LCOV - code coverage report
Current view: top level - synthesis/TransformMachines - SimpleComponentFTMachine.cc (source / functions) Hit Total Coverage
Test: ctest_coverage.info Lines: 72 183 39.3 %
Date: 2023-11-06 10:06:49 Functions: 2 4 50.0 %

          Line data    Source code
       1             : //# SimpleComponentFTMachine.cc: Implementation of SimpleComponentFTMachine class
       2             : //# Copyright (C) 1997,1998,1999,2000,2001
       3             : //# Associated Universities, Inc. Washington DC, USA.
       4             : //#
       5             : //# This library is free software; you can redistribute it and/or modify it
       6             : //# under the terms of the GNU Library General Public License as published by
       7             : //# the Free Software Foundation; either version 2 of the License, or (at your
       8             : //# option) any later version.
       9             : //#
      10             : //# This library is distributed in the hope that it will be useful, but WITHOUT
      11             : //# ANY WARRANTY; without even the implied warranty of MERCHANTABILITY or
      12             : //# FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU Library General Public
      13             : //# License for more details.
      14             : //#
      15             : //# You should have received a copy of the GNU Library General Public License
      16             : //# along with this library; if not, write to the Free Software Foundation,
      17             : //# Inc., 675 Massachusetts Ave, Cambridge, MA 02139, USA.
      18             : //#
      19             : //# Correspondence concerning AIPS++ should be addressed as follows:
      20             : //#        Internet email: aips2-request@nrao.edu.
      21             : //#        Postal address: AIPS++ Project Office
      22             : //#                        National Radio Astronomy Observatory
      23             : //#                        520 Edgemont Road
      24             : //#                        Charlottesville, VA 22903-2475 USA
      25             : //#
      26             : //# $Id$
      27             : 
      28             : #include <synthesis/TransformMachines/SimpleComponentFTMachine.h>
      29             : #include <casacore/scimath/Mathematics/RigidVector.h>
      30             : #include <components/ComponentModels/ComponentShape.h>
      31             : #include <components/ComponentModels/ComponentList.h>
      32             : #include <components/ComponentModels/ComponentType.h>
      33             : #include <components/ComponentModels/Flux.h>
      34             : #include <components/ComponentModels/SkyComponent.h>
      35             : #include <components/ComponentModels/SpectralModel.h>
      36             : #include <msvis/MSVis/VisBuffer.h>
      37             : #include <casacore/ms/MeasurementSets/MSColumns.h>
      38             : #include <casacore/casa/Arrays/ArrayMath.h>
      39             : #include <casacore/casa/Arrays/ArrayLogical.h>
      40             : #include <casacore/casa/Arrays/Cube.h>
      41             : #include <casacore/casa/Arrays/Matrix.h>
      42             : #include <casacore/casa/Arrays/Vector.h>
      43             : #include <casacore/casa/Arrays/IPosition.h>
      44             : #include <casacore/casa/BasicSL/Complex.h>
      45             : #include <casacore/casa/BasicSL/Constants.h>
      46             : #include <casacore/measures/Measures/UVWMachine.h>
      47             : #ifdef _OPENMP
      48             : #include <omp.h>
      49             : #endif
      50             : 
      51             : 
      52             : using namespace casacore;
      53             : namespace casa { //# NAMESPACE CASA - BEGIN
      54             : 
      55        5383 : void SimpleComponentFTMachine::get(VisBuffer& vb, SkyComponent& component,
      56             :                                    Int row)
      57             : {
      58             :   // If row is -1 then we pass through all rows
      59             :   uInt startRow, endRow;
      60        5383 :   if (row < 0) {
      61        5383 :     startRow = 0;
      62        5383 :     endRow = vb.nRow() - 1;
      63             :   } else {
      64           0 :     startRow = endRow = row;
      65             :   }
      66        5383 :   const uInt nRow = endRow - startRow + 1;
      67             :    
      68        5383 :   component.flux().convertUnit(Unit("Jy"));
      69             :    // Rotate the uvw
