : Bool IncCEMemModel::testConvergenceThreshold()
     562             : { 
     563           0 :   Bool less = false; 
     564           0 :   if (getThreshold() > 0.0) {
     565           0 :    if (itsCurrentPeakResidual < getThreshold() ) {
     566           0 :      less = true;
     567             :    }
     568             :   }
     569           0 :   return less;
     570             : };
     571             : 
     572           0 : Bool IncCEMemModel::applyMask( Lattice<Float> & lat ) {
     573           0 :   if (itsMask_ptr) {
     574           0 :     LatticeExpr<Float> exp = ( (*itsMask_ptr) * (lat) );
     575           0 :     lat.copyData( exp );
     576           0 :     return true;
     577             :   } else {
     578           0 :     return false;
     579             :   }
     580             : };
     581             : 
     582             : 
     583           0 : void  IncCEMemModel::oneIteration()
     584             : {
     585           0 :   ok();
     586             : 
     587           0 :   if (itsDoInit) {
     588           0 :     itsDoInit = false;
     589             :     // passing *this reverts to the LinearModel from which we are derived
     590           0 :     if (itsMask_ptr) {
     591           0 :       itsResidualEquation_ptr->residual( *itsResidual_ptr, 
     592           0 :                                          itsChisq,
     593           0 :                                          *itsMask_ptr,
     594           0 :                                          *this);
     595             :     } else {
     596           0 :       itsResidualEquation_ptr->residual( *itsResidual_ptr, 
     597           0 :                                          itsChisq,
     598           0 :                                          *this);
     599             :     }
     600           0 :     if (!itsDoImagePlane) itsChisq /= itsQ;  
     601             : 
     602           0 :     if (itsAlpha == 0.0 )
     603           0 :       changeAlphaBeta();
     604             :   }
     605             : 
     606           0 :   calculateStep();
     607           0 :   relaxMin();
     608             :   
     609             :   // limit the step to less than the gain
     610           0 :   Float scale = 1.0;
     611           0 :   Float scalem = 1.0;
     612           0 :   if (itsNormGrad > 0.0)
     613           0 :     scalem = itsGain/itsNormGrad;
     614           0 :   scale = min(1.0f, scalem);
     615             : 
     616           0 :   takeStep(1.0, scale);
     617             : 
     618             :   // passing *this reverts to the LinearModel from which we are derived
     619           0 :   if (itsMask_ptr) {
     620           0 :     itsResidualEquation_ptr->residual( *itsResidual_ptr, 
     621           0 :                                        itsChisq,
     622           0 :                                        *itsMask_ptr,
     623           0 :                                        *this);
     624             :   } else {
     625           0 :       itsResidualEquation_ptr->residual( *itsResidual_ptr, 
     626           0 :                                          itsChisq,
     627           0 :                                          *this);
     628             :   }
     629           0 :   if (!itsDoImagePlane) itsChisq /= itsQ;  
     630             : 
     631           0 :   if (itsThreshold0 > 0.0) {
     632           0 :     LatticeExprNode LEN = max(*itsResidual_ptr);
     633           0 :     Float rmax = LEN.getFloat();
     634           0 :     LEN = min(*itsResidual_ptr);
     635           0 :     Float rmin = LEN.getFloat();
     636           0 :     itsCurrentPeakResidual =  max (abs(rmax), abs(rmin));
     637             :   }
     638             : 
     639             :   // form Gradient dot Step
     640           0 :   formGDS();
     641             :   
     642             : 
     643             :   // determine optimal step
     644           0 :   Double eps = 1.0;
     645           0 :   if (itsGradDotStep0 != itsGradDotStep1) 
     646           0 :     eps = itsGradDotStep0/(itsGradDotStep0-itsGradDotStep1);
     647           0 :   if (scale != 0.0f) eps = min(eps, (Double)(scalem/scale) );
     648           0 :   if (eps <= 0.0) {
     649           0 :     eps = 1.0;
     650           0 :     itsLog << LogIO::WARN << "Step is zero" << LogIO::POST;
     651             :   }
     652             :   
     653             :   // Step to optimum point
     654             :   
     655           0 :   if (abs(eps-1.0) > itsGain) {
     656           0 :     takeStep(1.0, scale*(eps-1.0));
     657             : 
     658             :     // passing *this reverts to the LinearModel from which we are derived
     659           0 :     if (itsMask_ptr) {
     660           0 :       itsResidualEquation_ptr->residual( *itsResidual_ptr, 
     661           0 :                                          itsChisq,
     662           0 :                                          *itsMask_ptr,
     663           0 :                                          *this);                                       
     664             :     } else {
     665           0 :       itsResidualEquation_ptr->residual( *itsResidual_ptr, 
     666           0 :                                          itsChisq,