      70       10766 :   Matrix<Double> uvw(3, nRow);
      71       10766 :   Vector<Double> dphase(nRow);
      72             :   {
      73        5383 :     const Vector<RigidVector<Double,3> >& uvwBuff = vb.uvw();
      74      843336 :     for (uInt i = startRow, n = 0; i <= endRow; i++, n++) {
      75      837953 :       const RigidVector<Double,3>& uvwValue = uvwBuff(i);
      76             :       //NEGATING THE UV to be consitent with the GridFT::get
      77     2513859 :       for (Int idim = 0; idim < 2; idim++) {
      78     1675906 :         uvw(idim, n) = -uvwValue(idim);
      79             :       }
      80      837953 :       uvw(2, n) = uvwValue(2);
      81             :     }
      82        5383 :     rotateUVW(uvw, dphase, vb, component.shape().refDirection());
      83        5383 :     dphase *= -C::_2pi;
      84             :   }
      85        5383 :   uInt npol=vb.modelVisCube().shape()(0);
      86        5383 :   uInt nChan=vb.modelVisCube().shape()(1);
      87       10766 :   Cube<Complex> modelData;
      88        5383 :   modelData.reference(vb.modelVisCube());
      89       10766 :   Vector<Complex> visibility(4);
      90             :   //UNUSED: Double phase;
      91             :   //UNUSED: Double phaseMult;
      92        5383 :   Vector<Double>& frequency = vb.frequency();
      93       10766 :   Vector<Double> invLambda = frequency/C::c;
      94             :    
      95             :   // Find the offsets in polarization. 
      96       10766 :   Vector<Int> corrType = vb.corrType().copy();
      97             :   {
      98        5383 :     Int startPol = corrType(0);
      99        5383 :     if((startPol > 4) && (startPol < 9)) {
     100        3946 :       component.flux().convertPol(ComponentType::CIRCULAR);
     101        3946 :       corrType -= 5;
     102             :     }
     103        1437 :     else if((startPol > 8) && (startPol < 13)) {
     104        1437 :       component.flux().convertPol(ComponentType::LINEAR);
     105        1437 :       corrType -= 9;
     106             :     }
     107             :     else {
     108           0 :       component.flux().convertPol(ComponentType::STOKES);
     109           0 :       corrType -= startPol;
     110             :     }
     111             :   }
     112             : 
     113             : 
     114        5383 :   uInt npart=1;
     115             : #ifdef _OPENMP
     116        5383 :   npart= numthreads_p <0 ? omp_get_max_threads() : min(numthreads_p, omp_get_max_threads());
     117             : #endif
     118        5383 :   if((nRow/npart)==0) npart=1;
     119       10766 :   Block<Cube<DComplex> > dVisp(npart);
     120       10766 :   Vector<uInt> nRowp(npart);
     121       10766 :   Block<Matrix<Double> > uvwp(npart);
     122       10766 :   Block<SkyComponent> compp(npart);
     123       10766 :   Block<Int> startrow(npart);
     124        5383 :   startrow[0]=0;
     125             : 
     126        5383 :   nRowp.set(nRow/npart);
     127        5383 :   nRowp(npart-1) += nRow%npart;
     128        5383 :   Int sumrow=0;
     129       10766 :   Record lala;
     130       10766 :   String err;
     131        5383 :   component.toRecord(err, lala);
     132       10766 :   for (uInt k=0; k < npart; ++k){
     133        5383 :     dVisp[k].resize(4, nChan, nRowp(k));
     134        5383 :     uvwp[k].resize(3, nRowp(k));
     135        5383 :     uvwp[k]=uvw(IPosition(2,0, sumrow  ), IPosition(2, 2, sumrow+nRowp(k)-1));
     136        5383 :     compp[k].fromRecord(err, lala);
     137        5383 :     sumrow+=nRowp(k);
     138        5383 :     startrow[k]=0;
     139        5383 :     for (uInt j=0; j < k; ++j) startrow[k]+=nRowp(j);
     140             :   }
     141             : 
     142             :   
     143             : //#pragma omp parallel default(none)  firstprivate(npart) shared(frequency,dVisp, uvwp, compp) num_threads(npart)
     144        5383 : #pragma omp parallel firstprivate(npart) shared(dVisp, uvwp, compp) num_threads(npart)
     145             : {
     146             : 
     147             : #pragma omp for
     148             :   for (Int k=0; k < Int(npart); ++k){
     149             :     //Cube<DComplex> dVis(4, nChan, nRow);
     150             :     compp[k].visibility(dVisp[k], uvwp[k], frequency);
     151             :   }
     152             : 
     153             : }
     154             :   
     155             :   // Loop over all rows
     156        5383 :   sumrow=0;
     157             :   
     158             :   Bool isCopy;  
     159        5383 :   Complex *modData=modelData.getStorage(isCopy);
     160             :  
     161        5383 : #pragma omp parallel default(none)  firstprivate(npart, npol, nChan, modData, corrType, nRowp, dphase, invLambda) shared(startrow,  dVisp) num_threads(npart)
     162             :   {
     163             : #pragma omp for
     164             :     for (Int k = 0; k < Int(npart); ++k) {
     165             :     
     166             : 
     167             :     
     168             :       applyPhasor(k, startrow, nRowp, dphase, invLambda, npol, nChan, corrType, dVisp[k], modData);
     169             : 
     170             :     }
     171             :     
     172             :   }
     173             :   
     174        5383 :   modelData.putStorage(modData, isCopy);
     175             :   
     176        5383 : }
     177             : 
     178        5383 : void SimpleComponentFTMachine::applyPhasor(Int part, const Block<Int>& startrow, const Vector<uInt>& nRowp,  const Vector<Double>& dphase, const Vector<Double>& invLambda, const Int npol, const Int nchan, const Vector<Int>& corrType, const Cube<DComplex>& dVis, Complex*& modData){
     179             : 
     180             :   Int r;
     181             :   Int rowoff;
     182             :   Double phaseMult;
     183             :   Double phase;
     184      843336 :   for (uInt j=0; j< nRowp[part]; ++j){  
     185      837953 :     r=startrow[part]+j;
     186      837953 :     rowoff=r*nchan*npol; 
     187      837953 :     phaseMult = dphase(r);
     188    62974624 :     for (Int chn = 0; chn < nchan; chn++) {
     189    62136671 :       phase = phaseMult * invLambda(chn);
     190    62136671 :       Complex phasor(cos(phase), sin(phase));
     191   215845917 :       for (Int pol=0; pol < npol; pol++) {
     192   153709246 :         const DComplex& val = dVis(corrType(pol), chn, j);
     193   153709246 :         modData[rowoff+chn*npol+pol] = Complex(val.real(), val.imag()) * conj(phasor);
     194             :       }
     195             :     }
     196             :   }
     197             : 
     198             : 
     199             : 
     200        5383 : }
     201             : 
     202             : 
     203           0 : void SimpleComponentFTMachine::get(VisBuffer& vb, const ComponentList& compList,
     204             :                                    Int row)
     205             : {
     206             :   // If row is -1 then we pass through all rows
     207             :   uInt startRow, endRow;
     208           0 :   if (row < 0) {
     209           0 :     startRow = 0;
     210           0 :     endRow = vb.nRow() - 1;
     211             :   } else {
     212           0 :     startRow = endRow = row;
     213             :   }
     214           0 :   const uInt nRow = endRow - startRow + 1;
     215             :    
     216             :    // Rotate the uvw
     217           0 :   Matrix<Double> uvw0(3, nRow);
     218           0 :   Matrix<Double> uvw(3, nRow); 
     219           0 :   Vector<Double> dphase(nRow);
     220             : 
     221           0 :   const Vector<RigidVector<Double,3> >& uvwBuff = vb.uvw();
     222           0 :   for (uInt i = startRow, n = 0; i <= endRow; i++, n++) {
     223           0 :     const RigidVector<Double,3>& uvwValue = uvwBuff(i);
     224             :     //NEGATING the UV to be consitent with GridFT::get
     225           0 :     for (Int idim = 0; idim < 2; idim++) {
     226           0 :       uvw(idim, n) = -uvwValue(idim);
     227             :     }
     228           0 :     uvw(2, n) = uvwValue(2);
     229             :   }
     230           0 :   uvw0=uvw.copy();
     231             :   
     232           0 :   uInt ncomponents=compList.nelements();
     233           0 :   uInt npol=vb.modelVisCube().shape()(0);
     234           0 :   uInt nChan=vb.modelVisCube().shape()(1);
     235           0 :   Cube<Complex> modelData;
     236           0 :   modelData.reference(vb.modelVisCube());
     237           0 :   modelData=0.0;
     238             : 
     239           0 :   Vector<Complex> visibility(4);
     240             :   //UNUSED: Double phase;
     241             :   //UNUSED: Double phaseMult;
     242           0 :   Vector<Double> frequency;
     243           0 :   frequency= vb.frequency();
     244           0 :   Vector<Double> invLambda = frequency/C::c;
     245             :   // Find the offsets in polarization. 