     667           0 :                                          *this);                                       
     668             :     }
     669             : 
     670           0 :     if (!itsDoImagePlane) itsChisq /= itsQ;  
     671             : 
     672           0 :     if (itsThreshold0 > 0.0) {
     673           0 :       LatticeExprNode LEN = max(*itsResidual_ptr);
     674           0 :       Float rmax = LEN.getFloat();
     675           0 :       LEN = min(*itsResidual_ptr);
     676           0 :       Float rmin = LEN.getFloat();
     677           0 :       itsCurrentPeakResidual =  max (abs(rmax), abs(rmin));
     678             :     }    
     679             :   }
     680             : 
     681           0 :   formEntropy();
     682           0 :   formFlux();
     683             : 
     684             :   // readjust beam volume
     685           0 :   itsQ = itsQ*(1.0/max(0.5, min(2.0,eps))+1.0)/2.0;
     686             : 
     687           0 :   changeAlphaBeta();
     688           0 : };
     689             : 
     690             : 
     691             : 
     692             : //----------------------------------------------------------------------
     693           0 : void IncCEMemModel::calculateStep()
     694             : {
     695             :   
     696           0 :   formGDGStep();
     697             : 
     698           0 :   formFlux();
     699           0 :   itsGradDotStep0 = itsGDG(J,J);
     700           0 :   itsLength = itsGDG(H,H) + square(itsAlpha) * itsGDG(C,C) 
     701           0 :     + square(itsBeta) * itsGDG(F,F);
     702           0 :   if (itsLength <= 0.0) {
     703           0 :     itsLength = itsGDG(F,F);
     704             :   }
     705           0 :   itsNormGrad = itsGDG(J,J) / itsLength;
     706           0 : };
     707             : 
     708             : 
     709             : //----------------------------------------------------------------------
     710           0 : void IncCEMemModel::takeStep(Float wt1, Float wt2)
     711             : {
     712           0 :   Lattice<Float> &model = *itsModel_ptr;
     713           0 :   Lattice<Float> &delta = *itsDeltaModel_ptr;
     714           0 :   Lattice<Float> &step  = *itsStep_ptr;
     715           0 :   LatticeExprNode  node;
     716           0 :   String entType;
     717           0 :   itsEntropy_ptr->entropyName(entType);
     718           0 :   if (entType == "ENTROPY") {
     719             : 
     720           0 :     itsRequiredModelMin = max (itsRequiredModelMin, 1.0e-7);
     721             :     
     722           0 :     node = iif( (model + wt1*delta  + wt2*step) > itsRequiredModelMin,
     723           0 :                 (wt1*delta  + wt2*step),
     724           0 :                 itsRequiredModelMin - model);
     725           0 :     delta.copyData( (LatticeExpr<Float>)node);
     726           0 :   } else if (entType == "EMPTINESS") {
     727             : 
     728           0 :     delta.copyData( (LatticeExpr<Float>)( wt1*delta  + wt2*step ) );
     729             : 
     730             :   } else {
     731           0 :     cout << "UNKNOWN ENTROPY TYPE" << endl;
     732           0 :     AlwaysAssert( ((entType == "ENTROPY") || (entType == "EMPTINESS")),
     733             :                   AipsError);
     734             :   }
     735             : 
     736           0 :   applyMask( delta );
     737           0 : };
     738             : 
     739             : 
     740             : 
     741             : //----------------------------------------------------------------------
     742           0 : Float IncCEMemModel::formFlux()
     743             : {
     744           0 :   itsFlux = 0.0;
     745           0 :   itsModelFlux = 0.0;
     746           0 :   itsDeltaFlux = 0.0;
     747           0 :   itsModelMin =  1e+20;
     748           0 :   itsModelMax = -1e+20;
     749             : 
     750           0 :   Lattice<Float> &model = *itsModel_ptr;
     751           0 :   Lattice<Float> &delta = *itsDeltaModel_ptr;
     752           0 :   TiledLineStepper mtls(model.shape(), model.niceCursorShape(), 0);
     753           0 :   RO_LatticeIterator<Float> mod( model, mtls); 
     754           0 :   RO_LatticeIterator<Float> del( delta, mtls); 
     755           0 :   Float pixsum = 0.0;
     756             : 
     757           0 :   for (mod.reset(), del.reset(); !mod.atEnd(); mod++, del++) {
     758           0 :     for (uInt i=0;i<mod.vectorCursor().nelements();i++) {
     759           0 :       itsModelFlux +=  mod.vectorCursor()(i);
     760           0 :       itsDeltaFlux +=  del.vectorCursor()(i);
     761           0 :       pixsum = mod.vectorCursor()(i) + del.vectorCursor()(i);      
     762           0 :       if (pixsum > itsModelMax)
     763           0 :         itsModelMax = pixsum;
     764           0 :       if (pixsum < itsModelMin)
     765           0 :         itsModelMin = pixsum;
     766             :     }
     767             :   }
     768           0 :   itsFlux = itsDeltaFlux + itsModelFlux;
     769             : 
     770           0 :   return itsFlux;
     771             : };
     772             : 
     773             : 
     774             : 
     775             : } //# NAMESPACE CASA - END
     776             : 

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