     246           0 :   Vector<Int> corrTypeL = vb.corrType().copy();
     247           0 :   Vector<Int> corrTypeC = vb.corrType().copy();
     248           0 :   Vector<Int> corrType = vb.corrType().copy();
     249           0 :   corrTypeL -= 9;
     250           0 :   corrTypeC -= 5;
     251           0 :   Cube<DComplex> dVis(4, nChan, nRow);
     252           0 :   ComponentType::Polarisation poltype=ComponentType::CIRCULAR;
     253           0 :   if(anyGT(Int(Stokes::RR), vb.corrType())){
     254           0 :     poltype=ComponentType::STOKES;
     255           0 :     corrType = vb.corrType()-1;
     256             :   }
     257           0 :   else if(vb.polFrame()==MSIter::Linear) {
     258           0 :     poltype=ComponentType::LINEAR;
     259           0 :     corrType = corrTypeL;
     260             :     } else {
     261           0 :     poltype=ComponentType::CIRCULAR;
     262           0 :     corrType = corrTypeC;
     263             :   }
     264             : 
     265           0 :  uInt npart=1;
     266             : #ifdef _OPENMP
     267           0 :  npart= numthreads_p <0 ? omp_get_max_threads() : min(numthreads_p, omp_get_max_threads());
     268             : #endif
     269             : 
     270             : 
     271             : 
     272           0 :   if((nRow/npart)==0) npart=1;
     273           0 :   Block<Cube<DComplex> > dVisp(npart);
     274           0 :   Vector<uInt> nRowp(npart);
     275           0 :   Block<Matrix<Double> > uvwp(npart);
     276           0 :   Block<ComponentList> compp(npart);
     277           0 :   Block<MeasFrame> mFramep(npart);
     278           0 :   Block<MDirection> mDir(npart);
     279           0 :   Block<uInt> startrow(npart);
     280             : 
     281           0 :   nRowp.set(nRow/npart);
     282           0 :   nRowp(npart-1) += nRow%npart;
     283             : 
     284             :   
     285           0 :   Block<Vector<Double> > dphasecomp(ncomponents);
     286           0 :   Block<Matrix<Double> > uvwcomp(ncomponents);
     287           0 :   Block<Block<Vector<Double> > > dphasecomps(npart);
     288           0 :   Block<Block<Matrix<Double> > > uvwcomps(npart);
     289           0 :   for (uInt jj=0; jj < npart; ++jj){
     290           0 :     dphasecomps[jj].resize(ncomponents);
     291           0 :     uvwcomps[jj].resize(ncomponents);
     292             :   }
     293             :   ///Have to do this in one thread as MeasFrame and thus uvwmachine is not thread safe
     294           0 :   for (uInt k=0; k < ncomponents; ++k){
     295           0 :     uvwcomp[k]=uvw;
     296           0 :     dphasecomp[k].resize(nRow);
     297           0 :     rotateUVW(uvwcomp[k], dphasecomp[k],  vb, compList.component(k).shape().refDirection());
     298           0 :     dphasecomp[k] *= -C::_2pi;
     299           0 :     Int sumrow=0;
     300           0 :     for (uInt jj=0; jj < npart; ++jj){
     301           0 :       dphasecomps[jj][k]=dphasecomp[k](IPosition(1,sumrow), IPosition(1, sumrow+nRowp(jj)-1));
     302           0 :       uvwcomps[jj][k]=uvwcomp[k](IPosition(2,0, sumrow  ), IPosition(2, 2, sumrow+nRowp(jj)-1));
     303           0 :       sumrow+=nRowp(jj);
     304             :     }
     305             :    
     306             :   }
     307             : 
     308             : 
     309             : 
     310             :   //UNUSED: Int sumrow=0;
     311           0 :   Record lala;
     312           0 :   String err;
     313           0 :   compList.toRecord(err, lala);
     314           0 :   for (uInt k=0; k < npart; ++k){
     315           0 :     compp[k].fromRecord(err, lala);
     316           0 :     startrow[k]=0;
     317           0 :     for (uInt j=0; j < k; ++j) startrow[k]+=nRowp(j);
     318             :   }
     319             :   Bool isCopy;
     320           0 :   Complex *modData=modelData.getStorage(isCopy);
     321           0 :   MDirection dataMDir=vb.phaseCenter(phaseCenterTime_p);
     322             : 
     323           0 : #pragma omp parallel default(none)  firstprivate(npart, npol, nChan, modData, corrType, nRowp,  invLambda, frequency, poltype) shared(startrow, compp, uvwcomps, dphasecomps) num_threads(npart)
     324             :   {
     325             : #pragma omp for
     326             : 
     327             :     for (Int k=0; k < Int(npart); ++k){
     328             : 
     329             :     predictVis(modData, invLambda, frequency, compp[k],  poltype, corrType, 
     330             :                startrow[k], nRowp[k], nChan, npol, uvwcomps[k], dphasecomps[k]);
     331             : 
     332             :   }
     333             : 
     334             :   
     335             :   }
     336           0 :   modelData.putStorage(modData, isCopy);
     337             :  
     338           0 : }
     339             : 
     340             : 
     341           0 :   void SimpleComponentFTMachine::predictVis(Complex*& modData, const Vector<Double>& invLambda, 
     342             :                                             const Vector<Double>& frequency, const ComponentList& compList,   
     343             :                                             ComponentType::Polarisation poltype, const Vector<Int>& corrType, 
     344             :                                             const uInt startrow, const uInt nrows, const uInt nchan, const uInt npol, const Block<Matrix<Double> > & uvwcomp, const Block<Vector<Double> > & dphasecomp){
     345           0 :     Cube<DComplex> dVis(4, nchan, nrows);
     346           0 :     uInt ncomponents=compList.nelements();
     347           0 :     Vector<Double> dphase(nrows);
     348             :     
     349           0 :     for (uInt icomp=0;icomp<ncomponents; ++icomp) {
     350           0 :       SkyComponent component=compList.component(icomp);
     351           0 :       component.flux().convertUnit(Unit("Jy"));
     352           0 :       component.flux().convertPol(poltype);
     353           0 :       MDirection compdir=component.shape().refDirection();
     354           0 :       Vector<Double> thisRow(3);
     355           0 :       thisRow=0.0;
     356             :       //UNUSED: uInt i;
     357           0 :       Matrix<Double> uvw;
     358           0 :       uvw=uvwcomp[icomp];
     359           0 :       Vector<Double> dphase;
     360           0 :       dphase=dphasecomp[icomp];
     361           0 :       component.visibility(dVis, uvw, frequency);
     362             :       Double phaseMult;
     363             :       Double phase;
     364             :       uInt realrow;
     365             :       //// Loop over all rows
     366           0 :       for (uInt r = 0; r < nrows ; r++) {
     367           0 :         phaseMult = dphase(r);
     368           0 :         realrow=r+startrow;
     369           0 :         for (uInt chn = 0; chn < nchan; chn++) {
     370           0 :           phase = phaseMult * invLambda(chn);   
     371           0 :           Complex phasor(cos(phase), sin(phase));
     372           0 :           for (uInt pol=0; pol < npol; pol++) {
     373           0 :             const DComplex& val = dVis(corrType(pol), chn, r);
     374           0 :             modData[realrow*npol*nchan+chn*npol + pol] += Complex(val.real(), val.imag()) * conj(phasor);
     375             :           }
     376             :         }
     377             :       }
     378             : 
     379             : 
     380             :     }
     381             :     
     382           0 :   }  
     383             : 
     384             : 
     385             : 
     386             : } //# NAMESPACE CASA - END
     387             : 

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